De sista återstående människorna kämpar för att överleva i skuggan av BRAI, ett väsen i gränslandet mellan livsform och AI som ständigt utvecklas.

Jay beordrar motvilligt Leon att fortsätta med forskningen på det instabila hyperdriftssystemet i hopp om att det ska leda till ett strategiskt övertag över BRAI.

Leon känner sig ansvarig för reaktorolyckan och erbjuder sig att ställa sig på frontlinjen när en ny sorts BRAI hotar att förstöra staden.

När ett fraktplan förstörs av en okänd kraft misstänker Leon att en flygande, fågellik BRAI ligger bakom.

Queenie Yoh är svårt skadad efter striden mot lärjungen Wang, och måste ta sig upp i skyarna för att slåss mot en bevingad BRAI som han kontrollerar.

Leon klär upp sig för att åka till staden, och Chloe följer efter honom. Hon tror att han är kär i någon, men han försöker spåra ett märkligt fenomen.

När flera personer i staden dödas av projektiler måste Leon och Pandora-teamet hitta mördaren innan fler offer skördas.

Pandora-teamet kämpar för att hitta den skyldige när en i gruppen skadas. Cain berättar historien om en ökänd krypskytt som lät honom leva.

Den motsträvige mr Gold lovar att störta Cecile och ta över staden. Gren vill desperat hjälpa till och ber Leon att installera ett till hyperdriftsystem i hans MOEV.

Efter att ha testat det mörka element som verkar påskynda utvecklingen hos BRAI minns Leon sin forskningsledare som omkom i reaktorolyckan.

När en dödlig smitta sprider sig utanför staden måste teamet välja mellan att skydda staden och att ta emot de flyktingar som strömmar in.

Reaktorn är farligt instabil efter flera attacker från BRAI, och Leon tror att det kan bero på en läcka i reaktorns inre.

Samtidigt som ingenting fungerar som det ska måste teamet stoppa en BRAI som påminner om en tusenfoting, och som har förstört flera viktiga anläggningar utanför staden.

Biverkningarna från hyperdriftssystemet börjar ta ut sin rätt, och Leon tar med sig teamet till sin gamla lya så att de kan reparera sina skadade MOEV.

Kampen om kontrollen över staden får ett dramatiskt slut. Den mystiske Sieg, som är Golds rådgivare och bundsförvant, visar sig för den utmattade Leon.

Medan Cecile återhämtar sig från sina skador ser Jay till att Queenie tar Ceciles plats, och lär henne att se ut och bete sig precis som borgmästaren.

De senaste BRAI-attackerna har lett till svår livsmedelsbrist, och Pandora-teamet måste eskortera en leverans till staden.

Medan Leons skador läker börjar de Pandora-medlemmar som använder hyperdriftssystemet att uppleva ett konstigt fenomen.

När en mystisk kraft ödelägger en närliggande stad måste teamet på något sätt förhindra att deras egen stad går samma öde till mötes.

Doug får kontakt med en mystisk BRAI, och frågar sedan Leon om deras personligheter kommer att förändras när de blir ett med sin MOEV.

Leon och Queenie ger sig ut för att leta efter den försvunna Fiona, vars krafter behövs för att kontrollera reaktorkärnan.

En svärm biliknande BRAI närmar sig staden, men Leon tror inte att de är fientligt inställda och ber Grens förband att avvakta.

Medan Leons tankar vandrar mellan olika dimensioner överväger Fiona att ge sig in i hans medvetande för att befria honom.

När Siegs ondskefulla planer börjar ta form förbereder Cecile och Pandora-teamet ett sista uppdrag – att rädda världen.

Leon och Pandora-teamet gör sig beredda på en sista strid, då Siegs ultimata manifestation korsar stadsgränsen.