Når COVID-19 ankommer St. Bonaventure, sliter hele teamet med å få kontroll på situasjonen.

Åtte uker inn i COVID nyter St. Bonaventure-teamet små seire og lider enda et knusende tap.

Flere gode kandidater står i kø for å få praksisplass på St. Bonaventure, og Lim gir Shaun, Claire og Alex jobben som mentor for de mest aktuelle kandidatene. Samtidig klarer Shaun å fornærme Lea, når de diskuterer fordelene og ulempene ved en kontroversiell operasjon.

Morgan og Shauns gravide pasient, som venter tvillinger, har smerter. Dette fører til at legene må ta en beslutning ingen leger ønsker å ta. Shaun ber Lea flytte inn igjen,til tross for at hun har sine betenkeligheter.

Asher sliter med skyldfølelse etter at han ga en feil diagnose til sin første pasient. Park og Moran danner en usannsynlig allianse, mens en alvorlig ulykke gjør at Glassman og Debbie havner i trøbbel.

Dr. Shaun Murphy er et geni på å løse medisinske mysterier, men å arbeide med mennesker byr på store utfordringer. Han er nemlig autist.

Shaun får overraskende informasjon om Lea. Teamet på St. Bonaventure behandler to personer med kompliserte privatliv.

Shaun forbereder seg på å møte foreldrene til Lea. Teamet behandler en eliteturner og treneren hennes – som også er faren hennes. Claire and Audrey tar et oppgjør.

Teamet behandler to pasienter med komplekse bakgrunner, og Claire og Audrey må begge ta et oppgjør. Shaun føler seg tiltrukket av en ny kollega.

Morgan søker en leverdonor til en pasient. En benamputert triatlonutøver må gjennomgå en risikofylt operasjon for fortsatt å kunne samle inn penger til kreftforskning.

Aaron planlegger en prosedyre for å behandle ryggraden til en ung mann. Shaun og Morgan krangler om hva som er best å gjøre når en pasient i koma viser tegn til liv.

En irritabel kirurg må ha hjelp til behandle en tilstand som kan ødelegge karrieren hans. Alex og Morgan er uenige om grunnen til at en pasient opplever kronisk smerte.

Et overraskende besøk tvinger Claire til å se på fortiden sin med nye øyne. To selskapsdansere må ta et vanskelig valg. Alex og Morgan prøver å oppføre seg normalt.

Shaun og Lea finner ut hvilket kjønn babyen deres har. Teamet behandler en hemmelighetsfull MMA-utøver og en feildiagnostisert pilot fra marinen.

Teamet må gjøre alt de kan for å redde livet til to unge skuddofre etter at en politisk protest blir voldelig.

Lea opplever komplikasjoner i svangerskapet og Shauns stressnivå går i taket. Asher krangler med Alex og Marcus om en pasients behandling.

Shaun lar seg oppsluke av arbeidet etter et tap. En av Claires politiske helter blir pasienten hennes. Marcus møter en tidligere mentor.

Shaun og Lea drar på telttur i håp om å flykte fra sorgen. Alex og Morgan krangler om en pasients behandling.

Teamet reiser til Guatemala for å behandle pasienter på et sykehus på landsbygda, der de må bestemme seg for hvilke av de trengende pasientene de kan gi best hjelp til.

Teamet er fortsatt i Guatemala og må ta på seg den vanskelige oppgaven å fullføre tre operasjoner under et strømbrudd på sykehuset.