ตอนแรกของซีซั่น ประมาณสามเดือนหลังจากเหตุการณ์ในตอนสุดท้ายของซีซั่นหนึ่ง ยานยูเอสเอส เซอร์รีโทสถูกส่งออกไปทำภารกิจที่ทำให้ได้พบกับ “พลังงานแปลกๆ”

ลูกเรือชั้นล่างมีปัญหาในการทำความรู้จักกับเรือตรีเจ็ต แมนฮาเวอร์ที่เพิ่งได้รับมอบหมายเวรหน้าที่และเตียงนอนของบอยม์เลอร์ ในขณะเดียวกัน เราก็ได้เห็นชีวิตของบอยม์เลอร์บนยานยูเอสเอส ไททัน ที่เข้มข้นกว่าที่เขาคิดไว้

เมื่อได้รับมอบหมายหน้าที่พิเศษจากดร.ทีอาน่า เทนดี้เลยขอความช่วยเหลือจากมารีเนอร์ บนยานยูเอสเอส เซอร์รีโทส รูเธอร์ฟอร์ดถูกครอบงำจากเรื่องลึกลับของลูกเรือในหอบังคับการ

The U.S.S. Cerritos is dispatched to a planet to investigate an unexplained sighting of a dangerous Mugato.

มารีเนอร์และบอยม์เลอร์พยายามตามหาสถานที่จัดงานปาร์ตี้สตาร์ฟลีตในตำนาน ขณะที่ลูกเรือในหอบังคับการรับมือกับทูตเอเลี่ยนขี้อาย

มารีเนอร์และบอยม์เลอร์ถูกทิ้งไว้บนดาวเคราะห์ร้างกับคอมพิวเตอร์ที่มีความรู้สึก ส่วนบนยานเซอร์รีโทส นาวาตรีบิลอัปส์ต้องพิสูจน์ความสามารถทางวิศวกรรมกับศัตรูเก่า

ที่ปรึกษามาถึงยานยูเอสเอส เซอร์รีโทสเพื่อทำการฝึกที่ต้องให้ลูกเรือชั้นล่างและลูกเรือหอบังคับการสลับหน้าที่กัน

บอยม์เลอร์พยายามหาเพื่อนในหอบังคับการ ขณะที่ลูกเรือยานยูเอสเอส เซอร์รีโทสมีเวลาว่างระหว่างการเดินทางวาร์ประยะไกล

ในตอนสุดท้ายของซีซั่นที่สอง ยานยูเอสเอส เซอร์รีโทสได้รับมอบหมายให้ช่วยยานอีกลำในการทำภารกิจการติดต่อครั้งแรก