Thomas giace in ospedale in coma, intrappolato tra la vita e la morte. I suoi amici e la sua famiglia cercano di riportarlo sulla terra dei vivi, ma una volta ritornato nel mondo reale, trova difficile affrontare ciò che è accaduto. Nel frattempo, dei killers che gli hanno teso l'agguato, tre sono morti, ma uno è ancora vivo e in libertà.

Ancora turbato dalla sua recente esperienza extracorporea, Magnum riceve un altro shock quando Higgins comincia a comportarsi in modo bizzarro, trascurando i suoi impegni alla tenuta, diventando spericolato e irresponsabile. Dal canto suo Thomas sembra assumere la rigida personalità che contraddistingue il severo maggiordomo, fino al punto di indossare giacca e cravatta. Indagando sull'improvvisa follia di Higgins, Thomas scopre che la causa di tutto è una donna, ma il detective teme che la signora in questione stia imbrogliando il suo amico.

Masters viene denunciato da un uomo che è stato ospite di recente al Nido. Indagando Magnum scopre che il tizio è un abile truffatore ed è noto per le sue denunce strombazzanti. Durante le indagini, Thomas è affiancato da una giovane donna, fidanzata di un ricco uomo d'affari cliente di T.C. che ha pagato Magnum per soddisfare la curiosità della sua ragazza sul mestiere dei detective. Purtroppo il caso si complica quando il truffatore viene assassinato e i due si ritrovano coinvolti con un losco individuo appartenente alla mafia.

Il Tenente Tanaka viene assassinato mentre stava lavorando sotto copertura. Il rapporto ufficiale della polizia afferma che il tenente è morto in un incidente d'auto, ma Thomas è convinto che sotto ci sia dell'altro.

Magnum sta portando a termine una commissione al museo per conto di Higgins, che sta organizzando una sfilata per la Società Storica Anglo-Hawaiana. Durante il tragitto, Thomas assiste a un funerale e coglie lo sguardo di una splendida fanciulla, che assomiglia incredibilmente a una principessa Hawaiana morta nel 1910. Magnum rimane affascinato dalla visione e comincia a fantasticare sulla principessa e se stesso in uniforme navale del 1900. Il mistero si infittisce quando Thomas riceve un pacco contenente l'uniforme navale da lui sognata e un medaglione con dentro la foto della principessa.

Magnum sta cercando di proteggere Carol, che si trova nel bel mezzo di un caso controverso, ma viene assunto da una donna che lo ingaggia per ritrovare un certificato di nascita risalente a 30 anni prima, certificato inerente al neonato che diede in adozione anni prima. Indagando su questo caso, Thomas scopre delle verità sulla vita personale di Carol che potrebbero cambiarle la vita per sempre.

Magnum viene assunto da una donna attraente per ritrovare il testamento scomparso di suo padre, di recente ucciso in un incidente nautico molto sospetto. Indagando sul caso, Thomas s'imbatte in una vecchia conoscenza, Susan Johnson, la quale si è lanciata nell'attività di detective e sta seguendo il caso per conto del fratello della cliente di Magnum. I due P.I. fanno a gara per vedere chi la spunta per prima, ma Thomas e Susan devono mettere da parte la loro rivalità per risolvere il caso.

Magnum si prepara per il processo di Quang Ki, che ha cercato di uccidere lui e la sua famiglia. Il caso viene sorprendentemente prosciolto e Magnum, giustamente adirato, sospetta che ci sia qualcun'altro dietro la subitanea liberazione di Quang Ki. Appare evidente che Quang Ki non si fermerà davanti a nulla pur di uccidere Thomas e la sua famiglia.

Higgins ingaggia Magnum per ritrovare un antico e inestimabile manoscritto di una civiltà scomparsa, che in mani sbagliate potrebbe causare danni enormi. Ma i due non sono gli unici sulle tracce del manufatto e devono vedersela con un'ex fiamma di Thomas, un crudele rivale di Higgins e un cammino periglioso che potrebbe portarli alla morte.

Higgins chiede a Thomas di recuperare l'ultimo manoscritto di Robin Masters che è stato rubato. Magnum riceve l'aiuto inaspettato di Luther Gillis, arrivato sull'isola per una vacanza. I due detective cercano di scoprire chi è che ha tentato di uccidere Higgins e drogare i suoi 'ragazzi' pur di rubare il manoscritto.

Thomas si trova in visita in Virginia presso la famiglia e comincia a pensare al suo futuro. Dopo un incontro con suo nonno, Thomas considera l'idea di tornare in Marina. Tornato alle Hawaii, Magnum si occupa della sua ex ragazza, Linda Lee Ellison, che sta subendo le attenzioni indesiderate di uno stalker. Nel frattempo Rick sta organizzando il suo matrimonio con Cleo. Thomas è convinto che sua figlia Lily si ancora viva.

Il matrimonio di Rick si avvicina e Thomas continua a sorvegliare Linda per catturare il killer psicopatico che la sta molestando. T.C. si riconcilia con sua moglie mentre Thomas scopre degli indizi sulla sua teoria che Higgins e Robin siano la stessa persona.