Après avoir manqué de s'étouffer en mangeant, Sheldon refuse d'ingérer un aliment solide. Une psychothérapie s'avère inutile et Sheldon ne trouve de l’inspiration qu'à travers la redécouverte des comics. George et Missy se retrouvent encore loin de l’attention de leurs parents, accaparés par Sheldon, mais leur grand-mère veille.

Sheldon, habitué à être vu par ses camarades comme le vilain petit canard, utilise ses connaissances en matière de statistiques pour faire gagner l'équipe de football américain. Il jouit alors d'une popularité inattendue qu'il a bien du mal à gérer...

Au cours d'une visite d'un représentant de la NASA au lycée, celui-ci ne prend pas Sheldon au sérieux. Ce dernier est alors bien déterminé à prouver toute sa valeur. Il est mandaté pour une mission spéciale qui pourrait lui permettre de montrer sa science...

Mary voudrait que George passe plus de temps à s'intéresser aux envies de Sheldon. Le père emmène donc ses deux fils en Floride assister au décollage d'une fusée à Cap Canaveral. Pendant ce temps, Mary profite du temps entre filles avec Meemaw et Missy.

Les professeurs du collège de Sheldon ne supportent plus leur jeune élève surdoué. Le directeur trouve une école privée prête à offrir une bourse pour lui, qui semble idéale mais Mary Cooper n'est pas prête à laisser partir son fils.

Mary Cooper découvre que Sheldon commence à jouer à Donjons et Dragons avec ses amis et la présence d'éléments démoniques dans le jeu l'inquiète au plus haut point. En essayant de ramener Sheldon vers Dieu, elle l'amène à s'intéresser à toutes les religions.

Sheldon a des vues sur un ordinateur domestique, ce qui amène les parents à évoquer l'argent du foyer et provoque une dispute. Mary part donc chez sa mère avec Sheldon et Missy.

La grippe commence à l'entourage de Sheldon, et quand une professeure commence à tousser, il quitte aussitôt la salle de classe, lui valant ses premières sanctions disciplinaires. Reste pour Mary le problème de sa phobie qui prend peu à peu des propensions problématiques.

Sheldon et Tam font la rencontre d'une lycéenne passionnée de géologie et l’accueillent dans leur groupe. La famille Cooper est stupéfaite en apprenant que le jeune surdoué fréquente déjà des filles.

Pour avoir gagné un prix de consolation à un concours scientifique de l'école, Sheldon renonce à poursuivre dans le domaine et se rebelle. En cherchant sa voie, il se découvre un don pour la comédie.

Mary et George voient le comportement de Sheldon changer, calculant ses trajets pour rentrer chez lui le soir et voulant apprendre à se protéger et se défendre. Le garçon finit par avouer qu'il est harcelé par la petite voisine de 6 ans.

Mary découvre, outrée, le contenu des comics que lit Sheldon (comme Watchmen). Comme il refuse d'arrêter cette lecture et assumant son choix, Sheldon sera traité comme un adulte par sa mère.

Sheldon démonte le réfrigérateur pour faire cesser un énervant bourdonnement. Puis il rédige une feuille de route pour frais des réparations...

Le docteur Sturgis a noué une relation amicale avec un autre petit génie, Paige, une fillette de 10 ans. Sheldon en prend ombrage. Il est même si jaloux que Meemaw doit intervenir. Pendant ce temps, Mary invite la famille de Paige pour une après-midi jeux...

Une tragédie survient au sein de la petite communauté, ce qui met la foi de Mary à l'épreuve. Dans cette circonstance, Sheldon se révèle contre toute attente un précieux allié...

George confie un secret à Sheldon et demande de ne rien dire à Mary. Mal à l'aise à l'idée de ne pas être honnête avec sa mère, le jeune garçon se terre chez son ami Tam...

Mary se dispute avec le profession d'art dramatique de Sheldon. L'objet de la discorde est un projet de collecte de fonds organisé pour l'église à l'occasion d'Halloween. Georgie craque pour une adolescente rebelle à qui Sheldon donne des cours particuliers...

Au musée des sciences, Sheldon s'attire des ennuis avec Paige, son homologue féminine, surdouée elle aussi. George Sr est obligé de jouer les psychologues auprès des parents de la fillette, chamailleurs. Mary, Georgie et Missy aident Meemaw à organiser un vide-grenier...

Sheldon et Meemaw se laissent happer par un jeu vidéo qui vampirise leur quotidien et devient leur unique préoccupation. Georgie sympathise avec Herschel, ce qui provoque la jalousie de son père...

Sheldon est dans l'obligation de passer quelques jours à l'hôpital. Son séjour n'est pas de tout repos pour l'équipe soignante car le garçon se révèle être le pire patient qui soit. De son côté, Missy a un aperçu de ce que serait sa vie sans la présence permanente de son jumeau...

Sheldon s'attelle à la construction d'un réacteur nucléaire. Parallèlement, les esprits s'échauffent à l'université lors d'un cocktail : le docteur Linkletter, un collègue de Sturgis, flirte avec Meemaw. Côté coeur, Georgie est dévasté lorsqu'il apprend que Veronica a un petit ami...

Sheldon a sympathisé avec une petite frappe et utilise cette nouvelle amitié pour mener Georgie à la baguette. De son côté, Missy vole discrètement le maquillage de Meemaw le jour de la photo de classe, pour tenter d'apparaître sous son meilleur jour...

Sheldon estime avoir été mal noté par le docteur Sturgis. A l'issue d'une évaluation, ce dernier a marqué comme fausse une des réponses du jeune génie. C'est la dispute. De son côté, Mary remplace au pied levé le pasteur Jeff, tombé malade...

En grandissant, Sheldon ne perd rien de son intelligence redoutable et de son caractère sceptique. Il ne manque pas de mettre sa famille dans l'embarras. Ses dons pour les mathématiques et la science lui apportent, certes, des bienfaits et une certaine confiance en lui. A neuf ans, il entre au lycée.

Pour faire comme son héros, Albert Einstein, Sheldon s'essaie au violon. Mary et Meemaw achètent un test de grossesse car Mary se pense enceinte.

Sheldon s'installe chez le Dr Sturgis le temps d'un week-end afin de voir à quoi ressemblera sa vie d'étudiant à l'université. Mary, de son côté, essaie de se lier aux autres membres de la famille Cooper en l’absence de Sheldon.

Mécontent que les fonds alloués aux écoles servent au sport plutôt qu'aux cours, Sheldon décide de se présenter à la présidence de sa classe.

Georgie est ravie d'apprendre que Veronica reste quelques jours au domicile des Cooper. Meemaw et le docteur Sturgis célèbrent leur premier anniversaire.

La famille Cooper aide le pasteur Jeff à traverser une période difficile. De son côté, Mary emmène Sheldon à l'église pendant une journée. Il fait pression sur les membres afin de récolter davantage de dons.

Sheldon invite l'ensemble de ses camarades à une fête pour l’annonce du prix Nobel. Pendant ce temps, Meemaw en apprend plus sur le passé du docteur Sturgis. Le souhait de Georgie d’avoir la télévision par câble mène à une impasse entre lui et George Sr..

Après la dépression nerveuse du docteur Sturgis, Mary s’inquiète que Sheldon se dirige dans la même direction. De son côté, Georgie se découvre un talent pour la vente.

Sans les cours du docteur Sturgis, Sheldon doit trouver un nouveau moyen afin de rester à la hauteur pour le défi académique. Pendant ce temps, Mary aide le pasteur Jeff à éviter de succomber à la tentation avec sa petite amie.

Après sa sortie de l'hôpital psychiatrique, le docteur Sturgis rompt avec Meemaw.

Un carnaval d'église conduit Missy à essayer d'intégrer l'équipe de baseball. De son côté, Meemaw se débat avec ses émotions après sa rupture avec le docteur Sturgis.

Sheldon se lance dans une guerre sur Internet. Au même moment, Missy fait face aux garçons de son équipe de baseball. Meemaw est malheureuse quand George Sr. passe plus du temps avec son nouveau petit ami qu'avec elle.

George Sr. et Georgie vont camper avec le nouveau petit ami de Meemaw, Dale. Mais les choses se compliquent quand le docteur Sturgis décide de les accompagner. De leur côté, Sheldon et Missy inventent un super-jeu.

Après que George Sr. se soit encastré dans la bibliothèque de l'école, la fonctionnaire, Madame Hutchins ayant été blessée, la famille Cooper doit s'en occuper. Parallèlement, Meemaw donne des conseils à Georgie.

News of the tornado reaches Sheldon and Mary in Germany. Also, with the Cooper house in chaos, Missy steps up.

Sheldon explores Germany behind Mary's back, Missy attempts to pull a fast one on George Sr. and Meemaw and Dale adjust to living together.

Missy steps up, Mary has a surprise for George, and Sheldon finds his dorm occupied.

Georgie and Mandy's wedding plans pit Mary against Mandy's mom, Audrey, with baby CeeCee caught in the middle.

Sheldon studies to be Meemaw's lawyer when she is put on house arrest, and the Coopers have a plumbing emergency.