Hitomi Tsukishiro, une jeune fille descendante d'une famille de mages qui ne peut plus voir les couleurs depuis qu’elle est petite, se fait renvoyer 60 ans en arrière par sa grand-mère Kohaku qui lui dit un soir d'aller lui rendre visite au lycée. Hitomi se retrouve dans la chambre d'Yuito Aoi, un élève du lycée Minamigaoka, et tente de s'échapper, mais l'amie de Yuito, Kurumi Kawai, la découvre.

Hitomi voit le dessin que Yuito a dessiné et, brièvement, son monde retrouve ses couleurs. Logeant maintenant chez Kohaku pendant que celle-ci se trouve à l'étranger, Hitomi est encouragée par les parents de Kohaku à s'inscrire au lycée Minamigaoka. Hitomi va bientôt découvrir un côté surprenant de sa grand-mère. Et puis, Hitomi va tenter de prouver ses pouvoirs magiques devant d'autres élèves.

Les journées découvertes des clubs pour les nouveaux lycéens ont commencé. Ne pouvant oublier le dessin de Yuito, Hitomi se rend au club d'art. À la demande de Yuito, elle prend un pinceau pour la première fois, dissimulant son incapacité à voir les couleurs, et se retrouve impliquée dans une séance photo. Les problèmes commencent quand Hitomi, poussée par Kurumi, devient leur modèle.

Kohaku est de retour. Très vite, elle fait une démonstration de magie impressionnante à la classe et se rapproche des membres du club de photo et d'art. Hitomi se sent intimidée tant elle est différente de sa grand-mère. Le club décide de présenter un mélange de photos et de dessins au festival culturel et se rend au lycée pour prendre des photos de nuit, mais l'atmosphère est étrange...

Quand Yuito utilise le sable étoilé offert par Hitomi, il voit un poisson doré - le même que sur le dessin qui, en primaire, lui avait valu sa première récompense. Sans savoir pourquoi, Hitomi est fascinée par cette créature. Alors que le club de magie, de photo et d'art est en pleine séance photo au Glover Garden, le poisson doré réapparaît et transporte Hitomi dans le monde d'un dessin.

Les vacances d'été commencent, mais il y a toujours un froid entre Hitomi et Yuito. Le club de magie, de photo et d'art entame les préparatifs pour leur camp d'été annuel. Pendant ce temps, Kurumi se lamente sur ses résultats médiocres à l'examen blanc. Elle reçoit des conseils de sa sœur, Ichika, qui est pâtissière, mais se retrouve encore plus inquiète qu'elle ne l'était...

L'été touche à sa fin. Alors qu'elle rentre à la maison, Kohaku est amenée à l'endroit où Hitomi avait vu des couleurs. Kohaku, qui souhaite plus que tout rendre les gens heureux grâce à la magie, peine à comprendre pourquoi le monde d'Hitomi a perdu ses couleurs. Avec l'aide de Yuito, ils tentent de recréer les évènements de ce fameux jour où elle a vu des couleurs.

Dans l'espoir de faire des progrès en photographie, Hitomi demande conseil au président Sho. Ils décident d'aller faire des photos ensemble, lors de leur prochaine journée de libre. Le jour venu, appareils photos en mains, ils se promènent d'un lieu à un autre, en prenant des photos. Après cette journée passée ensemble, au moment de se séparer, Sho fait une demande à Hitomi.

Hitomi veut se réconcilier avec Asagi. Elle prend son courage à deux mains pour aller lui parler. Asagi se met à nu. Les tensions s'apaisent, leurs véritables sentiments ayant été révélés. Quant au club de magie, de photo et d’art, il se prépare pour le Festival culturel. Kohaku suggère qu’ils fassent un numéro de dessin magique. Le groupe se transporte dans un dessin. Yuito fait une rencontre...

Le club de magie, de photo et d'art prépare le Festival culturel. Kurumi, Sho et le club de photo d'Asagi travaillent sur leur exposition. Le dessin de Yuito pour le club de magie progresse. Et Kohaku et Hitomi se concentrent sur leur magie. Mais, soudain, Hitomi disparaît de la chambre noire. Bien qu’elle soit vite retrouvée, Kohaku réalise le danger : Hitomi est tombée dans un vortex temporel.

Plus que deux jours avant la nouvelle lune et le voyage de retour d'Hitomi. Le Festival culturel débute donc sous fond de séparation, d'inquiétude et de solitude. Le spectacle du club devient vite populaire. Asagi se réjouit de la joie que ses photos apporte. Yuito découvre le bonheur de dessiner pour les autres. Le deuxième jour, Hitomi et Yuito profitent du temps qui leur reste ensemble.

C’est le moment des adieux. Après le festival, Hitomi, Kohaku et les membres du club se réunissent dans un parc voisin. Alors qu’Hitomi se prépare à partir, ils lui confient les sentiments qu’ils ont gardé dans leur cœur. Mais, alors qu’elle leur exprime sa gratitude, une anomalie survient dans le sablier de sable étoilé. Yuito essaye de la sauver et tous deux disparaissent soudainement.