미 해군의 특수부대인 네이비씰에서도 최정예 병사들이 소속된 브라보 팀.그 팀을 이끄는 팀장 제이슨 헤이즈는 팀원 레이 페리, 소니 퀸 등과 최전선에 투입되어 위험한 임무를 수행하고, 그런 그들 곁에는 임무를 전달하고 지원하는 CIA의 맨디 엘리스와 현장 지휘관인 에릭 블랙번 소령도 함께다. 제이슨은 냉철한 판단력으로 팀을 이끌지만, 작전 중에 잃은 동료 네이트에 대한 죄책감에 시달리며 아내 알라나와는 별거 중이다. 한편, 브라보 팀은 테러범 생포 작전을 위해 라이베리아로 떠나고, 통역을 도와줄 클레이 스펜서가 동행한다. 하지만 클레이는 시작부터 제이슨에게 미운털이 박히는데...

시리아 정부가 생화학 무기를 개발 중이라는 첩보를 입수한 씰 팀. 무기 공장이라 추정되는 폐쇄된 병원으로 파견을 나간다. 임무를 수행하던 씰 팀은 병원에서 독성 물질에 노출된 민간인들을 발견하고 그들을 구하기 위해 노력하지만 국방부에서는 민간인 구출을 꺼린다. 그러던 중, 대규모의 적이 병원으로 다가오는데...

남중국해에서 연구를 진행하던 해양 조사선 '켄타우루스'가 해적에게 납치되는 사건이 발생한다. 이에 씰 팀은 해적의 경로를 파악해 인질 구출 작전을 세운다. 한편, 클레이는 하위 5명에 들자 자신을 몰아세우며 예민해지고 다가오는 사람들을 밀어내며 날을 세우는데...

CIA 고위 간부 올리버가 자신이 쫓는 전범 발지치의 포획을 브라보팀에 요청한다. 헤이즈는 사전 정찰 도중 예상치 못한 인물과 마주치며 작전 취소를 고민하고 클레이의 아버지 애시 스펜서가 저자 행사로 버지니아를 방문한다. 클레이가 애시에게 스텔라를 소개하지만 부자 사이의 앙금은 여전한 가운데 헤이즈는 네이트의 비밀을 알라나에게 숨기기로 결심하는데...

남수단에서 대통령 선거에 불복하는 시위가 일어나 미 대사관이 위험에 처한다. 씰 팀은 남수단에 급파되어 사태의 심각성을 깨닫고 교민들을 대피시키려 하지만, 대리 대사인 크롤리는 대피령을 내리길 거부한다. 제이슨과 팀원들은 크롤리의 지시로 미국인 봉사자를 구하러 나왔다가 허탕을 친다. 시위가 폭력적으로 격화되며 사람들은 대사관 앞으로 몰려들고, 제이슨과 팀원들은 성난 시위대에 갇혀 옴짝달싹 못 하게 되는데...

위장 신분으로 브라질에 머물던 CIA 요원 제인 콜이 납치당하는 사건이 발생한다. 납치범들은 CIA 요원인 줄 모른 채 몸값으로 20만 달러를 요구하고 씰 팀은 위장이 들통나지 않길 바라며 제인을 구하러 가지만, 브라질과 아르헨티나, 파라과이의 국경이 맞물린 곳이라 작전 허가를 받는 게 쉽지 않다. 한편, 클레이는 그린 팀의 마지막 관문인 포로 대비 훈련을 받으며 극한의 상황에 몰리게 되는데...

아프간 기지의 미군 일병이 탈영해 탈레반에 납치된다. 탈레반은 미군 탈영병과 관타나모에 억류된 탈레반 포로 세 명의 맞교환을 제안하고 국방부의 요청에 따라 브라보 팀이 탈레반의 호송과 탈영병의 귀환을 위해 현장으로 파견된다. 한편 클레이는 앞으로 복무할 팀이 정해지는 드래프트를 앞두고 새 집을 구하는 중에 현실로 다가온 티어 1 부대원으로서의 삶을 스텔라와 함께할 수 있을지 고민하는데...

CIA의 비밀 정보원이었던 러시아의 지모프 박사가 망명 도중에 비행기 사고로 실종된다. 비행기가 추락한 곳은 아프간과 국경을 맞대고 있는 중국 땅. 씰 팀은 생존자를 구출하러 중국으로 떠나 박사 부부가 살아 있다는 것을 확인하지만, 박사를 노리는 러시아의 특수부대와 맞닥뜨리고 설상가상으로 잔해를 발견한 중국군까지 나타난다. 그러는 사이 해가 지고, 씰 팀은 숨 막히는 어둠 속에서 러시아와 중국의 눈을 피해 탈출 작전에 나서는데...

예멘의 한 가정집에 들이닥친 제이슨과 씰 팀. 테러 관련 웹 사이트를 관리하는 운영자를 체포하려면 그 집에 있는 휴대폰을 찾아야만 한다. 그 과정에서 실수로 유력한 용의자의 딸을 총으로 쏘고, 씰 팀은 응급 처치를 하며 가족을 하나하나 신문한다. 하지만 집 주인과 아내 모두 결백을 강력히 주장하는데...

우크라이나에서 폭발물이 거래될 거란 첩보를 입수한 씰 팀은 그곳에서 폭발물을 확인하고 옮기는 동안 주변을 봉쇄하는 임무를 맡는다. 하지만 단순한 폭발물이 아닌 핵탄두란 걸 알게 되고 헬기로 이동하지 못하게 되자 봉쇄 임무를 맡았던 씰 팀이 직접 차로 운반하기로 결정한다. 팀원들이 작전을 수행하는 동안 어깨 부상으로 인해 대기 중이던 레이는 위험한 선택을 하는데...

미 공군 최신 드론이 ISIS 최후의 보루인 알카임 외곽에 추락한다. 드론 고유 기술이 적의 손에 들어가는 일을 막고자 공군은 씰에 회수를 요청하고 알파 팀과 브라보 팀은 이라크군과 ISIS의 결전이 펼쳐질 적진의 한가운데로 잠입한다. 작전 진행 중 주변 감시를 위해 인근 건물에 올라가던 클레이가 적들에게 발각될 위기에 처하고 제이슨은 클레이 구조 대신 드론 회수에 집중하라는 공군 사령부 사령관과 갈등을 빚는다.

아프간에서 폭탄 테러로 에코 팀 대원들이 전사한다. 하지만 동료들의 죽음을 슬퍼할 새도 없이 브라보 팀의 파병 날짜가 앞당겨진다. 다시 가까워지던 제이슨과 알라나의 관계에도 빨간불이 켜지고, 나이마는 레이의 어깨가 나았다는 말이 거짓말인 걸 알고 불안해한다. 대원들은 착잡한 마음을 안고 동료들의 복수를 위해 테러의 배후를 찾아 나서는데...

씰 팀은 곳곳에서 에코 팀의 흔적을 발견하며 저마다의 방식으로 그들을 기리고 마침내 에코 팀을 죽음으로 몰아넣은 타릭의 애인 아짐을 체포한다. 맨디는 타릭의 배후를 조사하던 중, 작전기지에서 만난 기자에게 뜻밖의 정보를 듣게 된다. 한편, 씰 팀은 타릭이 사용한 폭탄을 누가 제조했는지 알아내고, 그 폭탄 제조가를 잡으러 출동하는데...

에코 팀을 죽인 폭탄을 제조한 아레시 카말의 집을 습격한 지도 벌써 일주일째, 점점 지쳐 가던 팀원들에게 작은 단서가 생긴다. 카말의 집에서 발견한 마약은 한 양귀비 농장으로 팀원들을 이끌고 이 농장을 에코 팀이 태웠단 사실을 알게 된다. 이에 화가 난 농장 주인이 에코 팀을 습격했을 거란 추측이 나오며 비난의 화살은 농장 주인에게로 돌아가는데...

맨디는 헤로인 제조가 파지르를 신문해 양귀비밭의 주인이 세계 최대의 마약상 무사 가니임을 알아낸다. 브라보 팀은 무사 가니의 경호대장 바시르 칸을 추적해 은신처를 찾아내지만 CIA의 지시로 작전은 취소된다. 무사 가니가 사실은 마약 단속국의 고급 정보원이었던 것. 하지만 제이슨은 에코 팀 전사자들의 복수를 고집하고 맨디가 기지를 발휘해 작전은 재개된다. 결국 브라보 팀이 힘겨운 싸움 끝에 무사 가니를 잡아들이지만 신문을 끝내고 돌아온 맨디의 표정이 좋지 않은데...

무사 가니를 검거하며 살림 하칸의 위상은 더욱 높아진다. 양귀비밭을 사들인 회사의 소유주가 살림 하칸의 부인으로 밝혀지고 에코 팀 암살을 청부한 게 살림이라는 게 확실해지지만 국방부를 설득할 만한 물증이 없는 상황. 결국, 브라보 팀은 가출한 뒤 행방이 묘연해진 살림의 부인을 찾아 나선다. 하지만 곳곳에 살림의 마수가 뻗쳐 있어 아군마저 믿을 수 없는데...

씰 팀은 잘랄라바드를 방문한 국회 의원 대표단과 국방부 관리들의 경호를 맡는다. 제이슨은 병원에서 경호하던 중, 위험을 인지하고 대표단을 피신시키려 하지만 국회 의원 데이비드 알퍼는 언론의 눈을 의식해 거절한다. 맨디는 세계 최고 수준의 저격수이자 살인 청부업자가 잘랄라바드에 왔다는 정보를 입수하는데...

살림을 사살한 저격수 아부 알리의 휴대폰을 손에 넣은 씰 팀은 고용인과 대화를 시도하며 아부 알리가 살아 있는 것처럼 꾸미기 위해 가짜 급습 작전을 펼친다. 그러던 중 군 수사관이 찾아와 레이가 잘못 던진 수류탄에 민간인 남자아이가 죽었단 사실이 밝혀진다. 어깨 부상을 숨긴 채 아프가니스탄에 온 레이는 이 때문에 남자아이가 죽은 거라며 자책한다. 이때 아부 알리와 연락이 닿은 씰 팀은 예상치 못한 거물과 마주하는데...

제이슨은 커터를 찾아가 스티브 포터의 죽음과 희토류의 관계에 관해 캐묻지만 커터는 발뺌한다. 아바드 할라니는 맨디와 만나 형 노리 할라니의 위치를 넘겨주며 암살을 사주하고 브라보 팀은 바로 포획 작전을 계획하지만 상부에서는 지상 작전이 아닌 드론 공격을 지시한다. 드론 공격이 여의치 않자 지휘부는 작전을 전격 취소하고 제이슨과 브라보 팀은 지상 작전을 감행한다. 임무를 완수하고 철수하려는 찰나 수십 명의 적이 계곡에서 나타나고 브라보 팀은 간신히 탈출에 성공하는데...

제이슨이 탄 헬기가 정체를 알 수 없는 공격으로 추락하는 사고가 발생한다. 이 사고로 제이슨은 큰 부상을 입게 되고, 팀원들은 적들의 공격에 노출되자 맹렬하게 쏟아지는 공격을 피하며 근처에 있던 농가로 피신한다. 그러던 중 헬기를 공격한 게 지대공미사일이란 사실이 밝혀지고, 팀원들을 구하러 가던 기동 타격대의 헬기는 발길을 돌리게 되는데...

노리로부터 아바드의 위치를 입수한 제이슨과 브라보 팀은 당장 포획 작전을 준비하고 같은 시간, 죽은 노리의 잔당도 복수를 위해 아바드를 쫓는다. 아바드의 계략으로 노리의 잔당이 제거되고 브라보 팀은 아바드를 막다른 길로 몰아넣지만 아바드는 저항하다 결국 총에 맞아 죽어 버리고, 제이슨은 스티브가 숨긴 외장 하드 디스크를 찾아 다시 커터를 찾아가지만 거대 기업의 힘 앞에서 무력함을 느낀다. 한편 레이는 제이슨의 머리 부상이 심상치 않음을 눈치채는데...