Merlin, az ifjú varázsló abban a reményben érkezik Camelot-ba, hogy itt majd új kalandok várnak rá és titkolt képességét, a mágiát is kamatoztathatja. Sajnos, hamar rá kell döbbennie, hogy mágiahasználatért halálbüntetés jár Uther király birodalmában. Azonban miután találkozik a sárkánnyal és Gaius-sal, világossá válik előtte a sors által rászabott feladat: Arthurt, Uther király fiát, a birodalom trónörökösét kell védelmeznie a rá leselkedő veszélyekkel szemben.

Camelot évente megrendezésre kerülő kardvívó bajnokságára a birodalom minden részéről érkeznek lovagok, hogy versenyezzenek az áhított bajnoki címért. Merlin felfedezi, hogy Valiant lovag csal és egy mágikus pajzszal sebzi halálra ellenfeleit. Megpróbálja figyelmeztetni környezetét, ám süket fülekre talál – pedig Valiant soron következő ellenfele Arthur herceg.

Halálos kór terjed Camelot-ban. Gaius rájön, hogy a város vízkészletét megmérgezték. Uther király őrizetbe veszi Gwen-t és halálra ítéli boszorkányság vádjával. Mivel olybá tűnik, a varázslat lehet az egyetlen lehetséges magyarázat a mérgezésre, Merlin és Gaius versenyt futnak az idővel, hogy megtalálják a megoldást. Senki sem sejti, hogy mindez egy gyönyörű, gonosz boszorkány, Nimueh műve.

Camelot ünnepséget rendez a Mercia-i királysággal való egyesülése alkalmából. Nimueh cselédlánynak kiadva magát előadja Merlinnek, hogy a merciai Bayard meg akarja mérgezni Arthurt. Merlin megpróbálja ezt megakadályozni, de a dolgok szerencsétlen összjátéka folytán ő iszik a mérgezett kehelyből. Halálosan megbetegszik és kómába zuhan. Arthur bemerészkedik Balor erdejébe, hogy megtalálja a méreg ellenszerét, anélkül, hogy sejtené, ő is Nimueh csapdájába sétál.

Lancelot épp időben érkezik Camelot erdejébe, hogy kimenekítse Merlint egy griffmadár karmai közül. Merlin ég a vágytól, hogy meghálálja a bátor cselekedetet, ezért megpróbál segíteni a merész harcosnak álmai valóra váltásában, aki Camelot lovagja szeretne lenni. Azonban van egy bökkenő: Lancelot nem mesesi származású. Eközben a repülő bestia Camelot felé veszi az irányt és a városnak most még nagyobb szüksége van hősökre, mint valaha.

Egy fiatal lányt és apját megtámadja egy zsiványokból álló banda. Arthur és Merlin a segítségükre sietnek. Arthurt lenyűgözi a lány szépsége és felajánlja nekik, hogy szálljanak meg Camelot-ban. Merlinnek rendkívül gyanúsak az új jövevények és nem ő az egyetlen. Arthur hamarosan teljesen a fiatal lány, Sophia befolyása alá kerül. Morgana borzalmas rémálomból ébred, melyben egy lány megöli Arthurt. Rádöbben, hogy a lány az álmából nem más, mint Sophia…

Camelot katonái megpróbálnak elkapni egy druida férfit és kis tanítványát. Az őröknek sikerül elfogniuk a druidát és a kisfiú magára marad. Merlin meghallja a fiú telepatikus segítségkérését és Morgana-hoz fordul, aki elrejti a gyermeket Uher katonái elől. Uther bejelenti, bárki is rejtegeti a kis druidát, az illetőnek kegyetlen bánásmódban lesz része. Morgana-nak vissza kell csempésznie a kisfiút az övéihez, miközben az őrök a gyermek után kutatva mindent tűvé tesznek Camelot-ban.

Titokzatos fekete páncélos lovag érkezik Camelot-ba. Kesztyűjét a padlóra dobva halálos küzdelemre hívja ki Camelot lovagjait. A páncélos lovag megállíthatatlannak tűnik, könnyedén elbánik ellenfeleivel. A lovag érkezése felfed egy titkot a múltból, melyet Uther király mélyen eltemetve hagyna. Vajon ki ez a lovag és le lehet győzni egyáltalán?

Merlin faluját megtámadja egy rablóbanda, melynek vezére a kegyetlen Kanen. Ealdor falu Camelot határain kívül esik, ezért Uther nem tesz semmit, nehogy a beavatkozással háborút robbantson ki. Merlin hazaindul megvédeni faluját. Arthur, Gwen és Morgana is csatlakoznak hozzá. Merlin nagyon nehéz döntés előtt áll: felfedje varázstudományát Arthur előtt a faluja megmentése érdekében?

Arthur elejt egy unikornist. A király és a lovagok is éljenzik a herceget a rendkívüli trófea megszerzéséért. Az egyszarvú leölésével Arthur, ha akaratlanul is, de átkot hoz Camelot-ra. A mítikus várost éhínség és szárazság sújtja. Egyre fogy az idő az átok feloldására. A titokzatos Anhora, az egyszarvúak őrzője, elmondja Arthurnak, hogy a herceg a felelős a történtekért és csak egyedül ő képes az átok megtörésére. Ehhez Arthurnak próbák sorát kell kiállnia. Ha elbukik, azzal Camelot pusztulását okozza.

Gwen apja, Tom tudtán kívül segít egy Tauren nevű varázslónak, hogy az ólmot egy varázskő segítségével arannyá változtassa. Tauren elszökik, Tom-ot letartóztatják és árulással vádolják. Gwen-t keresve Morgana megtalálja a mágikus követ, melyet Merlin is érzékel. Arthur és Morgana pártfogása ellenére Uther hajthatatlan, Tom-ot bíróság elé akarja állítani, és ha bűnössége bizonyosságot nyer, kivégeztetni. Morgana segít Tom-nak megszökni, de tragédia történik; Morgana elhatározza, hogy bosszút áll Uther-en. Merlin döbbenten fedezi fel, milyen messzire képes elmenni Morgana, mikor fültanuja lesz egy párbeszédnek a király meggyilkolásáról. Merlin-nek döntenie kell – megpróbálja megakadályozni a merényletet vagy csak ül ölbetett kézzel és hagyja megtörténni az eseményeket?

Arthur egy vadászaton szembekerül egy hatalmas erejű teremtménnyel, melyhez foghatót még soha senki sem látott. Gaius a leírás alapján rájön, hogy a lény a baljóslatú csahos szörnyeteg, melyet csak mágiával lehet megölni és a harapása halálos. Uther nem hallgat Gaius-ra és kiküldi lovagjait a lény ellen. A szörny elleni harcban Arthurt megmarja a bestia és élete egy hasjzálon függ. Merlin a nagy sárkánytól kér tanácsot. A sárkány útmutatása alapján Merlin-nek az Áldottak Szigetére kell mennie, ahol az ősi vallás képviselőinek hatalmában áll megmenteni a jövendő királyt. Azonban ennek ára van. Egy élet megmentéséért egy másik élet az ár. Vajon milyen áldozatot kell hoznia Merlin-nek?