Después de que el padre de Rachel, Trigon, oscureciera con éxito a Dick, se propone ganar a los demás a su lado abrazando su oscuridad interior. Con todos bajo su control, Rachel y Gar se encuentran luchando con lo que parece una batalla sin esperanza contra los poderes de Trigon.

Mientras Dick entrena a la próxima generación de Titanes, Donna y Kory rastrean a un metahumano corrupto. Pero una vieja amenaza hace que los Titanes, viejos y nuevos, vuelvan a estar juntos.

Con la reaparición del Doctor Luz, los viejos Titanes regresan a regañadientes a la torre de Titanes para elaborar una estrategia contra su viejo enemigo. Pero los secretos del pasado de los Titanes amenazan con destrozar este equipo recién formado desde dentro.

Hace cuatro años, Dick, Donna, Hank & Dawn formaron a los Titanes con Garth, también conocido como Aqualad. Pero el equipo se prueba con la llegada de un nuevo villano.

Con el equipo agitado, los Titanes hacen todo lo posible para salvar la vida de Jason. Pero cuando Deathstroke exige que entreguen a Rose, el dilema amenaza con destrozar al equipo.

Conner Kent y Krypto escapan de Cadmus Labs. Su búsqueda de la verdad sobre su pasado lo lleva a Lionel Luthor y al científico genético Dr. Eve Watson.

Mientras Dick sale solo para rastrear a Deathstroke, una voz familiar comienza a perseguirlo, burlándose de él e intentando guiarle de vuelta para ser el líder que necesitan los Titanes.

Después del asesinato de Aqualad, Dick, Donna, Dawn y Hank se hacen amigos de Jericho Wilson, el hijo de Deathstroke. Al darse cuenta de que la devoción de Slade por su hijo podría ser la única debilidad de Deathstroke, Dick está ansioso por usar la información contra su némesis.

Después de la confesión de Dick el mundo de los Titanes se rompe en mil pedazos y el miedo de Dick de que su secreto rompa al equipo se hace realidad. Todos los héroes siguen su propio camino tras abandonar la torre de los Titanes. Hank y Dawn regresan a Wyoming, Jason y Rose se van juntos y Donna accede a llevarse a Rachel. Kory, mientras tanto, se sorprende al oír de Faddei, que ha vuelto con malas noticias de su planeta. Dick se marcha también, buscando absolución por la muerte de Jericho, dejando solo a Gar cuidando del todavía malherido Conner.

Dick es enviado a prisión. Donna busca a Rachel, que ha hecho nuevos amigos. La Torre de los Titanes es atacada por Mercy Graves.

Con Dick todavía en prisión y Gar bajo el microscopio en Cadmus, los Titanes restantes se reúnen para salvar a sus compañeros de equipo. Mientras tanto, Jason y Rose se relacionan en Gotham. A medida que Mercy Graves hace un gran avance con su "Proyecto Rakshasa", Dick tiene su propia revelación.

Mientras Hank está ocupado luchando en la jaula después de romper con Dawn, alguien roba el traje de Halcón. Donna y Dawn encuentran la manera de rescatar a Gar de las instalaciones de Cadmus. Rose revela su secreto a Jason. Dick escapa de la prisión para encontrar a Jericho.

Los Titanes se reagrupan con Dick, quien ha asumido el manto de Nightwing, para luchar contra Deathstroke e intentar salvar a Jericho. Pero esa no es la única lucha que enfrentan, ya que el equipo se topa con versiones alteradas mentalmente de Gar y Conner, que ahora son armas sobrecargadas a merced de Mercy Graves y el final de su plan Fase Dos de Cadmus. Es Titanes vs. Titanes en este épico final de la segunda temporada que estará lleno de sorpresas.