결혼식 날 밤, 숀은 동료 의사의 목숨을 구하기 위해 달려간다. 위험한 치료 전략을 시도하려는 숀. 그런데 이는 곧 상급자의 조언을 거스르는 일이 된다.

신입 레지던트들이 팀에 합류한다. 의사들은 심장 이식을 비롯해 까다로운 수술에 집중하기 위해 개인적인 차이점들을 요령껏 극복해야 한다.

유명한 부부 상담 치료사의 치료를 맡게 된 숀은 결혼 생활에 대해 돌아본다. 오드리는 본인의 수술 과정에서 이뤄진 결정에 대해 면밀히 검토해 본다.

팀에서 중요한 몫을 해내는 신입 레지던트들. 한 명은 군사 전문 지식을 활용하고, 다른 한 명은 잃어버린 신체 기관을 찾는 데 동참한다.

핼러윈을 맞은 병원. 환자들과 함께 알록달록한 코스튬도 넘쳐난다. 오드리는 로맨스로 발전할 가능성과 회복에 대한 새로운 희망으로 긍정적인 전망을 갖게 된다.

치솟는 기온으로 숀과 대니카 사이의 갈등은 더욱 심화된다. 폭염 때문에 환자들의 생명이 달려 있는 병원 장비들까지 위태로워진다.

미숙아로 태어난 여섯쌍둥이를 살리기 위해 의료진이 전력을 다하는 가운데, 숀은 부모로서의 미래를 생각하며 불안해진다.

까다로운 결정에 직면한 숀. 오드리와의 사이에 있었던 긴장된 상황을 접어두고 그녀에게 도움을 청한다. 한 환자를 맡게 된 모건에게 과거의 트라우마가 떠오른다.

숀이 도입한 새로운 점수 제도로 1년 차 레지던트들 사이에 치열한 경쟁이 불붙는다. 복싱장에서 데이트를 하던 박. 그런데 갑자기 응급 사태가 발생한다.

임신 상태를 유지하기 위해서는 수술을 해야 하는 리. 숀은 실험적인 수술 방법을 추진한다. 오드리는 회복과 연애 사이에서 균형을 잡기 위해 노력한다.

휴가를 떠난 숀과 리. 하지만 길에서 다친 개를 발견하게 되면서 휴가는 뜻밖의 방향으로 흘러간다. 대니카는 친구를 돕기 위해 규칙을 위반한다.

글래스먼에게 잠시 같이 살아도 좋다고 한 숀과 리. 과연 잘한 결정이었는지 다시 생각해보게 된다. 조던은 열세 살 환자에 대해 새로운 사실을 발견하고 걱정스러워진다.

조던은 할머니가 수술을 받는 동안 지켜보기만 해야 했던 사실에 신경이 곤두선다. 숀과 박은 심각한 뇌 질환을 앓는 소년의 치료를 맡는다.

의사 재러드 칼루가 성 보나벤처 병원을 떠난 지 몇 년이 흐른 후 유명인 고객을 치료하기 위해 돌아온다. 박은 한 환자와의 사적인 인연 때문에 곤란해진다.

의료 과실 소송에 대비해야 하는 숀은 아직 실력이 검증되지 않은 젊은 변호사와 가까워진다. 어쩌면 그녀의 강박장애가 유리하게 작용할지도 모른다.

숀은 재러드의 동료가 아닌 상사라는 새로운 역할에 익숙해진다. 한 소년의 심장 질환과 한 소녀의 뇌종양 문제가 팀에게 어려움을 안겨준다.

제러드는 동료들과 친목을 쌓기 위해 노래방의 밤을 마련한다. 앤드루스와 한 동료의 관계가 깊어지고 있던 차에 직장 내 문제가 영향을 미친다.

심각한 부상을 입은 석유 굴착 작업자. 치료 방법이 팀에 큰 부담이 된다. 글래스먼은 검사 결과를 기다리고, 모건은 체외 수정 절차를 진행한다.

숀은 쇠약의 징후로 보이는 글래스먼의 상태에 대해 우려한다. 한 환자의 신앙심을 접한 이들이 자신의 믿음에 대해서 돌아보게 된다.

새로운 생명을 받아들이는 모건. 리 역시 새 생명을 맞을 준비를 한다. 두 커플의 로맨스가 다음 단계로 발전하는 사이 숀과 멘토 사이에는 관계의 골이 깊어진다.

리의 출산 과정이 시작되고, 비극적 사고로 팀원들이 위험한 상태에 처하면서, 성 보나벤처 직원들에게 복합적인 위기 상황이 닥친다.