Alors que Balthazar détourne les questions de son psychologue, qui veut le faire parler de la nuit tragique de son mariage, il reçoit un appel. Un chien a ramené une étrange trouvaille à son maître : un pied humain. Balthazar rejoint Delgado et Camille, la nouvelle capitaine. Et son premier examen calme tout le monde : le pied a été découpé sur un homme encore vivant... Après autopsie de ce pied, Balthazar parvient à dresser un portrait-robot de la victime. Et Camille l'identifie. Ils se précipitent chez elle mais arrivent trop tard. L'homme a été massacré après qu'on lui a tranché le pied. Camille reçoit un appel : une deuxième victime vient d'être signalée, à laquelle on a coupé la tête.

Anaïs, 6 ans, est enlevée. Qui a pu s'en prendre à l'enfant ? Ce pédophile récemment sorti de prison ? Le pion du lycée de la sœur d'Anaïs qui l'a récemment éconduit ? Mais alors que les événements s'accélèrent et que l'arrestation du suspect connaît une issue tragique, Raphaël et Camille comprennent que la vérité est pire que tout ce qu'ils avaient pu imaginer.

Suite aux frasques de Raphaël, la froide Docteure Vésinet débarque pour l'évaluer. En parallèle, dans une casse, trois jeunes ont été massacrés. Le principal suspect est un homme dont les jeunes avaient cambriolé la maison. Mais pourquoi les aurait-il massacrés pour des babioles ? A moins que ces babioles renferment un terrible secret. Raphaël est prêt à tout, y compris braver la loi, pour arrêter ce dangereux psychopathe.

Balthazar, qui fait tout pour éviter le docteur Vésinet, donne un cours à la fac de médecine en compagnie d'Eddy et Fatim lorsqu'il est pris en otage par l'un de ses élèves, William. Le jeune homme souhaite innocenter son père, incarcéré pour le meurtre de sa mère, et exige de Balthazar qu'il étudie le dossier. Alors que Camille, Olivia et Delgado suivent la situation avec le RAID et la sœur de William depuis le couloir de la fac, Balthazar tente de raisonner le jeune garçon, qui finit par lâcher son arme. Mais il l'interrompt au dernier moment : il y a bien quelque chose qui cloche dans le rapport d'autopsie. Le père de William a-t-il réellement tué sa mère, conformément à ses aveux ?

Une équipe de documentaristes intègre l'IML pour tourner un reportage alors qu'Eddy et Fatim ne s'adressent plus la parole et que la guerre est déclarée entre Olivia et Balthazar. Alors que chacun tente d'instrumentaliser la présence des journalistes pour régler ses comptes, un squelette est découvert, celui d'un homme tué à coups de pierres et dont le corps a été bouilli. Les légistes vont tenter de découvrir quel est le lien entre la victime et une expédition de spéléologie ayant eu lieu deux ans plus tôt.

Le conflit s'envenime entre Vésinet et Balthazar. Et lorsqu'elle l'envoie sur une sombre affaire de vaches assassinées dans un village qu'il déteste, la tension monte encore d'un cran. Heureusement, Camille est là pour accompagner le légiste dans cette épreuve. En effet, c'est dans cette commune que Balthazar a grandi avant de fuir vingt ans auparavant. Alors reprend contact avec son passé, ses parents, ses mauvais souvenirs et qu'il introduit Camille au monde de son enfance, Balthazar doit aussi affronter la mort de son amie Sabrina, gendarme, a priori victime du même tueur que celui qui s'attaque aux vaches

Balthazar est inculpé pour double homicide. Il est en cellule, dévasté, menottes aux poignets. Est-il ce monstre qu'on lui décrit ? Et quels sont ces souvenirs qui continuent de le hanter ? Ne serait-on pas en train de le manipuler ? Personne ne peut lui donner les réponses qu'il cherche et Balthazar n'a pas le choix. Pour comprendre ce qui lui arrive et qui le persécute, il doit s'évader et devenir un fugitif. Pour Camille, cette évasion est une trahison. Et elle décide, coûte que coûte, de le retrouver.