Pur continuando a utilizzare la mongolfiera per cercare il petrolio, si decide che il villaggio di Ishigami debba dedicarsi all'agricoltura per prevenire future carenze alimentari, nonché produrre cibo conservato per il loro imminente viaggio per mare.

Il Regno della Scienza avrà bisogno di razioni per sopravvivere durante il viaggio verso l'altra parte del mondo. Ma Senku, non essendo un professionista, brucia tutto il pane che tenta di cuocere.

Senku, porta con sé una squadra per cercare i giacimenti petroliferi di Sagara. Nel frattempo, Suika e Francois vanno a caccia di tartufi.

Il segnale in codice morse che legge "PERCHÈ" satura troppo le onde radio perché Ukyo possa individuare una direzione, quindi il Regno della Scienza lavora su un modo per visualizzare il segnale.

Gli sforzi di Kaseki per costruire la nave scientifica Perseus incontrano un ostacolo quando si rende conto che è impossibile mettere in pratica tutte le parti.

L'equipaggio della Perseus è in viaggio verso l'isola del tesoro, il luogo di nascita delle Cento Racconti, dove spera di trovare lo scrigno del tesoro lasciato dall'equipaggio della Soyuz.

Il Perseus arriva all'isola del tesoro. Una squadra di ricognizione composta da Senku, Soyuz, Kohaku e Gen è partita per localizzare il platino e prendere contatto con gli isolani. Ukyo in seguito scopre qualcosa sul fondo del mare e manda Ginro a indagare.

Amaryllis spiega come è riuscita a sfuggire alla pietrificazione e come è arrivata alla decisione di intrufolarsi nel palazzo interno.

Suika e Ginro lavorano insieme per salvare il laboratorio mobile dalla Perseus. Riunito con Senku e gli altri, il gruppo lavora su oggetti per aiutare Kohaku nel processo di selezione.

Amaryllis, Ginro e Kohaku vengono scelti per unirsi al palazzo interno. Il team scientifico avrà bisogno di un modo per comunicare con loro in segreto e, eventualmente, di un modo per loro con il team scientifico.

Kohaku ha localizzato il tesoro lasciato da Byakuya e dagli altri, ma è racchiuso nel cemento. Senku deve escogitare un piano per entrare silenziosamente nel contenuto all'interno, in modo da non allertare le guardie.

Kohaku è costretto a distruggere la statua di Ryusui per dimostrare che non è una spia.

La squadra rianima Kaseki per lavorare sul drone. Nel frattempo Ginro viene chiamato a trovare il Maestro.

Una parte maggiore del Regno della Scienza viene riportata indietro dalla pietrificazione, ma viene scoperta nella grotta da Moz.

Moz e il Regno della Scienza formano un'alleanza tenue e temporanea contro Ibara. Quanto durerà è una questione di cui non possono ancora permettersi di preoccuparsi.

Il Regno della Scienza attacca e cerca di eseguire il piano per rubare il dispositivo di pietrificazione. Moz convince Kirisame a usare il dispositivo, ma l'istinto di Ryusui gli dice che c'è qualcosa che non va nella situazione.

I membri del Regno della Scienza lanciano un attacco contro gli isolani a bordo della Perseus, ma Moz non è molto indietro e Senku e gli altri sono costretti a ritirarsi all'interno della nave. Ibara li mette alle strette, ma Senku scatena la sua carta Joker.

Yo e il Regno della Scienza catturano il dispositivo di pietrificazione, ma Ibara non si arrenderà senza combattere.

Con grande shock e sgomento di Ibara, Senku elaborò un piano e riuscì a sfuggire alla pietrificazione. Ora i due entrano in uno scontro testa a testa per il controllo del dispositivo Medusa.

Alla luna! Questo è il piano, almeno. Senku e il Regno della Scienza devono escogitare un mezzo con cui andare sulla luna e affrontare Why-Man. Il primo passo è allearsi con gli abitanti dell'Isola del Tesoro e ottenere il loro aiuto con alcuni nuovi mestieri.

Con il dispositivo di pietrificazione nelle mani del Regno, è tempo di far rivivere Tsukasa. Ma c'è solo un problema: il dispositivo ha le batterie scariche.