Hondo soupçonne la préparation d’attentats par des djihadistes. Un attentat-suicide est perpétré et toute l'équipe du S.W.A.T. s'active pour arrêter quatre terroristes quand Hondo découvre qu'un cinquième individu risque de passer à l'acte. Parallèlement, la pandémie de coronavirus prend de l'ampleur et la maire envisage de confiner la ville. La commémoration annuelle des émeutes de 1992 qui ont enflammé Los Angeles suite aux violences policières lors de l'arrestation de Rodney King donne l’occasion à Hondo et à son père de se remémorer cette période difficile pour leur relation. C'est également l'occasion pour Hicks de faire son mea culpa. Hondo est pessimiste quant au sort des noirs dans son pays...

Leroy, l'ami d'enfance de Hondo, demande à ce dernier de plaider sa cause devant le juge en vue d'une libération anticipée. Hondo ne sait pas quoi faire et craint que cela remette en cause ses rapports avec Darryl. Dans le même temps, grâce aux informations d'un repenti, le S.W.A.T. s'attaque à une famille mafieuse, les Venuti.

L'équipe du S.W.A.T. recherche un membre d'un groupe extrémiste qui envisage d'attaquer le service commémoratif d'un célèbre musicien qui a ouvertement parlé de la brutalité policière. De plus, la tension monte entre Hondo et Leroy, le père de Darryl, lorsque Leroy est libéré prématurément de prison.

Hondo a un conflit intérieur lorsqu'on lui demande d'être le visage public d'une nouvelle campagne de sensibilisation destinée à améliorer la vision du LAPD au sein de la communauté noire. La recherche d'un bombardier solitaire rappelle à Tan un chapitre difficile de son enfance.

Chris amène l'équipe dans une mission personnelle de sauver une adolescente d'un chef religieux prédateur. Hondo reçoit des nouvelles troublantes au sujet de Darryl. Tan rencontre un problème dans la planification se son mariage.

L'équipe du SWAT part à la recherche d'un tireur d'élite qui cible le service d'incendie de Los Angeles en allumant des incendies autour de la ville pour attirer des sociétés de moteurs sans méfiance. De plus, la rivalité entre Chris, Street et Tan augmente lorsque Tan découvre qu'il existe des paris sur lequel d'entre eux gagnera la compétition de leadership du SWAT. Et, la relation de Street et Molly devient tendue à cause son histoire compliquée avec sa mère emprisonnée.

L'équipe du SWAT recherche un groupe d'extrémistes menant des attaques coordonnées contre des entreprises locales. De leur côté, Deacon et sa femme, Annie, se retrouvent en désaccord quand Annie veut inscrire leur fille, Lila, dans une école privée.

Erika a succombé à sa blessure et l'équipe d'Hondo fait l'objet d'une enquête afin de déterminer les responsabilités de chacun. Pendant ce temps, tout le monde est assigné au travail administratif sauf Deacon, qui n'a pas participé à la mission en question, et Chris, qui doit retourner voir la psychologue. En effet, Chris n'a pas encore réussi à rentrer dans l'appartement qu'elle partageait avec Erika. Désireux de savoir s'il a commis une erreur, Hondo retourne sur les lieux du drame et repère quelque chose qui fait avancer l'enquête : le terrain d'entraînement des Imperial Dukes ressemble trait pour trait à celui des Marines lorsqu'il était à Pendleton lui-même...

Alors que toute l'unité est encore sous le choc de la disparition d'Erika, une nouvelle recrue, Nora Fowlers, intègre le S.W.A.T. en qualité de médecin tactique. Son aide s'avère précieuse alors que Hondo et ses hommes doivent sauver une femme des griffes de son kidnappeur. Parallèlement, Chris remporte le concours de l'I.L.T.

Hicks et Mumford enquêtent sur la mort de leur indic, assassinée il y a quinze ans. Le suspect est relié à un trafic de drogue, qui produit des faux anti-douleurs coupés au fentanyl. Chris a toujours du mal à faire son deuil d'Erika.

Suite à l'assassinat d'une journaliste d'investigation, l'équipe du SWAT va venir en aide à des activistes humanitaires originaires du Guatemala qui risquent de connaître le même sort. Dans le même temps, Hondo doit calmer le jeu au sein de sa famille. Son père menace de les quitter encore une fois.

L'agent Valdez du FBI demande à Hondo et son équipe d'arrêter John Afton, un homme d'affaires qui a monté une vaste escroquerie en créant un fonds spéculatif. Pour s'enfuir, Afton engage Otto Brady, gérant de Capstone, une société de sécurité privée. Ses hommes et lui comptent faire fuir Afton par avion dans une caisse. Mais Afton va d'abord chercher son fils Jonah, pour avoir accès aux millions cachés sur un compte en Suisse à son nom. Obligés de se replier dans la forêt, ils sont débusqués par Hondo et son équipe. Brady tente de s'enfuir avec Jonah pour lui extorquer l'argent, mais Hondo le neutralise. Street tente d'aider Chris qui sombre dans l'alcoolisme depuis la mort d'Erika. Deacon fait connaissance avec Durham, un nouveau qu'il prend sous son aile.

Une deuxième cellule des Imperial Dukes prévoit une attaque au gaz toxique dans un lieu tenu secret. Le S.W.A.T. entame alors une course contre la montre afin de déjouer cet attentat. Street s'assure que Chris garde la tête au travail et ne flanche pas devant ces souvenirs douloureux tandis que Luca tente désespérément de recruter Nora dans son équipe pour la course de relais annuelle. Hondo découvre que des jeunes extorquent de l'argent aux commerçants du quartier où Darryl et Leroy ont installé leur garage. Il tente de gérer la situation à sa manière tandis que Deacon émet des doutes au sujet de Durham : celui-ci semble partager une idéologie proche de celle des suprémacistes blancs...

Alors qu'il est de repos, Tan intervient sur les lieux d'un braquage et manque de peu d'arrêter un des suspects. Afin d'aider le lieutenant Burrows de la brigade criminelle à interpeler les voleurs, Hondo et son équipe décident de mener l'enquête et découvrent que chacun des hold-up perpétrés par la bande a été filmé par une journaliste indépendante. Sur les vidéos, les voleurs disent vouloir distribuer leur butin aux habitants de quartiers défavorisés. L'analyse d'une balle retrouvée sur les lieux d'un braquage permet au S.W.A.T. de remonter la piste de la bande jusqu'au quartier de la jungle dont les habitants sont menacés d'expulsion par leur propriétaire.

Alors qu'ils sont appelés à témoigner devant la cour, Hondo et Deacon se retrouvent piégés par des hommes armés dans l'enceinte d'un tribunal. Hicks charge Luca de prendre en main les opérations.

Shannon est une jeune fille victime d'un réseau de prostitution. Alors qu'un routier tente de la sauver de ses proxénètes, ces derniers ouvrent le feu. L'équipe d'Hondo intervient sur les lieux de la fusillade et comprend qu'Edgar McQuillan, l'un des proxénètes, s'est enfui avec trois autres jeunes filles et il n'hésitera pas à les tuer pour couvrir ses traces. Tan finit par le localiser grâce au témoignage de Shannon et Hondo l'intercepte alors qu'il s'enfuit à bord d'un camion-citerne percé, évitant le pire. Hicks annonce à Deacon et Hondo que Durham et ses collègues racistes ne seront pas sanctionnés. Hondo décide alors de prendre les choses en main et d'exposer toute la situation à la presse. Street souhaite donner une partie de son foie à sa mère, ce qui met en colère Chris.

Suite à la parution de l'article du Times dénonçant les errements impunis de certains policiers racistes, l'atmosphère se tend au sein de la population noire. Un attentat à la bombe est perpétré dans un commissariat et après visionnage des caméras de sécurité, les enquêteurs identifient le poseur de bombe comme étant un certain Kevin Hilliard, leader du mouvement de protestation "Justice pour les Noirs". Arrêté, il nie toute implication dans l'attentat et se dit victime d'un coup monté. Les hommes du S.W.A.T. découvrent bientôt que Kevin Hilliard dit vrai et que l'attentat a été monté par la dernière cellule active des Imperial Dukes dans le but d'incriminer l'activiste et de déclencher un conflit racial. Pour ce faire, ils prévoient aussi de semer la panique lors de la prochaine manifestation anti-raciste. Hondo et ses hommes se lancent alors dans une course contre la montre pour mettre les membres du groupe terroriste hors d'état de nuire.