En 1808 España sufre la invasión francesa. En la Nueva España Francisco Azcárate, Francisco Primo de Verdad y Fray Melchor de Talamante presentan ante el virrey José de Iturriaga, la creación de un gobierno autónomo, el cual es rechazado.

Josefa Ortiz de Domínguez, esposa del corregidor de Querétaro participa en una conspiración contra el gobierno español, entre las personas que la acompañan Ignacio Allende, Juan Aldama y Miguel Hidalgo, pero muy pronto se verán descubiertos.

Juan Aldama llega a la casa del cura Hidalgo, para informarle que la conspiración ha sido descubierta, y que existe una orden de aprehensión en contra de todos los involucrados. Debido a esto, Hidalgo decide tomar las armas y convocar al pueblo.

Tras el movimiento de Hidalgo, la ciudad de Guanajuato es tomada por los rebeldes. Los ricos, comerciantes y españoles se encuentran atrincherados en la alhóndiga de Granaditas. Mientras la casa de la familia Alamán será testigo de la guerra y la muerte.

Durante la batalla del Monte de las Cruces, las fuerzas de Hidalgo y Allende sufren grandes bajas. Aldama y Mariano Jiménez fueron enviados a una negociación fallida con el virrey.

En 1811, Hidalgo cae preso en Chihuahua por las fuerzas realistas. Dentro de la prisión hace buena amistad con un joven carcelero, Miguel Ortega, con quien forja una fuerte amistad y se convierte en su fiel escucha de reflexiones, confidencias y temores.

El general José María Morelos y Pavón se refugia en Cuautla donde reorganiza a su ejército. Mientras, el virrey Venegas envía al implacable general Félix María Calleja para capturarlo.

José María Morelos y Pavón es capturado así como sometido a juicio militar y eclesiástico en el edificio de la Inquisición. De ahí se revelan momentos fundamentales de Morelos como político y militar. Durante el juicio es condenado a muerte, además de degradación sacerdotal.

Leona Vicario es una joven huérfana de alta sociedad quien simpatiza con la causa independentista. Su tío Don Agustín Pomposo descubre su relación amorosa con Andrés Quintana Roo, y sus vínculos con el movimiento de independencia, por lo que decide denunciarla.

Tras la muerte de Francisco Javier Mina, uno de los últimos insurgentes, Vicente Guerrero continúa su lucha en el sur del país. El virrey Juan Ruiz de Apodaca comienza a conceder indultos a diversos rebeldes de la causa insurgente, pero ante las negativas de recibir el indulto, Vicente Guerrero es perseguido para derrotarlo.

Después de la proclamación del Plan de Iguala y el casi inminente triunfo de la lucha por la independencia en 1821, el general Guadalupe Victoria es encontrado por un grupo de pobladores, cerca de la selva de Veracruz, después de haberse perdido tres años atrás.

Agustín de Iturbide regresa a México, luego de su exilio en Europa. El Congreso aprueba un decreto, donde se declara al exemperador traidor a la patria, y se autoriza darle muerte. Guadalupe Victoria es electo como el primer presidente de México, bajo una Constitución Federal, así inicia la República.