타라크는 남성으로만 구성된 국가로, 그 사회는 엄격한 계급제도로 이루어져 있다. 노동계급인 3등민인 히비키는 인간형 전투기인 야만형 무격기 제조 공장에서 부품 제작에 종사하고 있었는데....

히비키 일행은 이카즈치의 제어 시스템인 팍시스 플러그마에서 흘러나온 결정체에 휩싸인다. 빛의 홍수 속에서 히비키는 전투기가 빔 캐논을 발사하고, 착탄 직전의 우주 어뢰 무라마사를 폭발시키는 것을 목격한다.

히비키의 야만형과 디타의 드레드가 합쳐진 수정의 거인 반드레드 디타의 활약으로 갑작스럽게 공격해 온 미지의 적을 물리쳤지만, 이카즈치 함내의 대부분은 수정체로 뒤덮여 버렸다.

메제르와 타라크에 위기가 닥친 것을 알게 된 히비키 일행은 각자의 모성을 향해 통신 포드를 보내기로 한다. 하지만 또다시 적의 공격이 시작되고, 발사된 포드는 격추되고 만다.

닐 버나로 이름을 바꾼 이카즈치의 전방에 소행성이 나타난다. 행성 표면의 열원 반응을 확인한 브리지에서는 적의 '추수' 작전에 대한 정보를 얻기 위해 긴장감 속에 관측을 계속하고 있었다.

전투 중 아군을 보호하다 죽을 뻔한 중상을 입은 메이아가 의료실로 실려온다. 두에로와 파이웨이가 열심히 치료하는 동안 메이아의 의식은 현실에서 벗어나 소녀 시절의 기억을 따라가기 시작한다.

오랜만에 평온한 시간을 보내고 있는 닐 버나. 수제 쿠션을 건네주기 위해 히비키를 찾아간 디타는 그의 방이 어지럽혀진 것을 보고 청소를 결심하고, 자신의 취향에 맞게 완전히 새롭게 꾸민다.

예전에는 중계기지로 번창했던 '미션' 내부를 물자를 찾아 탐험하는 히비키 일행. 그곳에 덩치 큰 남자 라바트와 그의 파트너 우탄이 있었다. 오랜만에 자신들 외의 남자를 본 히비키들은 구조하러 온 것이 아닐까 생각하는데....

표면의 99%가 물로 뒤덮인 행성 암파토스에서는 젊은이들이 수상도시에서 근근이 살아가고 있었다. 물자 보급을 위해 암파토스의 궤도를 돌던 닐 버나는 행성 반대편에서 적의 추수 기계를 발견한다.

우주를 이동한 지 몇 달이 지나고, 닐 버나는 망원경으로 메제르의 모습을 확인할 수 있는 거리까지 돌아왔다. 파이웨이는 히비키 일행이 나타난 이후 디타가 더 이상 신경을 써주지 않아 외로움을 느끼고 있었다.

큰 피해를 입은 히비키를 구해준 것은 라바트였다. 닐 버나로 돌아온 히비키는 매그노에게 다가가서 그냥 가만히 당하기만 할 것이 아니라 스스로가 직접 매그노와 싸워야 한다고 주장한다.

적의 가짜 반드레드 3기에 의해 드레드 부대는 속수무책으로 당하고, 상처를 입은 메이어 일행은 일단 닐버나로 귀환한다. 하지만 닐버나 역시 적의 맹공격으로 큰 피해를 입어 인근의 가스 행성으로 피신한다.