医疗船是士兵最不想被分派到的服役场所，而今天，韩国有名的无国界医生郭成的儿子郭贤竟自愿当医疗船的医生。首尔大韩医院医生宋恩彩手术技术高超，这天接收了集团继续人的患者，可是功劳都被上司抢去，而自家母亲不断让认识的人去找自己看病，上司给了眼色她看。

　　恩彩妈妈因为伤食科拜访了医疗船诊症，医生请了恩彩妈妈做一次详细的心脏检查，于是恩彩妈妈到了恩彩的医院，可是因为恩彩大发脾气，恩彩妈妈没做检查就回去了。不久，恩彩就接到恩彩妈妈失去意识和呼吸的消息。

　　船上一位小孩得了腹膜炎要立刻施手术，可惜医疗船上根本没有手术室的设备能替患者做手术，这时恩彩来到，她决定用船上仅有的牙科的工具，在牙科椅子上做开腹手术，最后恩彩成功救活患者。全医疗船上的人都对恩彩的身份感好奇，后来才得知恩彩本来是陆地医院上有名的外科医生，可究竟她为什么要来到医疗船来呢。

　　恩彩强行在不能接收病人的巨济第一医院做了手术，她高超的技术受到院长赏识，院长更亲自邀请了恩彩在急症室做事。事后，院长打到首尔问了恩彩的事，才得知恩彩早前发生过医疗事故，医死了病人，院长立即解雇了恩彩。恩彩的过去传遍医疗船，船长也下令赶走恩彩。

　　宋恩彩与郭贤在船难中遇到正浩，而他的手腕断了，一个船夫没有了手腕，那他等于是死了，可是宋恩彩却把手弄断了，原来因为只有断了才能重新接上。

　　宋恩彩他们尽了全力，但是最后人却在手术中死亡了。院方决定因为以并发症而体力低下的原因来解释。可是宋恩彩却认为在手术中没能坚持住不是单纯因为并发症而死亡的。

　　郭贤的爸爸在船上，就算一家人都讨论他，郭贤仍坚决照顾爸爸。朴兀林婆婆必须接受肝移植手术，但她坚持要出院，宋恩彩就放她走。郭贤得知后，四出找朴兀林婆婆。

　　金在杰医生等人在陆地上和朴兀林婆婆治疗，但宋恩彩知道后要求他们停止。宋恩彩单独说服婆婆做手术，更和郭贤找来婆婆的女儿。最终，朴兀林婆婆手术成功，也和女儿和好。

　　刘雅琳护士想进入手术室，成为梦想中的洗手护士，宋恩彩竟答应让她尝试。医疗船上遇到一名双脚是血的患者，但受伤地方竟是男人最痛的地方，而患者又竟是刘雅琳护士的男友。

　　薛季灿患了直肠癌晚期，各位医手都说无能为力，只有宋恩彩医生提出原位肝移植术。但此手术从未在活人身上试验过，医生们都纷纷拒绝。唯有宋恩彩医生坚持。

　　宋恩彩认为郭贤没有权力决定接不接受这手术，只有薛季灿才可决定。郭贤的关心让薛季灿回想起当年老婆患癌时时的治愈，令他非常后悔。若薛季灿回心转意进行手术，金道勋要求宋恩彩用他的名字发表论文。

　　薛季灿出院后，一直未有联络医院进行手术，于是宋恩彩出面说服，但薛季灿心意已决，活得一日得一日。没有答应动手术的薛季灿打算捐献遗体，为宋恩彩的研究出份力。

　　郭贤找到了遇难的小灿，却因为内疚而发挥不了医术，宋恩彩前来鼓励他，最后成功救出小灿。郭贤带来薛季灿去找他爸爸，希望可唤醒爸爸的记忆，可是原来他已想起来了。

　　郭贤的爸爸要求他签禁止进行心肺复苏的同意书，就算可以救活也不要救，可是郭贤却安心了。郭贤与宋恩彩因为这次事件关系变得亲密了，可是宋恩彩却拒绝了郭贤。

　　英恩来到医疗船，四处向人公布郭贤是自己的未婚夫。郭贤得知后竟走向宋恩彩，问她为什么不在意。同时，英恩要求搬到郭贤等人的宿舍，更与宋恩彩同房。

　　在杰妈妈来到医疗船，打算劝在杰回去。交谈其间，宋医生发现了她有心肌梗塞。面对亲人，在杰无能为力。最终宋医生成功为在杰妈妈做手术，同时，在杰对宋医生的感情起了变化。

　　在杰、宋恩彩和郭贤因为在杰的恩人的病情而争执，由于种种的原因令到手术十分困难，可是如果甚么都不做，患者更会因为败血症去世的，可是就算做了局部麻醉，剖开肚子也很危险。

　　郭贤看见在杰与宋恩彩的互动，而感到不快。可是他知道他们之间有一个心结，宋恩彩总是能把郭贤爸爸带到他身边，可是他从她身边抢走了妈妈。

　　英恩批准郭贤爱宋医生，不过要两年后。原来英恩得了急性骨髓性白血病，可能只有两年的命。宋恩彩弟弟因在地盘现场受了伤，宋宇在因而认识了郭贤，原来宋宇在因为把钱都给了爸爸，所以要打工。

　　恩彩被邀请了参与了院长的家庭聚会，更遇到了在杰，在杰知道他爸爸想拉拢恩彩的意思，便给了暗示恩好。恩好的爸爸进院了可是郭贤却被叫到他的病房。

　　恩彩父亲叫郭贤在他的诊断书上作假，好让他得到保险金，此时恩彩听到了出言阻止。恩彩为不中用的父亲感伤心失望，也为在郭贤面前显露自己的狼狈不堪而痛哭。另一方面，郭贤得知英恩想放弃治疗而担心不已。

　　恩彩拜托金道勋医生替父亲做手术，但金医生以病患太多为由推搪。恩彩接到宇在电话说爸爸突然病情恶化，可是自己未能赶回爸爸身边，变得软弱的恩彩只能拜托郭贤照看。恩彩决定亲自为爸爸动刀，此消息传遍医疗船，大家都表示愿意帮忙。不久，手术天就来了。

　　恩彩打算开始爸爸的手术时，在手术室发现金道勋医生也在，金医生表示会做这场手术，并赶走了恩彩。长达12小时的手术，作为监护人的恩彩等待期间也十分焦急。在手术完成后，恩彩和金医生谈了一会儿，二人都明白自己都是同类人，都是享受救活患者的乐趣的人。

　　水手长带了兄弟一起上门找地下钱庄，吓得医疗船全人都以为会出事。水手长强悍得让人吃惊，不单打倒地下钱庄，还逼地下钱庄减去了恩彩的负债。医疗船回归日常，在呼吁市民打疫苗的日子里，一天接到紧急电话说潜水员全身麻痹了。

　　全身麻痹的潜水员婆婆被恩彩和郭贤救回来，本以为这位婆婆很大机会不能再走路，但当婆婆见到朋友的那一刻，婆婆挣扎了一会儿，就站起来了。在杰约了恩彩一起吃饭，二人讨论了恩彩的恋爱对象，在杰质问恩彩为何要对郭贤隐瞒英恩不是白血病一事。

　　瑾子阿姨患上谵忘和出现严重脱水，郭贤极力抢救的同时，收到疗养院电话，得悉父亲又不见了，惜他无法分身过去寻找父亲。郭贤唯有打给妈妈帮忙，幸而最后终于找回父亲。

　　在杰再次向恩彩问为甚么喜欢的对象不是他，恩彩直接向在杰打枪。当在杰向郭贤说出这件事时，郭贤没有太大反应，反而想和恩彩的关系顺其自然的发展。另一边厢，有一群黑帮受伤，他们强行上了巨济号，并指定要恩彩为他们的大哥治病。

　　恩彩和郭贤被黑帮挟持上岸救他们的黑帮头目，恩彩和郭贤看到患者后要求带患者登上医疗船进行手术，因为岸上根本没有足够设备。黑帮不虞有诈，警告恩彩和郭贤若敢耍花样，将会杀掉医疗船上所有人。

　　恩彩和郭贤总算成功完成手术，救活了黑帮头目，可惜其余那些黑帮却不肯释放船上的人，而且还要挟要带恩彩离开。就在黑帮想离开船之际，水警来了，黑帮大怒下开枪，而郭贤竟不幸中枪。

　　郭贤的手术完成后，恩彩一次都没有来探望。直到郭贤完全康复，回到医疗船，郭贤才知道恩彩一直忙于处理郭贤的患者，郭贤于是决定告白。

　　医疗船接到一名脐带脱垂的孕妇病人，要马上剖腹产子才能救下母子二人，可是恩彩是外科医生，亦没有参与过生产的手术。而海上有大雾，海警等都没法出动，眼见母子二人性命攸关，医疗船又没有对应新出生婴儿的设备，恩彩和大家要怎样面对。

　　斗星会长打算尽快通过远程医疗法案，让医疗保健市场赚个盆满砵满。由于医疗船是最大的妨碍因素，会长布下了饵设局铲除医疗船。脐带脱垂的黄仁敬产妇诞下的早产儿出现呼吸衰竭和发烧，有律师主动接触黄仁敬，传达了早产儿现时有问题是因为那场手术不是由产科医生所做而造成的悲剧。不久，恩彩就接到警局电话说有人举报她的医疗过失。

　　恩彩为了保住医疗船，打算背负一切，向警察说了抽吸是自己做的谎。恩彩找了黄仁敬监护人确认当时的情况，黄仁敬则以律师说不要和恩彩说话为由拒绝，恩彩查出律师和斗星有联系。斗星会长找了金院长讨论医疗船的医疗事故，金院长面对在急症室和医疗船选一的选择题。

　　金院长正式对外宣布医疗船运行会暂时中断，此后还有可能停止营运，船上各人听到消息后都十分忧心。郭贤和恩彩约会，郭贤知道恩彩为医疗船的事逞强，鼓励恩彩向好的方面看。政府终于派人来收走医疗船，众人看着医疗船缓缓驶离他们的海域。

　　恩彩回到巨济医院收拾细软时，突然遇到医疗船事务长的妻子出现事故要施手术的状况，恩彩不忍心放下事务长的妻子，于是打算出手相救，可惜此时院长来到阻拦恩彩，并命她立即离开。

　　斗星向金院长要求辞去宋医生，并接受斗星的投资，金院长十分为难。宋医生坚决为了患者，为大家做手术，幸得到金院长的支持，但医院现在却面临倒闭危机。

　　得到宋恩医生和郭医生的坚持，患者都成功保住性命。而且二人得到公开撤销他们的投诉。医疗船得已重开。各医生重鄐投入自己的岗位，而且医疗船越来越兴盛。

　　宋医生本以为脚骨布问题，后来发现原来是癌症，而且此癌症的存活率不高。宋医生一个人在手术室十分痛苦。郭医生看到宋医生的信，以为宋医生是想去英国进修，反而大力鼓励宋医生离开他。

　　宋医生辞了职，大家都以为她去了英国，原来她只是留在韩国治疗。郭医生一直也找不到在英国的宋医生，开始怀疑起来，最后才知道宋医生患癌了。走向宋医生的郭医生，陪她走进手术室。