Al suo arrivo a Camelot, dove è stato mandato dalla madre per iniziare una nuova vita, il giovane mago Merlino si ritrova in un luogo dove la magia è punita con la morte. Quando scopre il Grande Drago, però, il suo destino risulta chiaro: deve proteggere Artù, figlio di Uther e futuro Re.

Un cavaliere chiamato Valiant arriva alla corte per competere in un torneo di combattimento con la spada. Costui possiede uno scudo magico che causa molti danni ai suoi avversari, ma gli avvertimenti di Merlino nei suoi confronti rimangono inascoltati.

Camelot deve affrontare un doppio pericolo quando una piaga letale si diffonde per il castello e Gwen è arrestata per stregoneria. Merlino è costretto ad unirsi con Artù e Morgana per scoprire il colpevole di queste azioni criminose.

Bayard e i cavalieri delle isole occidentali arrivano a Camelot per un banchetto e Nimueh si infiltra nel suo gruppo organizzando un complotto per vendicarsi di Merlino. Fingendosi una della servitù, fa bere Merlino da un calice avvelenato con l'inganno. Questi finisce per ammalarsi e l'unica sua speranza è che venga preparato un antidoto, ma i tentativi di Artù di trovare gli ingredienti sono ostacolati dalla stessa Nimueh.

Merlino viene salvato da un terrificante mostro alato da un giovane straniero di nome Lancillotto che sogna di diventare un cavaliere di Camelot. Per ringraziarlo, Merlino gli procura dei falsi documenti di nascita che ne attestano la nobiltà. Con il mostro, che si scopre essere un grifone, ancora in libertà, la decisione di Merlino può avere gravi conseguenze non solo per Lancillotto, ma per tutta Camelot.

Quando Morgana si ammala, Gaius non è in grado di curarla. Per fortuna un misterioso medico di nome Edwin Muirden di farla guarire, ma Gaius si insospettisce del modo in cui l'uomo si fa strada incantando la corte.

Artù e Merlino salvano una giovane donna e suo padre da una banda di briganti ed il giovane erede al trono si invaghisce della ragazza, di nome Sophia, offrendo loro rifugio a Camelot. Merlino, però, non è l'unico a sospettare dei nuovi arrivati ed anche Morgana ha un incubo riguardo la morte di Artù per mano di una giovane donna.

Quando un druido ed il suo apprendista vengono catturati a Camelot, Morgana e Merlino riescono a tenere nascosto il ragazzo dalle guardie di Uther, ma il druido viene giustiziato. Uther dichiara che chiunque nasconda il ragazza verrà trattato con severità, quindi i due cercano di far uscire il giovane dalla corte senza essere catturati. Intanto una visita al Grande Drago rivela che il giovane è Mordred, la futura nemesi di Artù.

Il passato di Uther riaffiora per tormentarlo quando un misterioso cavaliere nero interrompe la festa per la maggiore età di Artù, sfidando i cavalieri di Camelot a duello. Il Cavaliere Nero sembra imbattibile e non ha difficoltà nel battere i suoi avversari, ma di chi si tratta realmente? e perchè Uther è così a disagio per il suo arrivo?

Ealdor, il villaggio natale di Merlino viene attaccato da predatore condotti da Kanen, ma Uther non ha intenzione di intervenire, perchè il villaggio è fuori dai confini di Camelot e questo costituirebbe un atto di guerra. Merlino lascia così Camelot per aiutare a difendere la sua casa e sorprendentemente trova aiuto in Morgana, Gewn ed Artù. Una vecchia conoscenza di Merlino, però, lo costringe a compiere una scelta difficile: userà la magia per difendere il suo villaggio, rivelando così il suo segreto ad Artù?

Quando Artù uccide un unicorno, attira una maledizione su Camelot. Con la città in preda alla carestia, c'è poco tempo per rimuovere la maledizione e la misteriora Anhora, custode dell'unicorno, dice ad Artù di essere lui il responsabile della carestia e per questo dovrà essere messo alla prova. Se Artù non riuscirà a fare ammenda per il suo atto, Camelot sarà condannata.

Quando Tom, il padre di Gwen, aiuta un mago rinnegato a trasformare il piombo in oro, viene arrestato e deve affrontare un processo per stregoneria. Nonostante le richieste di Artù e Morgana, Uther è deciso: Tom deve essere processato e, se ritenuto colpevole, condannato a morte. Morgana aiuta così Tom a scappare, ma ne risulta una tragedia.

Nel corso di una battuta di caccia, Artù incontra una gigantesca creatura mostruosa mai vista. Gaius capisce che si tratta di una Questing Beast, una creatura evocata dagli incubi di un Re morto da tempo, il cui morso è letale. Artù riesce a battere la creatura, ma viene morso e la sua vita resta in bilico. Il Drago dice a Merlin di cercare i membri di un vecchio culto che hanno il potere di salvare il futuro Re, ma c'è un prezzo da pagare: per salvare una vita, un'altra deve essere presa.

Un'antica tomba viene scoperta a Camelot. Gaius è convinto che questa appartenga a Cornelius Sigan, uno stregone malvagio, ma Uther chiude gli occhi. Nel frattempo Arthur ha un nuovo servitore, Cedric, che cerca di prendere il posto di Merlino come servitore di arthur. Merlino scopre che le vere ragioni di Cedric sono di riuscire a prendereun gioello che si trova nel tempio appena scoperto che si dice appartega a Cornelius Sigan. Questo non lascia altra scelta a Merlino che andare a chiedere aiuto al grande drago.

A Camelot è finalmente arrivato il giorno del torneo. Artù è determinato a vincere, ma crede che i cavalieri lo vogliano far vincere perché è il principe, quindi decide di volersi presentare in incognito per dimostrare a sè stesso di poter trionfare grazie alle sue capacità. Quindi per la durata del torneo alleggia in una camera a casa di Gwen. Nel frattempo Myror arriva a Camelot, con un unica missione... uccidere Artù.

Quando gli incubi di Morgana si manifestano nelle ore di veglia, lei si spaventa perchè si accorge di avere dei poteri magici. Gaius è determinato a tenere Morgana all'oscuro di tutto per il suo bene, ma Merlino non intende star fermo a guardare i suoi amici soffrire. Lui sa precisamente quello a cui lei sta andando incontro e sa che ha bisogno di conoscere la verità. Il suo segreto sta finalmente per essere rivelato? Disobbedendo a Gaius, nel frattempo, Merlino rischia tutto per aiutare Morgana, senza poter prevedere la portata saranno le conseguenze. Ancora una volta vite sono in pericolo, lealtà provate ed amicizie scosse, mentre Morgana si riunisce con Mordred, il giovane ragazzo druido, che il drago ha predetto che un giorno vorrà uccidere Artù.

Quando Gwen viene rapita, Artù va in suo soccorso, ma Lancillotto arriva prima. Gwen viene scambiata per Morgana e viene rapita da Hengist, un fuorilegge selvaggio. Uther Pendragon si rifiuta di pagare il riscatto per lei ed Arthur sfida il padre e si avventura in territorio nemico per la lotta per la libertà di Gwen. Merlin sospetta che la devozione di Artù per Gwen sia maggiore di quella di un principe per un suo suddito. Ma come reagirà Artù quando scoprirà che Gwen non è sola nel castello di Hengist? Lei e Lancillotto si sono ritrovati di nuovo, e i sentimenti si sono riaccesi.

Uther è felice dell'arrivo di Lady Catrina a Camelot ed è affascinato dalla sua ospite, ma Artù è sconvolto dal flirt di suo padre. Tuttavia Merlino e Gaius sospettano che lei sia diversa da come appare ed i loro sospetti sono confermati quando Merlino scopre che Lady Catrina è in realtà un troll. Artù però non gli crede e tocca a Merlino dimostrare la natura dell'ospite e salvare Uther dalla rovina. Sfortunatamente, Catrina punta a qualcosa di più alto del cuore del re. Riuscirà Merlin a sopraffare i suoi poteri da troll prima che sia troppo tardi?

Appena incoronata , Regina Catrina si stabilisce come First Lady di Camelot. Sebbene gli specchi rivelino la vera indole della Regina, la sua influenza su Uther aumenta, e le ripercussioni si avvertono in tutto il regno. Quando Catrina accusa Merlino di rubare, lui è spinto a nascondersi. Costretto a muoversi furtivamente nei dintorni del castello, Merlino deve trovare il modo per mettere in mostra la vera natura di Catrina senza essere imprigionato. Tuttavia, anche in caso di successo, sarebbe sufficiente per rompere la sua potente magia? O Camelot rimarrebbe intrappolata con una regina Troll per sempre?

Uther è deciso a spazzare via la magia da Camelot una volta per tutte e questa volta, nessuno è al di là di ogni sospetto. Uther convoca a Camelot il più temuto cacciatore di streghe, Aredian - un uomo terribile che non si ferma davanti a nulla per scoprire la magia. Gaius fa capire a Merlino quanto egli sia in pericoloso ma Morgana non ha bisogno di un tale avvertimento: è certa che Aredian andrà dritto verso di lei e che sarà bruciata sul rogo. Riuscirà Merlino a proteggere Morgana e Gaius senza finire lui stesso tra le fiamme?

Artù viene sfidato a duello da un misterioso guerriero; lui e Merlino si ritrovano coinvolti in una strana missione per conto di Morgana ed attraverso lei Artù scopre un segreto che potrebbe portare alla caduta di Camelot.

Merlino scopre la bella ragazza druido Freya intrappolata da un cacciatore di taglie e sa di doverla aiutare a fuggire. La ospita quindi nelle gallerie sotto Camelot, ma il rifugio non è sicuro a lungo perchè il cacciatore di taglie è alla caccia del suo bottino perduto.

Prelati da regni rivali arrivano a Camelor per parlare di pace, ma quello che Re Alined vuole veramente è le guerra e farebbe qualunque cosa in suo potere per incoraggiare le ostilità, perfino usare la magia. Trickler, il giullare di Alined, fa quindi un incantesimo su Artù, facnedolo innamorare dell'amata figlia del Re rivale Olaf, gettando Camelot nel caos e sull'orlo della guerra.

Lo stregone Alvarr è intenzionato a distruggere Camelot e lasciare che la magia regni nuovamente. Per combattere Uther, Alvarr ha bisogno di ritrovare il Cristallo di Neahtid, una preziona reliquia dell'Antica Religione, il cui potere Alvarr crede possa essere usato da Mordred. L'oggetto è al sicuro nei sotterranei di Uther e molti hanno perso la vita cercando di recuperarlo, ma Alvarr pensa di avere un'arma segreta per riuscire nell'impresa.

Le fiamme di Idirsholas bruciano di nuovo per la prima volta in 300 anni e Gaius teme che un mago ha riformato i mortali Cavalieri di Medhir. Artù e Merlino affrontano i cavalieri, ma a stento riescono a salvare la vita ed al ritorno a Camelot trovano che tutti sono preda di uno strano incantesimo, tranne Morgana.

Il Grande Drago è finalmente libero ed attacca Camelot. Gli uomini di Artù non possono resistere a lungo e solo un Signore dei Draghi può uccidere il mostro, ma Uther li ha liquidati tutti anni prima. Gaius però ammette che uno di loro potrebbe essere ancora vivo e nascosto, e potrebbe essere la chiave per comprendere lo stesso passato di Merlino.

Dopo un anno dalla sua sparizione, Morgana fa ritorno a Camelot. Uther annuncia un banchetto per celebrare il lieto evento, anche se Merlin teme che Morgana possa ricordare le circostanze della sua sparizione...La situazione precipita quando Camelot si trova nuovamente in preda della magia nera.

Merlino riesce a ritornare a Camelot e scopre che Morgause e Cenred stanno tramando ai danni di Uther, il quale è incapace di gestire la situazione, costringendo Artù a prendere in mano il comando per proteggere la città.

Merlino scopre una camera segreta e per sbaglio rimette un Goblin in libertà, che ne approfitta per impossessarsi di Gaius, trasformando il saggio dottore nell'ombra di se stesso, avido di soldi, birra e magia.

Merlino e Artù si ritrovano in una rissa in un bar e un uomo misterioso di nome Galvano gli da' una mano a difendersi. Per salvare la vita di Artù rimane gravemente ferito, così il principe decide di portarlo a Camelot per farlo curare da Gaius.

Merlin s'incontra con un vecchio mago, Taliesin, che gli da' la possibilità di vedere uno scorcio del futuro nella caverna di cristallo. Purtroppo quello che voleva essere un dono si trasforma in un dramma quando Merlino vede Morgana uccidere Uther.

Uther organizza un matrimonio combinato per Artù con una principessa in visita, Elena. Merlino però ha delle riserve perchè pensa che la ragazza non è chi dice di essere ed infatti la bella Elena nasconde un oscuro segreto...

Gwen è costretta a scegliere tra salvarela vita di Elyan, suo fratello, e Artù, l'amore della sua vita, entrambi nelle mani di Cenred. Gwen e Merlino devono unire le loro forze per trovare una via d'uscita da questa impossibile situazione. Ovviamente Morgana a e Morgause fanno di tutto per rovinare i loro piani.

Artù è deciso a mostrare il suo valore recuperando il Tridente Dorato del Re Pescatore, da solo. Lontano dalla protezione della cittadella, Morgana approfitta dell'occasione per usare la magia nera e gli dona un bracciale che contiene l'occhio di una fenice, dicendogli che si tratta di un talismano protettivo. In realtà il bracciale magico priva Artù della sua forza vitale lasciandolo in balia dei pericoli del reame del Pescatore. Merlino chiede aiuto a Gwaine per raggiungere il principe prima che sia troppo tardi.

Una vecchia fiamma di Gaius, Alice, arriva a Camelot. Tuttavia il mago si accorge che la donna è sotto l'influenza di Manticore, una creatura di una antica religione e Merlino non ha altra scelta che raccontare tutto a Gaius, che però è accecato dall'amore...

I sogni di Morgana sono tormentati da Ginevra in veste di Regina di Camelot, così Morgause la incoraggia a svelare la relazione tra Artù e Gwen a Uther, ben sapendo che il Re non permetterà a suo figlio di sposare una semplice serva. Ma costringendo i due a mettere fine alla storia il Re non fa che rafforzare il loro sentimento.

Il leggendario torneo di Camelot è alle porte e la città si riempie di guerrieri, tra cui anche Gilli, che nonostante la bassa statura è pronto a buttarsi nella mischia grazie a un'arma segreta: la magia. Ma Gilli non si rende conto dell'entità dei suoi poteri e toccherà a Merlino intervenire per salvare la situazione.

Artù e Merlino s'imbarcano in una missione pericolosa per recuperare la Coppa della Vita, un potente manufatto che dona il potere dell'immortalità. Durante il viaggio finiscono preda di Jarl un commerciante di schiavi senza scrupoli. Riescono a scappare con l'aiuto di un amico accorso in aiuto, ma Morgause riesce a mettere le mani sulla Coppa della Vita.

Morgana, appena incoronata Regina di Camelot inizia un regno di terrore per i poveri cittadini del regno. Con un'armata di immortali al suo comando tutto sembra perduto per Uther. Intanto fuori dalla cittadina, Artù riprende le sue forze e organizza un contrattacco con i suoi fedeli alleati, Gwaine, Lancillotto, Elyan e Percival. Merlino però è consapevole che nemmeno un guerriero esperto come Artù può sconfiggere un nemico immortale senza l'aiuto della magia e cerca di trovare la mitica spada di Excalibur dal fondo del lago Avalon.

Merlino deve affrontare una temibile sfida quando la cieca determinazione di Morgana mette a rischio il futuro di Artù e l'equilibrio del mondo.

Con il regno sull'orlo del collasso, Morgana è pronta a sferrare il suo attacco finale. Artù deve sconfiggere Dorocha mentre Lancillotto sta correndo a Camelot per salvare la vita di Merlino.

Camelot si sta preparando a festeggiare il compleanno di Artù ma il Re Odino si sta assicurando che sia un compleanno da non dimenticare. Il vecchio avversario del principe ha ingaggiato un assassino che si nasconda nella folla pronto a colpire.

Un uomo misterioso di nome Julius Borden arriva a Camelot con delle notizie su un segreto di natura magica che minaccia di cambiare il regno per sempre: conosce il luogo dove si nasconde l'ultima parte della chiave alla tomba di Ashkanar.

Non molto dopo la sua incoronazione Artù comincia a capire cosa significa essere Re. Dopo aver scatenato le ire della formidabile Regina Annis, le qualità da leader di Artù sono messe alla prova.

Merlino cade nelle mani di Morgana e sta per diventare la sua arma più temibile. Ricorrendo ad un antico rito magico riesce a mettere amico contro amico e crea il perfetto assassino mettendo Artù in gravissimo pericolo.

Morgana forma un'alleanza con l'enigmatico mago Alator per cercare di scoprire un segreto che potrebbe cambiare il corso del destino. Adesso che ha alleati da entrambi i lati delle mura della città, chi riuscirà a fermare Morgana prima che il grande segreto di Merlino venga svelato?

Merlino viene attirato in un villaggio distante per via di una malattia che sta facendo molte vittime. Diventa subito chiaro che c'è qualcosa nell'aria che rende ammalate le persone e che c'è molto di più di quanto si sospetti sotto.

Sir Lancillotto ritorna in vita e vecchi sentimenti ritornano ad accendersi e Ginevra deve combattere la tentazione prima di commettere un tradimento che porterebbe alla rovina di Camelot.

I cavalieri di Camelot s'imbattono in un altare dall'aria oscura nel mezzo della foresta. Ignorando gli avvertimenti di Merlino, le azioni di Elyan mettono in moto una catena di eventi che nessuno avrebbe potuto immaginare.

Morgana trova un potente alleato nel signore della guerra Helios. Insieme ordiscono il piano perfetto per mettere in ginocchio Camelot. Il regno e Artù sono impegnati dall'arrivo della bellissima principessa Mithian e l'allarme contro Morgana arriva da un amico assente.

Con Morgana alla testa della vasta armata di Helios, Camelot è intrappolata in una rete mortale. La furia della maga costringe i cittadini della città, perfino Artù, a scappare per salvarsi la vita. Tuttavia Morgana non lo lascia andare via così facilmente e comincia a dargli la caccia. Riuscirà Merlino a salvare il suo Re dalle grinfie di Morgana?

Morgana e Helios hanno conquistato Camelot e Merlino ed Artù vengono dichiarati fuorilegge. I due sono intrappolati in Ealdor con l'armata che li sta lentamente circondando. Artù deve riprendere il controllo della città prima che sia troppo tardi ma il tradimento di Agravaine e la straordinaria forza di Morgana hanno privato il Re della sua fiducia. Solo Merlino potrà aiutare il suo amico e solo un atto straordinario potrà dimostrare che il Re è nato per regnare.

Camelot sta per entrare in un'altra era dorata ma gli oscuri semi del male si stanno diffondendo. Re Artù e i suoi cavalieri si imbarcano per scoprire cosa sta succedendo nelle lande ghiacciate, dove molti uomini sono scomparsi. Merlin affronta una battaglia come mai prima nella sua vita.

Merlino è preoccupato per una profezia che parla di Mordred e non riesce a cambiare il percorso di Artù e stavolta sembra che nemmeno il mago riuscirà a evitare ad Artù di finire in trappola.

Uno straniero da ad Artù il potere di riesumare i morti e lui si ritrova a dover scegliere se seguire la ragione o il cuore. Artù decide di cogliere l'occasione per parlare con la persona di cui sente di più la mancanza, suo padre. Il mondo degli spiriti è un luogo tenebroso e pericoloso e Artù si rende conto che la sua decisione ha un prezzo molto elevato.

Morgana usa la Principessa Mithian come esca ed escogita un piano che riesce ad ingannare tutta Camelot, compreso Merlino. Riuscirà il mago a penetrare il velo di menzogne o stavolta Morgana porterà finalmente a termine la sua vendetta?

Tre divinatori svelano un futuro oscuro per il Re di Camelot ma nonostante gli avvertimenti di Merlino, Artù non presta molta fede alle parole degli oracoli, la cui ira si scatena sul regno. Solo un enorme sacrificio potrà fermarli e Artù deve prendere una decisione difficile. Merlino ha una sola chance di salvare Artù dal suo destino, ma la sua decisione ha un prezzo altissimo.

Gwen viene rapita da Camelot e Merlin è convinto che Morgana sia la responsabile. Artù è determinato a salvare la sua regina, che si trova imprigionata nella Torre Nera, un posto che influisce sui sogni delle persone.

Morgana riesce a raggiungere una posizione di potere eccezionale dopo aver plagiato la Regina. Insieme organizzano un piano per eliminare il Re, ma lo stalliere Tyr Seward minaccia di rovinare tutto. Riuscirà Merlino a svelare la verità e a salvare Artù?

Merlin dà una mano a un giovane Druido ed è costretto a lasciare Camelot per una missione pericolosa. Il regno intanto è distratto dalla visita del temibile Sarrum of Amata. Merlin comincia ad avere dei sospetti sul giovane Daegal però e il giovane mago si rende conto di aver commesso un terribile errore.

Merlino sa che deve agire in fretta prima che il controllo che Morgana ha su Ginevra porti a dei risultati disastrosi. Ma soltanto un incantesimo molto potente potrà salvare la regina.

Morgana è a caccia del suo vecchio nemico Alator di Catha perchè ha bisogno di sapere con esattezza dove trovare Emrys. La vita di Merlino è in serio pericolo e il mago si chiede se sia il caso di accettare l'aiuto di Finna.

Mordred è lacerato tra lealtà e amore e non sa che la decisione che prenderà cambierà per sempre il destino di Camelot. La guerra è imminente e Merlino si ritrova intrappolato da un destino crudele.

Su nelle colline una gran folla si sta ammassando sotto il comando di Morgana, pronta a scatenare la guerra appoggiata da Mordred. Merlino comincia a risentire del peso del suo destino e antiche profezie si rivelano fin troppo esatte.

La battaglia è al suo culmine e tutto sembra perduto per Merlino che cerca di trovare un modo per liberarsi dalla caverna dove è stato rinchiuso. La città cadrà nelle mani del nemico o riuscirà a salvarsi?