曾經有龍族棲息，現在是人族繁衍之地的西耶薩西馬大陸。在魔術士培養機關“牙之塔”生活的少年·奇利男謝洛，為了尋找變身龍形怪物並失踪如姐姐般的·阿莎莉，而踏上了旅程。自那之後過了五年，男子改名為歐菲，做著非法放貸的營生。有一天，歐菲與地人族博魯坎，一同對艾巴拉斯汀家大小姐實施結婚欺詐。

歐菲終於與化身龍形怪物的阿莎莉見面，然而卻讓她逃走了。歐菲從曾經的師父·查爾德曼處得知五年前阿莎莉變身龍形怪物的原因。是因為使用了古代遺產·巴魯多安德魯斯之劍的魔術實驗遭遇失敗而起。為了消滅阿莎莉而前往追踪的查爾德曼等人，與歐菲同行。歐菲下定決心，就算拼上性命，也要保護阿莎莉。

五年前，歐菲以奇利男謝洛之名，在“牙之塔”修行。牙之塔的教師·查爾德曼指導的查爾德曼教室裡，有7名學生。奇利男謝洛、哈帝亞、科米庫隆、阿莎莉、蕾蒂莎、伏爾特、克爾根七人。有一天，奇利男謝洛和阿莎莉去一處廢村掃墓。突然出現的襲擊者，宣稱自己劫走了阿莎莉。

歐菲和中途加入的同行者克麗奧、馬吉克一起，向著牙之塔所在的塔弗雷姆市前進。一行人在途中，穿過大森林芬利爾之森。為了尋找食物，馬吉克在此遇到了巫女菲耶娜。附近有龍族信仰者的隱鄉“偉大的心臟”，馬吉克被居民們抓住了。為了救助馬吉克，歐菲與教祖麥克杜加爾對峙，並被逼入絕境……

與麥克杜加爾對峙的歐菲面前，突然出現了深淵龍族。歐菲被深淵龍族的魔術擊中，但在菲耶娜的治愈之力下得救。明天，麥克杜加爾就要前往龍族的聖域，為了這個目的，他要犧牲菲耶娜。馬吉克想要拯救菲耶娜。菲耶娜告知歐菲等人，讓他們逃離隱鄉……

歐菲為了拯救菲耶娜，要打倒麥克杜加爾。麥克杜加爾因為在基姆拉克教會發生的意外，要去龍族聖域獲得力量。深淵龍族的大群逼向隱鄉。因為麥克杜加爾和村民們觸犯了進入深淵龍族聖域的禁忌，深淵龍族要消滅他們。於是歐菲便打算阻止深淵龍族……

深淵龍族之子雷奇加入了歐菲一行人。途中，一行人遭遇神秘暗殺者襲擊。暗殺者的臉，和過去的歐菲，奇利男謝洛一模一樣。歐菲和義姐蕾蒂莎再會，一行人到達了牙之塔所在的塔弗雷姆市。城中發生了牙之塔長老們被暗殺的事件。歐菲等人入住蕾蒂莎宅邸的當晚，在歐菲面前出現的暗殺者，竟自稱為奇利男謝洛。

蕾蒂莎回憶起了和奇利男謝洛等人，在牙之塔時代的過去。奇利男謝洛和阿莎莉消失後的五年間，蕾蒂莎一直在等待他們歸來。蕾蒂莎將自己的心聲告訴歐菲。這時，收到了克麗奧被劫走的消息。歐菲為了救克麗奧，前往暗殺者所在的查爾德曼宅邸。

潛入查爾德曼宅邸的歐菲，開始與暗殺者的戰鬥。這時，暗殺者的身份終於揭開，他是天人族的遺產，殺人人形，是阿莎莉為了完成自己理想中的暗殺者，將其變化的產物。阿莎莉通過讓歐菲與和奇利男謝洛相似的人形戰鬥，企圖讓他變回原來的奇利男謝洛。歐菲通過人形，開始面對過去的自己。

在查爾德曼宅邸的戰鬥中負傷的歐菲，回到蕾蒂莎宅邸休憩。夜裡，歐菲被入侵宅邸的不明人物襲擊。想要變強的馬吉克，決定加入牙之塔。在牙之塔中，歐菲與曾經的師父，掌握牙之塔實權暗中行動的教師沃爾再會。歐菲告誡他不要對自己的伙伴下手……

馬吉克完成了入門牙之塔的申請。歐菲等人回到了蕾蒂莎宅邸，克麗奧卻被不明人物襲擊。追踪襲擊者的蕾蒂莎，遭遇了暗算。當晚，阿莎莉出現在歐菲面前，告訴他沃爾一派正在尋找本應在查爾德曼手中的“世界書”，查爾德曼教室的成員都被盯上了。歐菲為了主動出擊，前往了沃爾等人所在的牙之塔。

潛入牙之塔的歐菲等人，與等候已久的沃爾·卡連的部下們展開戰鬥。戰勝了敵人的歐菲與沃爾·卡連對峙。而後在伏爾特和阿莎莉的幫助，逮捕了沃爾一派，成功讓他接受審判。阿莎莉得到了原本在查爾德曼手上的“世界書”，並告訴歐菲接下來要去基姆拉克教的總部所在的基姆拉克市……