Magnum doit quitter la maison d'amis de Juliet. En parallèle, tous les deux sont sollicités par un couple qui cherche des réponses après que le frère de la femme, disparu depuis 18 ans, ait été aperçu sur l'île récemment. Les deux enquêteurs plongent alors dans une affaire mêlant vengeance et fausses identités, au cours de laquelle TC est enlevé tandis que Higgins est touchée au ventre par une balle.

Magnum, Juliet et TC se rendent au bureau de l'immigration pour répondre aux questions d'un agent qui suspecte une fraude. A la sortie du rendez-vous, tous trois se retrouvent coincés dans l'ascenseur de l'immeuble. Ils parviennent à s'en échapper, mais se rendent rapidement compte que des terroristes ont infiltré le bâtiment et pris tout le personnel en otage. Désormais seuls contacts de la police au sein de l'immeuble, ils se voient contraints d'agir.

Magnum et Higgins aident un jeune combattant d'arts martiaux à éviter un combat illégal dans lequel un gang le pousse à s'engager. Kumu est arrêtée pour avoir volé un artéfact à un collectionneur pour le remettre à sa place originelle.

Alors qu'un ouragan très puissant est sur le point de s'abattre sur l'île, Magnum et ses amis vont se réfugier à l'intérieur de La Mariana. Deux dangereux tueurs armés viennent s'abriter dans le même bar. Dans le même temps, Rick doit avouer à TC qu'il n'a pas renouvelé son assurance catastrophe naturelle.

Un riche homme d'affaires engage Magnum et Higgins pour retrouver sa femme disparue. Puis ils découvrent avec stupéfaction qu'une tragédie se produit à la suite de leur enquête. Dans le même temps, la suspicion de Kumu à l'égard du petit ami de sa belle-fille crée un fossé entre elles, alors que Kumu tentait d'établir une nouvelle relation avec elle.

Deux hommes soupçonnent leur voisin, un professeur d'université, d'être un meurtrier après l'avoir vu sortir une femme de son coffre, laquelle d'après eux se trouverait encore chez lui. Higgins et Magnum mènent donc l'enquête et se retrouvent au coeur d'une affaire sordide.

Ethan attend Higgins et Magnum à l'hôpital. Il a une mission urgente à leur confier. Le médecin a examiné un jeune patient, Paul Wilson, atteint d'un pneumothorax. Les radios ont révélé la présence d'un étrange objet métallique dans les poumons de Paul. Ce dernier s'est enfuit de l'hôpital sans faire son scanner. Sans intervention chirurgicale dans les plus brefs délais, Paul pourrait mourir en quelques heures. Par ailleurs, à la demande de son ami Mitch, TC vient parler de son expérience auprès des futures recrues des Marines. Il sympathise avec Joey, originaire de Caroline du nord, tout comme lui. Mais TC a des doutes sur les motivations du jeune homme.

Lorsque Higgins est enlevée par un mystérieux ravisseur, Magnum découvre que l'un de ses anciens clients, qu'il avait mis en prison, a décidé de se venger de lui. En parallèle, Suzy, la nouvelle employée du restaurant de Rick qui est amoureux d'elle, fait le premier pas et invite ce dernier à danser.

Higgins profite de quelques jours de vacances dans un hôtel d'Oahu avec Ethan. Mais un des clients de l'hôtel leur demande de l'aide pour retrouver la bague de fiançailles qu'il devait offrir à sa petite amie. De son côté, Magnum est engagé par une jeune femme qui a découvert une enveloppe remplie d'argent sur son pare-brise. L'écriture semble être celle de son mari, or ce dernier est supposé être en opération en Afghanistan et ne doit pas rentrer avant plusieurs semaines.

Une femme fait appel à Higgins et Magnum pour enquêter sur le meurtre dont elle a été témoin. La victime est son amant. Pour cette raison, elle refuse d'aller voir la police, un choix qui fait s'opposer les deux opinions de Magnum et Higgins. Rick quant à lui rend visite à son vieil ami Pic à glace en prison, mais l'état de santé de ce dernier est très alarmant et ses jours sont comptés

Magnum et Higgins, pour retrouver un chien, doivent d'abord retrouver la voiture volée dans laquelle il se trouve. Ils découvrent rapidement que le voleur de la voiture tentait d'échapper à de dangereux truands, mandatés par un milliardaire chinois à la recherche d'une chose très particulière... Dans le même temps, TC, victime d'une fausse plainte en justice, demande l'aide de Jin, lui-même escroc notoire, pour déjouer ce piège.

Magnum et Higgins découvrent un bébé abandonné devant le portail du domaine et se lancent à la recherche de sa mère. Dans le même temps, Kumu tente de retrouver la mère du nourrisson. Parallèlement, une compagnie d'assurances leur confie une mission un peu particulière : retrouver les truffes blanches volées dans un restaurant, dont la valeur avoisine les 250 000 dollars...

Un nombre important de bijoux est trouvé sur le bas-côté de la route, accompagné d'un mot mentionnant Kumu. Katsumoto interroge cette dernière. Cette enquête reviendra sur le passé de Kumu ainsi que celui de son cousin, avec qui elle n'a désormais plus aucun contact. En parallèle, Sylvia, une voyante, fait appel à Higgins et Magnum pour enquêter sur un meurtre qui n'a pas encore été commis…

TC décide d'enquêter sur la mort d'une randonneuse après l'avoir aperçue depuis son hélicoptère avant sa mort. Magnum, quant à lui, accueille son oncle Bernardo. Celui-ci, venu lui demander d'être son témoin de mariage, lui fait une révélation choquante à propos de sa mère…

Jin parvient à emprunter la Ferrari de Magnum afin d'impressionner les investisseurs de son nouveau projet professionnel. Mais rien n'échappe à la vigilance d'Higgins qui peine pourtant à se concentrer sur leur nouvelle affaire après sa rupture avec Ethan. L'enquête que mènent les deux associés concerne un harceleur. En effet, Chloé, une amie de Kumu, se sent suivie depuis quelques semaines, ce qui l'inquiète, surtout depuis qu'elle a découvert un traqueur GPS dans sa voiture…