发生了小儿性犯罪的前科者被推下大楼的事件，石川百合(吉田羊)等人急行前往现场。遗体衣服上残留的手机，收到了9年前因杀害自己儿子罪被逮捕并服刑的日向秀树(江口洋介)打来的电话。秀树起诉冤罪，说要继续寻找杀害儿子的犯人，并预告进一步杀害。被杀害的秀树的儿子，是器官移植法修改后，通过心脏移植拯救生命的奇迹之子，被世人关注的孩子。

日向秀树的儿子大树的班主任，有性犯罪前科的黑崎(冈部隆史)被杀害了。对于高木信次郎(永山绚斗)在案现场，搜查一课的人产生了怀疑。继续调查9年前的事件，发现向大树提供心脏的孩子光的负责医生在事件发生后自杀了。光之父诸星要司(绪形直人)打破了捐赠者家族的规则，找到了接受者的大树，发现去见他了。

在施工现场发现了白骨遗体，遗体被发现是60年前失踪的新人演员野口雅之(泉泽祐希)。雅之的弟弟在失踪前一天曾说过哥哥交往的银幕大明星女演员贵船美沙(有村架纯)“绝对不会原谅”。行为不端的雅之的失踪，虽然有各种各样的臆测，但弟弟怀疑美沙是不是杀了哥哥。百合拜访了时隔60年回到电影界的美沙(松原智惠子)。

体育俱乐部发生爆炸。在烧毁的痕迹中发现了音乐盒形炸弹的汽缸碎片，与2年前的电机店爆炸事件同犯的可能性浮出水面。从汽缸的购买记录中，高原浩(仲村彻)的名字被举到搜查线上，搜查了家宅，除了爆炸的受害者之外，还放置了被认为是进一步目标的人物的照片。为了阻止连续爆破事件，拜访了被认为是目标的当麻涉(音尾琢真)，但是发现了2人的意外联系——。

2019年，律师久保沙织(织田梨沙)在订婚派对中被绑架失踪。百合和高木将事件嫌疑人身份不明的男子铃木和也(松泽匠)从长野县警带到神奈川县警。在车上铃木巧妙地迷惑了百合们。正当铃木开始坦白绑架沙织那天的事情时，同时进行调查的金子(光石研)们在横须贺的空房子里发现了腐败的遗体。

大学打来电话，百合她们赶到的时候，写着“平山阳介是强奸犯”的涂鸦。平山（赤楚卫二）是25年前在校园内被某人杀害的大学明星。如果进行再调查的话，可以知道在杀人事件发生前不久，平山曾有过被认为是肇事者的强奸受害咨询。拜访了受害者牧村美里(山口纱弥加)，但被拒绝协助调查。之后，除了美里以外，还发现有很多受害者。

死后几十年的少女的骨头，在桥边被发现。发现了多个与死因不同的骨折疤痕，出现了虐待的可能性。当时的负责医生作证说，50多年前穿着旗袍的母亲(黑木华)带着女儿来诊疗，但无法停止对女儿的暴力，感到很为难。公开复颜画像后，据说认识少女的记者田岛岬(中岛博子)来搜查一课，拿出和少女一模一样的照片，说“这个孩子是我”。

有一天晚上，在百合的答录机上留下了“我可能杀了人”的信息，立川(泷藤贤一)消失了。最近情况不对劲的立川，据说正在重新调查曾经负责的纵火事件。那是无业的灰原拓郎(竹原手枪)因为离婚的怨恨而放火烧了自己家，烧死了两个儿子的事件。事件发生5年后的现在，拓郎主张无辜，在监狱自杀，事件发生了转变。

1997年，原中国残留孤儿、小区居民大川龙雄（侯伟）被某人杀害了。还有，现在，女儿琴美(原田佳奈)拜访了搜查一课，当时是同一小区的居民，也是事件的目击者川恭介(梨本谦次郎)留下了意味深长的话语“大川先生，对不起”而去世。百合们向当时小区的居民们询问后，知道了大川这个男人过着多么严酷的人生。※本插曲中，使用了一部分歧视性的表现，考虑到故事的演出意图，按照本作品的放映收录。

看到死去的女儿两个相似的少女，引起恐慌的女性菱田千鹤(神野三铃)来搜查一课。根据当时的搜查资料，女儿雅(北香那)被发现是水尸，和失踪的雅女儿米库一起被判定为强行自杀。听了雅临死前生活的母子保护设施代表大野律子(富田靖子)的话，可以知道当时雅对米克有虐待行为。对于这个事件，百合有强烈的厌恶感。