Doze anos após um estranho evento na Terra, Dan desperta uma criatura intimidante — o seu novo parceiro — que o acompanha e aos seus amigos na primeira batalha.

Dan salva uma hamburgueria através de um duelo Bakugan. Os Fantásticos lidam com um grupo de admiradores que usam os seus Bakugans de forma irresponsável.

Os Fantásticos confrontam um rufia do bairro, que afirma ser o melhor guerreiro Bakugan do mundo. O Bakugan de Wynton não gosta das partidas que ele prega.

Quando se veem proibidos de usar Bakugans, os Fantásticos procuram um novo local para lutar, e é então que a confusão começa. Lia tem um combate duro em mãos.

Dois novos guerreiros mostram o que valem para poderem fazer parte dos Fantásticos. Mais tarde, o grupo cruza-se com um caçador quando um Bakugan desaparece.

Quando Lightning encontra um novo Bakugan, Artulean e Howlkor desentendem-se. Uma equipa de filmagem acompanha os Fantásticos e coloca-os numa situação difícil.

Uma equipa rival desafia os Fantásticos a uma batalha arriscada, em que o vencedor ganha tudo. O grupo pondera inscrever-se numa liga Bakugan para salvar um parque.

Após o encontro com Lupitheon, os Fantásticos perdem o controlo dos seus Bakugans. O faro de Lightning resolve o mistério do comportamento estranho de Dan.

Os Fantásticos veem-se presos num labirinto subterrâneo, onde um fã fervoroso do grupo os desafia a um duelo. Lia quer salvar um campo Bakugan da poluição.

A batalha de Dan com Magnus revela a forma evoluída de um Bakugan. Uma chamada misteriosa acerca de um Bakugan desaparecido leva os Fantásticos a um local sinistro.

Shun quer a todo o custo ficar com os Fantásticos antes de uma batalha Bakugan decisiva. Dan e Shun desentendem-se quanto à liderança do grupo, e surge uma nova ameaça.

Shun recebe uma visita que traz péssimas notícias e um adversário inesperado. Drago e os Bakugans dos Fantásticos têm visões estranhas enquanto dormem.

Os Fantásticos querem desmascarar um batoteiro e descobrem que estão a ser vigiados. Mais tarde, encontram-se com Benton Dusk e lutam com agentes da AAAnimus.

Ao serem informados da existência de uma prisão Bakugan, os Fantásticos viajam até ao mundo labiríntico de Vestroia, do qual não será fácil saírem.

Perdidos no labirinto, os Bakugans têm de lidar com uma versão diferente dos Fantásticos. Ao sair por fim de Vestroia, o grupo encontra uma surpresa desagradável.

Quando uma força sinistra possui os Bakugans, Drago e os Fantásticos têm de usar uma fonte de energia especial para os salvar. Tiko tenta corromper uma Célula Núcleo.

Os Fantásticos escapam por fim do labirinto e ficam surpresos ao porem à prova a sua aptidão em combate. Mais tarde, pensam no que fazer com um Bakugan ursídeo.

Enquanto Shun defronta o primo, os Fantásticos tentam evoluir os seus Bakugans. Mas primeiro têm de arranjar forma de extrair energia da Célula Núcleo e ajudar Shun.

Enquanto filma os Bakugans, Lia tenta aprender a evoluir Pegatrix. Dan mente e é desmascarado quando a equipa enfrenta Duran Dane e o seu Bakugan evoluído.

Após encontrarem uma Célula Núcleo escondida, Dan e Wynton deparam-se com um velho inimigo. O Coronel Tripp controla a mente de Wynton e causa conflito entre os Bakugans.

Dan vê-se no meio de uma erupção vulcânica ao desafiar Magnus e os Guerreiros. Lightning descobre uma Célula Núcleo e luta contra Strata.

Os Fantásticos vão até ao local da nova Célula Núcleo, mas descobrem que Magnus e a sua equipa já a estão a proteger. Dan e Magnus competem então num confronto épico.

Como não conseguem aproximar-se da Célula Núcleo para a proteger, os Fantásticos aceitam uma oferta de trabalho suspeita de Philomena na sede da AAAnimus.

Os Fantásticos têm uma batalha traiçoeira nos céus quando transportam a Célula Núcleo de helicóptero. Um trabalho de investigação complica-se mais do que o esperado.

Uma ligação misteriosa entre os Fantásticos e a Célula Núcleo tem consequências assustadoras. A verdade acerca do plano de Philomena para um mundo perfeito é revelada.

Para impedirem o plano de Philomena, os Fantásticos têm de se aliar a Benton. Uma batalha Bakugan épica põe os aliados à prova a todos os níveis.

A nova aventura dos Fantásticos começa numa ilha tropical, que não é tão tranquila nem deserta quanto parece. Uma descoberta alarmante muda a sua missão.

Um convite emocionante e um sinal da Célula Núcleo leva os Fantásticos ao Brakkistão, um reino com um jovem e estranho rei, que é um grande fã e aspirante a lutador.

Os Fantásticos estão a monte no Brakkistão e têm de usar disfarces excêntricos. Lia ensina ao apaixonado Lorde Brakken umas coisas sobre o amor, a vida e a luta.

O novo vídeo de Dan e Wynton compromete uma missão secreta. Os Fantásticos e Magnus tornam a encontrar-se enquanto procuram uma Célula Núcleo e encontram o seu protetor.

Os Fantásticos seguem um sinal estranho e descobrem uma grande operação numa ilha artificial. Shun reencontra o pai afastado e enfrenta uma escolha difícil.

Drago tem uma visão perturbadora, mas o pai de Shun ignora os avisos. Masato desencadeia uma ameaça poderosa que obriga os parceiros a corajosas medidas extremas.

Benton parece estranhamente feliz e organiza uma festa de piscina para os Fantásticos quando eles começam a duvidar do plano dele. Um velho inimigo regressa.

Quando Benton descobre um novo portão num parque de diversões, não há diversão para ninguém. Strata volta estranho do labirinto, e os Fantásticos ficam preocupados.

Os Fantásticos ouvem notícias assustadoras de Trhyno, o enfurecido Bakugan dourado. Magnus e Dan tornam a lutar, desta vez em terreno perigoso.

O novo poder de Magnus tem um preço assustador. Os Fantásticos descobrem o plano maléfico de Tiko, mas não sabem como o travar. Dan guarda um segredo terrível.

As suspeitas de Drago são confirmadas antes de ele começar uma luta de vida ou morte contra Dan. Magnus acede a um tipo de força diferente no combate contra Tiko.

Benton descobre os poderes do Vírus V. Mais tarde, ele tem um comportamento estranho enquanto os jovens lutadores aprendem sobre o ecossistema de Vestroia.

Os Fantásticos partem para uma missão no Brakkistão, cujos palácio e rei estão mais estranhos do que nunca. Os amigos vão ter de usar a cabeça para escapar.

Na sua nova missão, os Fantásticos têm de combater um adversário surpreendente. Mais tarde, uma conversa muda tudo o que eles sabem sobre as Células Núcleo.

Os Fantásticos começam a desconfiar de Benton e põem-no à prova. Após o resultado, são obrigados a visitar um velho rival para lhe pedir conselhos.

Quando as crianças de todo o mundo perdem os seus Bakugan, os Fantásticos têm de agir. Mais tarde, Wynton é subjugado durante um confronto com o Coronel Tripp.

Lia depara com China Riot, uma rival com a qual é inesperadamente forçada a competir. Os Fantásticos visitam o pai de Shun e descobrem algo sobre as Células Núcleo.

Masato, o primo de Shun, tem notícias surpreendentes para os Fantásticos. Shun implora então ao pai que faça o que está certo.

Enquanto os Fantásticos enfrentam forças inimigas, formam uma aliança com um velho inimigo. Mais tarde, essa nova união força-os a partir numa perigosa missão de resgate.

Enquanto os Fantásticos recuperam da missão de resgate, descobrem uma forma de curar um aliado tombado, mas uma grande ameaça tenta impedi-los.

As Células Núcleo são atacadas, e os Fantásticos têm apenas uma forma de as proteger. Entretanto, Dan descobre por fim a verdade sobre Tiko.

Tiko prepara-se para o seu maior alvo, quando Shun recebe uma chocante visita familiar. Mais tarde, aliados inesperados juntam-se aos Fantásticos em defesa do planeta.

Os Fantásticos e os seus aliados planeiam uma defesa elaborada contra Tiko e as suas forças. Durante a grande batalha, um herói poderoso emerge.

Tiko revela a sua verdadeira forma durante um confronto épico contra os Fantásticos. Neste derradeiro combate, Dan espera que um plano de emergência salve o mundo.

The AO plan on sneaking into AAAnimus and rescuing their Bakugan but are stopped by Benton who offers up an alternate plan.