Op hun eerste dag als chirurgijns, maken Dr. Shaun Murphy en Dr. Alex Park kennis met de eerstejaarsbewoners die ze zullen begeleiden, Dr. Danica Powell en Dr. Daniel Perez, die een behoorlijk eerste indruk maken. Ondertussen gaat Lim weer aan het werk terwijl ze geconfronteerd wordt met haar nieuwe realiteit en de emoties die de veranderingen met zich meebrengen.

Het team behandelt een beroemde huwelijkstherapeut nadat ze haar enkel heeft geblesseerd door te vallen, maar wanneer ze hen relatieadvies geeft, merkt Dr. Morgan Reznick al snel dat hun patiënt misschien iets veel ernstiger ervaart. Ondertussen is dr. Audrey Lim vastbesloten om uit te zoeken wat er werkelijk is gebeurd in de OK tijdens haar operatie en begint ze aan haar eigen interne onderzoek

Het team werkt aan een militaire reenactor wiens poging tot authenticiteit een explosieve hachelijke situatie heeft gecreëerd die zelfs Dr. Shaun Murphy niet kon voorspellen. Ondertussen zijn dr. Jordan Allen en dr. Daniel Perez in een race tegen de klok op zoek naar een afgehakte voet.

Shaun, Asher en Powell behandelen op Halloween een jonge patiënt met een zeldzame erfelijke ziekte, waardoor ze op een onbekend pad terechtkomen. Ondertussen moeten Glassman en Shaun hun meningsverschillen overwinnen om samen te werken aan een oplossing voor Lims verlamming.

Midden in een hittegolf staan ​​Dr. Shaun Murphy en Dr. Danica Powell op gespannen voet als het gaat om de operatie van hun patiënt. Hun verhitte patstelling stelt Shauns geduld en zijn bereidheid om compromissen te sluiten op de proef. Ondertussen, wanneer het ziekenhuis de stroom verliest, worden Lea en Dr. Aaron Glassman gedwongen om met een snelle oplossing te komen of riskeren ze een totale sluiting die het leven van patiënten in gevaar kan brengen in de 100e aflevering.

Wanneer een vrouw die zwanger is van een zesling in het ziekenhuis arriveert, moet Dr. Marcus Andrews de artsen in teams verdelen om hun gezondheid en veiligheid te garanderen na hun risicovolle bevalling. Ondertussen moeten Shaun en Lea hun eigen hindernissen overwinnen terwijl ze discussiëren over het stichten van een gezin

Drs. Shaun Murphy, Asher Wolke en Aaron Glassman ontmoeten een patiënt met een geïnfecteerde chirurgische spons die in hun buik is achtergebleven. Ondertussen moet Dr. Morgan Park haar eigen verleden onder ogen zien wanneer ze het slachtoffer van een aanranding behandelt in een geheel nieuwe aflevering.

Dr. Shaun Murphy creëert onbewust een wedstrijd tussen Drs. Danica Powell en Daniel Perez wanneer hij een nieuw prestatiebeoordelingssysteem introduceert; Dr. Morgan Reznick heeft misschien een grens overschreden met Dr. Alex Park.

Shaun en Lea leren dat hun verrassende zwangerschap extra complicaties met zich mee kan brengen; Artsen Park, Reznick en Allen behandelen een tiener met het syndroom van Gardner wiens chirurgische geschiedenis uit het verleden de uitkomst van zijn huidige in gevaar brengt.

Op weg naar hun babymoon krijgen Lea en Shaun een snelle les in het ouderschap wanneer ze zich haasten om een gewonde hond te helpen. Ondertussen, Dr. Danica Powell voert in het geheim een operatie uit aan een vriendin die haar carrière in gevaar zou kunnen brengen.

Shaun nodigt Aaron uit om bij hem te blijven terwijl hij verdelgers in huis heeft en Lea realiseert zich dat beide mannen veel meer gemeen hebben dan ze zich realiseerde. Ondertussen, Dr. Morgan Reznick worstelt met een grote beslissing over haar carrière en haar persoonlijke leven.

Shaun en Lea botsen over hun opvoedingsstijlen en maken zich zorgen over wat er met hun relatie zal gebeuren als hun kind wordt geboren. Ondertussen, Dr. Lim moet een manier vinden om de beschadigde longen te redden waar een van haar oude patiënten op heeft gewacht.

Wanneer een 3-jaar-oud op de eerste hulp aankomt, herkent het team meteen dat hij een beroerte heeft. Echter, Dr. Shaun Murphy's diagnose van de onderliggende oorzaak lost het probleem niet op dat Dr. Park zoek dieper.

Dr. Jared Kalu maakt een verrassende terugkeer naar San Jose's St. Bonaventure Hospital met zijn miljardairpatiënt. Ondertussen moet Park de man met wie zijn vrouw een affaire had behandelen en proberen een manier te vinden om hem te vergeven.

Dr. Shaun Murphy zoekt juridische vertegenwoordiging om hem te helpen een zaak te winnen en stelt zijn vertrouwen in een veelbelovende, jonge advocaat, Joni DeGroot, die een obsessief-compulsieve stoornis heeft.

Dr. Shaun Murphy moet leren werken met Dr. Jared Kalu weer en herinnert hem eraan dat hij helemaal opnieuw moet beginnen bij St. Bonaventura. Ondertussen, Dr. Murphy behandelt een tiener die lijdt aan neurologische problemen met een procedure met een zeer hoog risico.

Wanneer een patiënt binnenkomt met aanhoudende en aanhoudende COVID-symptomen, ontdekt het team dat ze mogelijk te maken heeft met iets moeilijkers te behandelen. Andrews en Villanueva moeten te maken krijgen met hun hiërarchie in het ziekenhuis en het effect ervan op hun relatie.

Drs. Andrews en Lim botsen over een patiënt die bijna in tweeën is gesplitst, wat ook haar problemen met Dr. Kalu's terugkeer. Ondertussen, Dr. Glassman geeft Dr. Murphy wat vaderlijk advies in afwachting van nieuws over Glassman's recente tests.

Dr. Marcus Andrews stelt een deel van het team voor aan een patiënt wiens optimisme en geloof Dr. Asher Wolke de meest sceptische in het licht van zijn eigen relatie met religie.

Dr. Glassman en Dr. Murphy's relatie kan onherstelbaar beschadigd zijn na een gespannen moment tijdens de operatie. Terwijl Dr. Reznick worstelt tijdens haar ouderschapsverlof, Dr. Park is misschien wel degene die ze het meest nodig heeft.

Shaun en Lea gaan naar de verloskamer en iedereen uit het ziekenhuis is er ook, behalve één heel belangrijke persoon. Ondertussen, een tragisch ongeval waarbij Drs. Perez en Kalu trekken iedereen weg, inclusief Dr. Murphy.