Un capo della polizia che accoglie un bambino che trova vicino al luogo di un misterioso incidente che non ha memoria di ciò che è accaduto.

Mentre Jo e Chris tentano di identificare le forze sinistre che stanno inseguendo Piper, un uomo misterioso ostacola la loro ricerca e porta il pericolo troppo vicino a casa. Nel frattempo, Abby lavora con Piper per attivare la sua memoria perduta, mentre Jo fa un patto intelligente con Benny per garantire la futura sicurezza di Piper.

Una misteriosa malattia si impadronisce di Piper, mentre Jo e Benny indagano su un potente magnate della tecnologia, Richard Kindred. Mentre la salute di Piper si deteriora, Jo valuta di accettare l'aiuto da una fonte sconosciuta. Nel frattempo, Alex lavora per decifrare un codice di radiofrequenza dall'incidente aereo di Piper e Ed ha un appuntamento di follow-up in oncologia.

Dopo aver appreso di più sulle origini di Piper, Jo lotta con la decisione di proteggerla. Benny chiede a un amico di violare i file segreti di Kindred e Chris si scontra con un informatore testardo che è stato assegnato a proteggere.

Jo e Benny indagano sulla morte dell'ex socio in affari di Kindred. Nel frattempo, Mia e Piper sperimentano i poteri di Piper e Alex si confronta con Ed sulla sua salute.

Jo e Chris corrono a cercare Piper prima che venga messa in pericolo. Nel frattempo, Jo affronta nuove sfide a casa dopo aver tradito la fiducia di Alex ed Ed.

L'FBI arriva a Southold, complicando gli sforzi di Jo per trovare Emily. Nel frattempo, Alex e Piper cercano risposte durante un viaggio e la famiglia festeggia il compleanno di Mia.

Jo e Chris devono eludere l'FBI mentre indagano su un gruppo inafferrabile di cyber-terroristi. Ed si è presentato con un trattamento contro il cancro che sembra troppo bello per essere vero, e il tentativo di una donna misteriosa di raggiungere Piper mette in pericolo l'intera famiglia Evans.

Dopo mesi di vicoli ciechi, la famiglia Evans riceve informazioni che potrebbero finalmente condurli a Piper; Ed aiuta Mia mentre cerca di inviare un messaggio a Piper; Alex e Chris si imbattono in una misteriosa spedizione nel porto.

Jo e Brooks mettono insieme una squadra improbabile mentre cercano di comunicare con Piper. Nel frattempo, Piper è intenzionata a salvare Benny dalla misteriosa missione di Helen e Alex riceve un'offerta che cambia la vita.

Jo fa un accordo ad alto rischio per abbattere Helen e tenere Piper al sicuro. Nel frattempo, Helen tenta di replicare i poteri di Piper per se stessa e Benny fa fatica a riconquistare la fiducia di Jo prima che sia troppo tardi.

Nel finale di stagione, Jo e Brooks sono in pericolo e Piper è determinata ad aiutare. Con il misterioso piano di Helen quasi realizzato, Piper recluta una squadra inaspettata di alleati per trovarli prima che sia troppo tardi.