Rodzina Stone wraca z wakacji samolotem. Dorosłe rodzeństwo Michaela i Ben wraz z ciężko chorym synem Bena, wybierają jednak późniejszy lot, podczas gdy żona Bena, córka i rodzice lecą wcześniejszym samolotem. Kiedy ten późniejszy lot ląduje, pasażerowie są zdezorientowani, odkrywając, że minęło pięć i pół roku. Próbują ponownie nawiązać kontakt z bliskimi, którzy opłakiwali ich śmierć i odeszli dawno temu.

Pasażerowie lotu 828 znajdują się pod kontrolą rządu i próbują wrócić do normalnego życia. Michaela jest zmuszona skonfrontować się z faktem, że Jared jest żonaty ze swoją najlepszą przyjaciółką. Do Cal podchodzi dziwna nieznajoma. Ben słyszy głosy.

Ben i Michaela badają szokujące morderstwo, które może mieć związek z Lotem 828. Ben stara się zaakceptować życie, które prowadziła Grace pod jego nieobecność. Olive i Cal zdają sobie sprawę, że bycie bliźniakami po pięciu i pół roku przerwy jest trudniejsze, niż im się wydawało.

Tajemnicze halucynacje prowadzą Saanvi do pacjenta, który informuje, że to wszystko wina stewardessy z 828. Saanvi odnajduje kobietę, chcąc dowiedzieć się, jaki jest jej związek z lotem. Ben i Grace borykają się z poważnymi problemami finansowymi. Michaela słyszy głosy, które nakazują jej przedwcześnie rozpocząć akcję.

Cal ucieka ojcu i zabiera go na tajemniczą wycieczkę, która ujawnia zdumiewające zdolności syna. Michaela stara się chronić Jareda przed konsekwencjami w pracy, jednocześnie powstrzymując swoje romantyczne uczucia.

Zatrzymani pasażerowie są potajemnie przenoszeni i poddawani bolesnym eksperymentom. Ben wykorzystuje starego przyjaciela, aby dowiedzieć się, gdzie zostali zabrani.

Ben nawiązuje współpracę z Vance w celu odnalezienia zaginionych pasażerów lotu 828. Tymczasem Michaela pomaga samobójczemu pasażerowi, który wierzy, że jest Aniołem Śmierci. Cal wraca do szkoły.

Ben i Michaela postawili wszystko na jedną kartę, aby uratować pozostałych zaginionych pasażerów. Michaela i Jared zbliżają się do siebie.

Zdeterminowany, by chronić swoją rodzinę, Ben odkrywa alternatywne znaczenie dla powołania Michaeli, które prowadzi go do nowego sojuszu i nowego potężnego przeciwnika. Walka Cal z nieobecnością Bena w domu zmusza Stone do bolesnej konfrontacji.

Wychodzi na jaw spisek z dnia zniknięcia samolotu. Michaela pomaga Autumn.

Ben odpowiada na wezwania Cala, by pomóc kapitanowi Daly'emu oczyścić jego imię. Śledztwo prowadzone przez Grace i Bena Cal prowadzi do przełomowego odkrycia.

Michaela wykorzystuje swoje umiejętności detektywistyczne, aby dowiedzieć się więcej o Zeke. Rodzina Bena jest pod wrażeniem publicznej pogardy dla pasażerów. Ben staje w obliczu przerażającego nowego zagrożenia. W międzyczasie Saanvi ma nowe informacje.

Kiedy zaginęła Saanvi, Ben podejrzewa fanatyczną grupę, która ma obsesję na punkcie pasażerów z lotu 828. Michaela musi ponieść konsekwencje swojego spotkania z Jaredem. Zeke wraca do Nowego Jorku.

Michaela spotyka tajemniczego Jamesa Griffina podczas dochodzenia policyjnego, a pasażerowie dowiadują się, co dzieje się, gdy telefony wpadają w niepowołane ręce. Tymczasem Jared dowiaduje się o Zeke, kłóci się z Michaelą i jej zaufaniem do powołania.

Ben i Michaela muszą zmierzyć się z poważnym zagrożeniem. Ben, Grace i Olive dokonują druzgocącego odkrycia.