离魁皇高中的毕礼还有十天。学生都在期待着毕业。季节开始从冬天过渡到春天，大家的高校生活本应平稳的度过。然而，三年A班的门打开了，班主任柊一飒站到讲台前，表情平静地告诉29个学生：“从现在开始，大家都是我的人质。”学生们先是一愣，而后纷纷嘲笑起老师来，还有一部分人漠然地准备回家。但是，教室的门被一飒用特殊的锁锁住了，无法自由开启。与此同时，走廊里传来爆炸声。那是一飒设置的炸弹爆炸了。大家都惊呆了。爆炸过后，三年A班处于完全的孤立状态，完全与外界隔绝。一飒说从现在开始，他要给学生们上最后一课。他要求学生们回答数月前某位同班同学自杀的理由。大家必须在晚上八点前给出答案，答错了，就要杀死一个人。而且，他指名由年级委员茅野樱代表同学们回答问题。

警视厅理事官五十岚终于与一飒面对面了。然而，一飒察觉到五十岚带了窃听器后，突然拔枪相向。一飒这天的授课是找出哪个三年A班的学生拍摄了陷害澪奈的假视频。不过与过去不同，他不是让学生们找出犯人，而是命令郡司来找。他宣布，如果不能在指定时间内找到视频的拍摄者，就要杀掉教室里的五个学生。人们纷纷把视光聚集警察的行动。郡司进行调查后，在视频中发现了一个穿游泳部队服的人。与此同时，学生们对游泳部的花恋产生了怀疑。她反称视频中穿队服的人也许是真壁。澪奈、花恋、真壁曾经是关系亲密的游泳部队友。就在这时，有人以三年A班的学生的名义联络郡司。得到那个学生帮助的郡司查明了拍假视频的人。

拍摄导致澪奈之死的可疑视频的人是里见。然而，他是受人指使才拍的视频。一飒问学生们是否知道指使人是谁。如果交不出正确的名字就有性命之忧——就在大家这样想时，有一个人举起了手。那人就是甲斐。甲斐认罪了，而一飒要找的是甲斐身后的真正的罪魁祸首。甲斐不肯说。一飒告诉他，如果不说明真相，接下来会有十个学生丧命。三年A班全体学生都吓坏了。学生们打算从甲斐口中套出情报，然而甲斐闭口不言。面对这样的甲斐，茅野樱鼓起勇气说了一番话。然而，就算这样，他还是什么也不说，而是一个人走出了教室。不过，茅野樱的勇气让有些学生感动，教室内的气氛渐渐发生变化。快到晚上八点了，焦躁的男学生们要对甲斐动粗，危险迫在眉睫。甲斐向一飒提出挑战，称如果一飒赢了他就说实话，如果他赢了，一飒就要放了所有人。

一飒昏倒了。从那以后过了两小时，3月4日下午10点30分开始，故事又开始继续。小樱等人担心一飒，而其他学生们趁这个空隙分头寻找脱身之法。他们成功地打破了一直闭锁的美术准备室的门。从那里，他们拿回了被没收的手机和书包，获得了与外界联系的手段。根据不同的人发出的生存报道，一飒病全的消息瞬间扩散了出去。听到这个情报后，警方马上采取行动，准备强入。离强攻开始没剩多少时间了。就在这时，连接美术准备室的地板到下层教室的暗门打开了，本应该被杀的中尾、里见、西崎、濑尾、瑠奈、美咲等人现身。这意外的情况让学生们很高兴。然而，里见等人却表情微妙。他们告诉试图逃走的同学们，自己不打算离开学校。而且，他们还希望其他同学也与老师一起留在学校。三年A班的学生们站在命运的十字路口。

委托半黑社会组织berumuzu制作假视频害死澪奈的罪魁祸首是魁星高中的某位老师。这个消息传到网上后，引发了各种样的猜测。就在此时，一飒在SNS上发布了自己的视频，还上传了证明三年A班全体学都健在的照片。在消除了他杀害学生的嫌疑后，世人更加不懂一飒此次行动的目的是什么。有一种意见认为一飒实际上是为了曝光澪奈之死真相才铤而走险的英雄。另一方面，学生们以为自己从死亡的恐怖中解脱出来了，没想到，一飒要求教师们找到委托制作假视频的犯人的名字，否则，就在晚上八点时把教室炸了。A班的学生们大惊失色。他们纷纷指责一飒食言，而一飒的表情一如平常。他说自己的决心从未动摇，然后再次把学生们的手机没收了。教室里又恢复到了案发第一天时的光景，大家狐疑不定，只有小樱注意到某件事情。

一飒点名说犯人教师是武智大和。他揭发委托半黑社会组织炮制假视频陷害澪奈的是武智，世人都开始对武智口诛笔伐。然而，武智却说自己的清白无辜的。一飒让他在晚上八点前坦白罪行，否则就要夺走对武智来说“最重要的东西”。在教室里，一飒给学生们看了澪奈殒命当天录制的视频。视频显示在澪奈身亡的那天她说要去见做假视频的犯人。而且，一飒也在课堂上放映了社会上正疯传的澪奈死亡当天防盗录像的画面，在那上面可以看到一个奇怪的男人与澪奈在一起。但是，与以往不同的是，一飒说这次没有决定性的证据。就在学生们对武智的怀疑不断加深时，濑尾和小华却唱起了反调。一飒让学生们自己研究分析与澪奈一起被拍到的人到底是不是武智。

武智在接受警方审讯时，坚称自己无罪。但是，在社会上，由社交媒体上的人们解析过的被当成武智涉嫌杀人的证据的视频到处扩散，揭发武智恶行的人们胜利之情溢于言表。三年A班的学生们以为已经找到了造成澪奈之死的假视频的真相，质问一飒为什么不释放他们。而一飒却告诉他们，澪奈死亡的原因根本不是那个，并且宣布从现在开始才进入“正题”。面对困惑的学生们，一飒这次交给他们的课题是——自习。他把没收的收包和手机还给学生们，要求他们这一天要在思考中度过。另一方面，郡司为了调查一飒的真面目去找文香。从文香的话中，郡司了解到了武智背后的人到底是谁。随着调查的深入，武智是杀害澪奈的犯人的证据越发牢固了。人们认为武智早晚会坦白交待。在教室里，当学生们正在自习时，瑠奈反复观看武智的视频，突然注意到一个令人震惊的事实。

一个神秘的英雄出现在一飒和郡司面前。故事跳转到事件发生的数年后的3月9日。走上不同人生道路的三年A班学生们再次回到教室。在感慨万分的他们眼前是一张一飒的“遗像”。他们聚集在一起的理由是这一天是已故的一飒的三周年忌日。教室里播放了逢泽拍摄的澪奈的纪录片。关于澪奈的真相逐步明朗。那个视频反映了澪奈的真实想法。故事的时间又回到大家还是高三学生的那一年的3月9日。一飒把郡司扣为人质后就昏了过去。SNS上人们还在把武智当成杀死澪奈的犯人来声讨，媒体也在追踪武智。这时，某人把一飒制作的假视频上传到SNS上。痛骂武智的人们根据这个视频一起调转矛头，又把一飒当成真凶。于是，一飒向三年A班的学生们展开了“说出全部真相的授课”。

一飒挟持郡司为人质，手持机关枪出现在校舍的天台上。世人全都关注着一飒的犯罪行为。在某个街角，在某间小店，在某户人家，人们注视着这一事件的最后结局。就在一飒宣布，会在第二天早上八点的视频网站Mind voice的直播活动中说出全部真相的一瞬间，一颗子弹打进了他的胸口。