本應在事故中死去的上班族，竟然作為嬰兒轉生到了異世界。在異世界被賢者·梅林所撿到，起名為了“西恩”。被賢者等人所養育長大，雖然變得能操縱超規格的魔法，但是卻沒有被教導這個世界的常識！15歲少年卻從沒有離開過森林上街買東西。不懂世故的西恩，為了結交朋友，並且了解常識而進入高等魔法學院學習。

終於到了入學考試當天。在會場上，也有亞爾斯海特王國的王子·奧古、西希莉和瑪麗亞的身影。在實力測試上，西恩一如既往地以超出規格的力量讓大家都震驚了。其他的考試生都要以形體語言來詠唱咒文，但西恩居然不需要詠唱就發動了魔法，而且還引起了大爆炸。由於壓倒性的力量差距，西恩居然以第一名的成績入學了。接下來就是，開心的學園生活了——本應該是這樣的，沒想到問題卻突然發生！？

西恩為了保護西希莉和瑪麗亞而跟她們一起上學。上課第一天，在老師的帶領下S班的學生們參觀了學校。突然奧古提出要不要建立一個研究會。對於突然發生的事態感到不知所措的西恩，而S班的其他學生卻把西恩放在一邊自己討論了起來，並決定建立“究極魔法研究會”。與此同時，最近有些奇怪的卡特，在還是中等生的時候就一直有出沒在老師的研究室……

西恩擊退了時隔數十年出現的魔人而被稱讚為新英雄，民眾們都歡喜地蜂擁而至。然而，直接與魔人戰鬥了的西恩都感覺到有違和感。他覺得卡特會不會是被“人為地”魔人化……與此同時，學院裡想要進入“究極魔法研究會”的學生非常的多。於是，馬克和奧麗維亞成為了新的同伴。西恩為了更新自己的武器而打算趕往“賓恩工房”，在途中卻遭遇了戴著眼帶的男子……

在亞爾斯海特王國的國境附近進軍的布魯斯菲亞帝國。在那裡的是，本不應該在的王國軍，與從部下那裡聽來的情報不一樣，怒上心頭的赫拉度皇帝。於是，得到在帝都有大量魔物出現的消息，急著折返的帝國軍。但是，街道已經面目全非。被獅子與魔猿這種災害級的魔物給襲擊了，在周圍是滿身是血的屍體散亂著，的確化作了地獄。

在森林的最深部舉行共同訓練西恩他們的班，與騎士學院的協助成功討伐了熊的魔物。終於終於劍與魔法的協作的重要性。某日，從奧古那裡聽來的魔人的新的情報。現在，魔人們襲擊布魯斯菲亞帝國領土內的鎮和村落，更加嚴重的是人們變成了魔人。為了對抗勢力持續增加的斯托羅姆。究極魔法研究會的成員舉辦了強化合宿。

克洛德的鎮上舉辦著合宿的究極魔法研究會。梅林指導魔法控制，梅莉達指導魔法道具製作。多虧了兩人的合作力量確實提升的成員們。但是與以壓倒性的勢力的魔人作為對手戰鬥來說，力量還遠遠不足。西恩也不服輸進行新魔法的練習，大家警戒中，釋放出想像膨脹的魔法，又捅婁子了。於是奧古被支援，終於西恩對西希莉。

某天早晨，西恩被西希莉拜託重大的事情。那是給雙親的交往報告。帶著緊張的神色向著克洛德宅邸去了，打過招呼的西恩。於是從西希莉的母親那裡，身為貴族的女兒要考慮將來，被告知想她要有結婚的覺悟。剛剛開始交往的西恩。到底會回答什麼。另一方面，梅林和梅莉達也從西恩那裡接受到了報告，帶著總有些僵硬的表情向著某個地方前去。

因為讓連平民都一個接著一個魔人化的斯托羅姆，布魯斯菲亞帝國被逼入了走向滅亡的境地。至今被貴族虐待的原平民，因為突然獲得了強大的力量打算開始征服世界。但是實現了殲滅帝國這樣的目的的斯托羅姆，失去了活著的意義。於是，開始講述自己的過去。終於真相大白，斯托羅姆魔人化的秘密故事。

聽聞斯維德王國里出現了魔人這一消息後，終極魔術師團使用浮游魔法飛速前去救援。然而，王國的城牆已然遭到破壞，敵人侵入到了城內。看到母女二人正在遭受魔人的襲擊，西恩使用飛踢拯救了她們。其他成員雖然未曾有過與魔人戰鬥的經驗，但卻有著壓倒性的力量。

西希莉正在為在戰鬥中受傷的士兵們施加治療魔法，但受傷者很多，西希莉顯得有些疲憊。就在這時，城門附近發生了巨大的爆炸。米莉亞居然也加入了戰鬥。雖然愛麗絲和琳恩上前對抗，但卻因與之前的魔人完全不一樣的戰鬥力而陷入了苦戰之中。就在這時，西恩手持高頻振動劍登場，開始激烈的戰鬥。究竟哪一方會取得勝利呢？