В центре истории увлекающийся наукой юноша со сверхчеловеческим мозгом, Сэнку, и его близкий друг, Тайдзю, который гордится своей физической силой. Тайдзю решается рассказать о своих истинных чувствах Юдзурихе, которую он любил с самого детства.друг происходит что-то невероятное, и все люди на свете мгновенно превращаются в камень...!!!

Затем действие переносится на 3700 лет вперед. В каменном мире, где цивилизации исчезли, Сэнку и Тайдзу выходят из состояния окаменения, воссоединяются и решают построить цивилизацию с нуля!

Перед лицом непосредственной опасности со стороны диких животных Сенку и Тайдзю вынуждены возродить Цукасу Шишио - "самого сильного примата старшей школы". Несмотря на то, что Цукаса обладает огромными боевыми способностями и обеспечивает им обильную пищу в качестве охотника, их новый союзник придерживается противоположных взглядов на восстановление человечества.

Сенку не доверяет мотивации Шишио, поэтому он попытается скрыть свои планы от нового и непредвиденного врага ради своего плана по возрождению цивилизации.

У Сенку возникает идея создать порох, чтобы уравновесить чашу весов и получить шанс победить Шишио. Производство пороха приводит к пожару. Вскоре после этого Сенку и остальные обнаруживают на горизонте дымовые сигналы. Несчастный случай? Вряд ли. Очевидно, в каменном мире есть и другие люди...

Тайдзю и Юдзуриха разгадывают секрет Сенку и оживляют его. Но теперь, когда он вернулся, им нужно разобраться с Цукасой.

Кохаку проводит Сенку в свою деревню, но его придется убедить, прежде чем его впустят. Тем временем он заводит дружбу с единомышленником, подающим надежды "колдуном".

Сестра Кохаку, деревенская жрица Рури, тяжело больна. Сенку, Хром и Кохаку начинают работу над антибиотаками, чтобы спасти ее жизнь.

Сенку открывает ларек с раменом в надежде заручиться поддержкой своего царства науки, но некоторые люди слишком принципиальны, чтобы принять такую взятку. Менталист Асагири Ген не из их числа.

Сенку и его царство науки успешно испытывают первую лампочку со времен коллапса. Тем временем Асагири Ген, шпион из империи Цукаса, убит неизвестным злоумышленником.

Развитие стекольного производства, важный этап для производства препаратов сульфата и для химии в целом, оказывается неожиданно полезным для Суйки.

Чтобы сделать антибиотики, Сенку и его королевство должны добыть серную кислоту из фонтана, где она содержится. Команда отправляется на поиски, но нет никакой гарантии, что они вернутся живыми.

Все, что нужно для изготовления антибиотиков, - это спирт. Лучший способ получить его - выиграть Великий поединок, который Сенку и его королевство также должны будут сделать, чтобы держать Магму подальше от Рури и дать ей лекарство.

После серии трюков, проведенных Магмой, чтобы дойти до финального матча, Хром показывает свой собственный трюк! С небольшой помощью от Гена, Хром, возможно, сможет провернуть этот трюк!

После маловероятной победы Сенку, быстрого брака и еще более скоропалительного развода, царство науки возвращается к работе, чтобы наконец-то закончить лекарство Рури!

Рури раскрывает происхождение названия деревни, а Сенку узнает о судьбе своего отца!

История Бякуи и астронавтов продолжается, а связь Сенку с деревней Исигами и "Сотней сказок" наконец-то раскрывается.

Армия Цукасы наступает! Кинро пытается удержать мост против смертоносного копьеносца Хёги и его ударных войск, но Сенку и жители деревни готовы со смертоносным новым научным оружием!

Хёга обезоружен, но царство науки по-прежнему в опасности - деревня Исигами охвачена пламенем! И Цукаса скоро узнает, что Сенку все еще жив... Как жители деревни будут бороться с грядущим вторжением?

Начинается работа по созданию компонентов для мобильного телефона Сенку, но вращение золотой проволоки оказывается довольно сложной задачей! К счастью, Хром и Касеки "изобретают" водяное колесо и радикально улучшают процесс!

С завершением строительства водяного колеса Хрома и Касэки деревня Исигами вступает в эпоху электричества! Но сможет ли Сенку с имеющимися в его распоряжении примитивными материалами создать нить, которая выдержит сильное нагревание при работе вакуумной трубки?

Сенку, Хром и Магма отправляются в пещеру в поисках Вольфрама, но там происходит подозрительный несчастный случай, в результате которого Сенку и Хром оказываются на дне ямы! Что задумал Магма?!

Сенку и остальные жители деревни приступают к работе по изготовлению компонентов для мобильного телефона. Это тяжелая работа, но все в восторге!

После успешного испытания нового мобильного телефона Сенку узнает загадочную историю о пчеле по имени Спикер, которая может воспроизводить голоса мертвых.