Na povratku u New York s obiteljskog odmora na Jamajci obitelj Stone razdvojena je kada odrasle sestru i brata Michaelu i Bena, zajedno s Benovim teško bolesnim sinom Calom, prebace na kasniji let, dok Benova supruga, kći i roditelji polete prije njih. Kad taj kasniji let sleti, zbunjeni putnici otkriju da je prošlo pet i pol godina. Pokušavaju se ponovno povezati s voljenim osobama koje su davno oplakale svoje mrtve i nastavile sa životom te nastoje shvatiti tajanstveni fenomen koji ih je nagnao na djela koja ne razumiju.

Putnici s Leta 828 nalaze se pod nadzorom vlade dok se trude nastaviti sa svojim životima. Michaela je prisiljena suočiti se s činjenicom da se Jared oženio njezinom nekad najboljom prijateljicom, dok Ben pokušava pomoći suputniku da se ponovno poveže sa svojim sinom. Calu priđe opsesivan stranac, dok se Grace i Olive razilaze oko toga trebaju li otkriti razornu tajnu.

Ben i Michaela istražuju šokantno ubojstvo strahujući da je povezano s Letom 828. U međuvremenu, Ben se trudi prihvatiti život koji je Grace vodila u njegovoj odsutnosti, dok Olive i Cal shvaćaju da je biti blizancima nakon pet i pol godina razdvojenosti teže nego što su mislili.

Kada tajanstvena poruka dovede Saanvi do stjuardese na Letu 828, ona zatraži Benovu pomoć pri otkrivanju tajne o avionu. U međuvremenu, Michaela počinje preispitivati prirodu poziva kad jedan strahovito krene po zlu ostavivši Jareda da trpi posljedice.

Raspleću se priče osoba koje su se nosile s posljedicama nestanka Leta 828. U međuvremenu, u sadašnjosti, Cal vodi Bena na tajanstvenu avanturu tijekom koje Ben postaje svjestan zbunjujućih sposobnosti svog sina. Michaela pokušava zaštititi Jareda od posljedica na poslu susprežući pritom svoje romantične osjećaje.

Kad se Cal probudi s groznicom opasnom po život, Grace se brine da je to nuspojava njegova eksperimentalnog liječenja raka, ali Michaela i Ben sumnjaju da je Calovo stanje povezano s tajanstvenim putnikom s Leta 828. Kako se Calova situacija pogoršava, Ben i Michaela pokušavaju pronaći nestalog putnika.

Dok zadržane putnike potajno premještaju i podvrgavaju bolnim eksperimentima – a Calovo je zdravlje izravno povezano s njima – Ben iskorištava starog prijatelja da sazna kamo su putnici odvedeni. U međuvremenu, misteriozna nova verzija poziva uvlači Michaelu u istragu ubojstva koje za nju ima duboke osobne posljedice.

Ben sklapa neočekivano partnerstvo s ravnateljem NSA-a Vanceom u opasnoj utrci za pronalaskom nestalih putnika s Leta 828. U međuvremenu, Michaela pomaže suicidalnom putniku koji vjeruje da je anđeo smrt, a Cal se vraća u školu pokušavajući izaći na kraj sa svojom neželjenom slavom i s bivšim prijateljima koji su svi sada 16-godišnjaci.

Kada Ben i Michaela riskiraju sve da spase druge nestale putnike, misija strahovito pođe po zlu i ne izvuku se svi živi. Poražavajući rezultat gura Bena i Grace do traumatičnog ruba, dok Michaelu i Jareda opasno zbliži.

Michaelin novi, misteriozni poziv odvodi je na misiju koja njezin odnos s Jaredom dovodi do kritične točke. Odlučan zaštititi svoju obitelj, Ben istražuje alternativno značenje Michaelina poziva što ga dovodi do novog saveza i moćnog novog protivnika. U međuvremenu, Calovo neprihvaćanje Benova izbivanja od kuće prisiljava Stonese na bolan sukob koji će zauvijek promijeniti strukturu obitelji.

Ben posluša Calov poziv da pomogne kapetanu Dalyju sprati ljagu sa svog imena zbog onoga što se dogodilo Letu 828, a putovanje otkriva prividnu zavjeru koja seže sve do dana nestanka aviona. U međuvremenu, Michaela pomaže Autumn na vlastitom putu otkupljenja. No je li se Autumn zaista odlučila iskupiti ili još radi protiv putnika?

Kad se otkrije da je Cal nestao iz svoje spavaće sobe, Grace i Ben pokreću očajničku potragu koja ih vodi u udaljene planine države New York. Primamljiv trag mrvica dovodi ih do zapanjujućeg otkrića koje mijenja pravila igre. U međuvremenu, Michaela se suočava s varljivom Autumn, a napokon se pojavi misteriozni „bojnik“.

Kada Saanvi nestane, Ben sumnja na fanatičnu skupinu koja je postala opsjednuta putnicima s Leta 828. U međuvremenu, Michaela se mora suočiti s posljedicama ponovnog susreta s Jaredom. A Zeke dobije zlokoban poziv kad se vrati u New York.

Kad se Michaela susretne s tajanstvenim Jamesom Griffinom tijekom policijske istrage, putnici saznaju što se događa kad pozivi padnu u krive ruke. U međuvremenu, Jared doznaje za Zekea, što ga dovodi u sukob s Michaelom i njezinom vjerom u pozive.

U finalu prve sezone Ben i Michaela moraju se suočiti s ozbiljnom prijetnjom sigurnosti putnika kada Griffin planira iznijeti pozive u javnost. U međuvremenu, napetosti između Jareda i Zekea dosežu kritičnu točku. A Ben, Grace i Olive dolaze do razorna otkrića.