康熙率眾皇子狩獵，胤礽恃太子身份搶走胤禛所捕的獵物，惟父皇偏袒太子。胤禛憤然策馬而去，初遇民女苗欣，彼此留下好感。眾皇子鬥快獵殺野鹿，太子以為志在必得卻被胤禛、胤禎合力阻止，終由胤禎獲父皇賞賜金腰帶。

胤禛喝下太子下了春藥的鹿血後，失性將苗欣姦污。適時太子率眾皇子人贓並獲，康熙盛怒決將胤禛軟禁。苗欣父女遭太子派人刺殺，欣父不幸掉下山崖，苗欣以為是胤禛所為對其恨之入骨。胤禛被押返太子府，認識了年羹堯。

太子遭胤禔派雲中雁行刺，得年羹堯拼死護駕，羹堯獲升為護衛。太子舉行壽宴，胤禩投其所好送上青樓女子秋夢月，未料羹堯要求賞賜時竟欲得到夢月，太子即貶其職。胤禩使計引康熙撞見太子與鄭妃的荒誕之事，康熙大怒。

胤禎遭行刺，得穆旦天相救，康熙聞知為太子所主使，決褫奪太子的黃袍。太子擔心被廢，決先下手為強，發動兵變。胤禛得年羹堯通報後火速入宮，惟康熙不信其言。康熙偕太子祭天，果然遭行刺，幸而胤禎與旦天及時出現。

韋公公擊退納蘭飄雪，解救康熙。胤禎告訴康熙乃胤禛派年羹堯速報，才知太子造反，康熙決將太子終生軟禁。羹堯獲封總兵後，感激胤禛的知遇之恩。苗欣被眾村民視為災星欲把她燒死，幸得文覺及時救走，時苗欣突然作動。

苗欣與嬰孩遭村民浸豬籠，幸得文覺救起，但嬰孩卻失去蹤影。胤禛四處訪尋苗欣下落，聽聞有人在河邊拾得一子，即往查探，後決將親生骨肉帶返宮中撫養。康熙知胤禛私藏嬰孩龍顏大怒，胤禛為保嬰孩留宮，竟願代替離宮。

胤禛傾盡家產與侈國維交易，好讓年羹堯當上四川總督。德妃着胤禛往五台山取得在清涼寺出家的太上皇順治之信任，才有望回京。胤禛欣賞戴鐸在壁上所提的詩，遂往尋之，獲戴鐸投誠。二人暗訪清涼寺，果見順治尚在人世。

巴漢格隆率喇嘛殺入清涼寺，性音、文覺、胤禛奮勇抗敵，惟胤禛被打至重傷。胤禛道出被父皇所厭及逐出宮的事，獲順治憐憫。胤禛依戴鐸之計訛稱生辰，順治認為其乃真命天子，遂撰手喻着康熙他日傳位胤禛，後圓寂歸去。

眾皇子各懷鬼胎，暗派殺手搶奪胤禛的手喻。胤禛往山洞躲避追殺，竟重遇苗欣。苗欣欲殺胤禛被性音阻止，胤禛道出二人之子正在宮中。胤禩與巴漢格隆勾結。胤禛再遭偷襲，幸得苗欣相救，惟舍利子掉入江中，幸終尋回。

胤禛平安將順治的舍利子及手喻呈給康熙。胤禛暗中領苗欣探見弘曆，更心軟讓苗欣抱走弘曆。胤禛回宮後，卻見弘曆躺在陳常在身邊，喜出望外。胤禛滿心歡喜晉見康熙，卻只被封為雍親王，後又見常在病逝，胤禛怒不可遏。

雍王府落成，胤禛被胤禩等皇兄弟冷嘲熱諷。胤禛依戴鐸之言，告知康熙已潛心學佛，康熙對胤禛改觀。文覺對苗欣動情苦惱不已。戴鐸着胤禛拉攏裕親王，胤禛逼文覺還俗與恭蕙格格成親，文覺堅拒不果，遂決心向苗欣表白。

侈國維奏請康熙將舒蘭許配胤禩，康熙恩准，胤禎得知後向康熙說出與舒蘭兩情相悅。苗欣欲斬斷煩惱，決心剃度出家，胤禛抱著弘曆趕至阻止。胤禩為得太子之位，拉攏朝中各大臣上奏康熙，又著巴漢格隆殺害與其作對的人。

胤礽得隆科多所助，使康熙認定胤禔施邪術令其大失常性，胤禔被勒令終生囚禁。胤礽騙得康熙信任，更重新冊立其為太子。胤禩急召旗內高手力取胤礽人頭未果。胤礽召胤禛、胤禩等皇子大興問罪，逼眾人飲尿或叩頭認錯。

性音使出魔功，終擊敗巴漢格隆。藍如風往色誘胤礽，並在其耳中放入毒蟲，致他在太子冊封大典上發瘋。隆科多說出胤禩身邊有一用毒高手藍如風，令康熙認定此事是胤禩一夥所為，決貶胤禩等往清涼寺，並抄查侈國維一家。

藍如風向納蘭飄雪言明毒害太子之事是受胤禛主使，胤禩得知後誓將胤禛剷除。苗欣離開尼姑庵，喜見胤禛抱著兒子在寺外等候，未料飄雪等人殺至，三人不慎同墮山崖，後竟重遇苗老三。如風欣然告知師父已成功離間眾皇子。

西藏郡主亞詩瑪求康熙出兵幫助，適時竟傳來拉薩城已失陷的消息。胤禩等巧遇被追殺的拉藏汗，遂以護送為名回京。性音夜襲韋公公，卻不意其武功竟如此高強。拉藏汗平安面聖，康熙見胤禩等立功，遂允許三人遷回宮中。

康熙召眾臣商議出兵西藏之事，另邊廂，苗欣與雲中雁在乾清宮為遺詔大打出手，適時韋公公出現洞悉二人身份。原來康熙設下空白遺詔的圈套，試探眾皇子的野心。康熙命胤禎領兵出征西藏以立戰功，並暗立遺詔傳位予胤禎。

胤禛偕年羹堯到訪德妃，並提議羹堯助胤禎出征西藏。胤禛藉詞邀隆科多、舒蘭飲宴並迷暈二人，更對舒蘭施以強暴。胤禛道出當中利害，隆科多無奈答允將女兒嫁予他。胤禎得悉後往追問舒蘭，舒蘭竟表示與胤禛乃情投意合。

（大結局）胤禎驚悉向太子下毒的主謀是胤禛。胤禛求苗老三借出捕獸器未果，不慎將其推下山崖。胤禎與年羹堯率大軍征戰西藏，隆科多卻率兵封鎖禁宮，並傳康熙病重。巴漢格隆以捕獸器擊殺韋公公，時胤禛逼康熙遜位……