Shaun mengusulkan tindakan operasi yang rumit demi menyelamatkan nyawa seorang wanita. Morgan dan Alex bersaing untuk mengoperasi pasien lansia yang terdiagnosis kanker.

Shaun melakukan operasi rahang yang masih eksperimental. Debbie mendorong Aaron agar lebih terlibat di dalam kehidupan kencan Shaun.

Claire menghadapi komplikasi saat bersiap untuk memimpin operasi pertamanya. Para staf harus menangani pemancing tanpa merusak hasil tangkapan yang membuatnya jadi juara.

Seorang penganut teori konspirasi yakin bahwa hatinya perlu dioperasi karena ia diracuni. Claire, Morgan, dan Neil menangani wanita yang usus buntunya pecah.

Shaun ditugasi memimpin operasi untuk pertama kalinya. Aaron menemukan sesuatu tentang Debbie yang membuatnya ragu bahwa hubungan mereka akan mampu bertahan.

Konsentrasi Shaun terpecah sebelum melakukan apendektomi. Alex dan Neil bersiap menjalankan prosedur yang rumit. Aaron harus mengambil keputusan sulit soal rekrutmen.

Pasien-pasien baru Neil dan Claire memaksa mereka menghadapi sendiri rasa duka mereka. Cara kerja Debbie menjadi ujian tersendiri bagi Aaron.

Upaya romantis Carly terhadap Shaun membuat mereka berdua sama-sama frustrasi. Sementara itu, Audrey dan Neil berjuang untuk memisahkan pekerjaan dari kehidupan pribadi.

Shaun bersiap untuk tahap berikutnya dalam hubungannya dengan Carly. Seorang pasien yang masih muda harus memutuskan soal perawatan yang berpotensi mengubah kehidupannya.

Shaun menjenguk ayahnya yang sakit parah dan sekarat. Sementara itu, Neil, Alex, Morgan, dan Claire menangani pemain football yang mengalami cedera tulang belakang.

Shaun bergumul dengan perasaannya terhadap Carly dan Lea. Claire memanfaatkan masa lalunya. Marcus harus mengoperasi seorang wanita yang menolak dibius.

Carly dan Shaun menangani pelari ultramaraton dengan kondisi misterius. Claire berjuang untuk menolong seorang remaja yang tumor otaknya muncul kembali.

Ketegangan keluarga meledak ketika ibu Morgan tiba di RS St. Bonaventure. Shaun menyadari bahwa ia masih punya banyak PR bersama Carly.

Shaun bergumul dengan kemungkinan ketenaran yang heboh. Claire, Alex, dan Neil menangani pasien ibu dan anak yang ternyata punya hubungan mengejutkan.

Sementara Shaun kembali mencurahkan dirinya ke dalam pekerjaan, Claire dan Morgan harus bekerja sama menangani gejala gangguan saraf yang dialami seorang mahasiswa.

Shaun mendekati Lea. Alex mencoba membangun hubungan kembali dengan putranya. Tim medis memeriksa pasien wanita muda yang mengalami gejala-gejala misterius.

Shaun masih bergumul dengan rasa kehilangan pribadi, dan Morgan harus mengambil keputusan sulit soal karier. Marcus dan Audrey tak sepakat soal permintaan seorang pasien.

Ketika sebuah pabrik bir lokal dilanda gempa bumi, seluruh tim RS St. Bonaventure mati-matian harus menyelamatkan para pasien dan rekan mereka.

Pada bagian kedua season terakhir ini, tim dokter berpacu dengan waktu serta mengesampingkan keamanan diri sendiri demi menyelamatkan nyawa orang-orang di sekitar mereka.