Ο Στράικορ αναθέτει στον Κάος και τον Σπάιρο ν' απαγάγουν τον Κινγκ Πεν στα πλαίσια ενός σχεδίου να κυριεύσουν τα Σκάιλαντς. Η Στελθ Ελφ και η Καοσάντρα γίνονται φίλες.

Οι Σκάιλαντερς ενθουσιάζονται με την επιστροφή του Σπάιρο στην Ακαδημία, αλλά οι παλιοί του φίλοι δεν συνειδητοποιούν ότι ετοιμάζει κάτι.

Τα μυαλά των Σκάιλαντερς φουσκώνουν όταν κερδίζουν το βραβείο των μεγαλύτερων ηρώων στα Σκάιλαντς.

Όταν ο Ίον αυξάνει τον συναγερμό γενειάδας του, ανακαλύπτει ότι υπάρχει ένας προδότης στην Ακαδημία. Ο Ιράπτορ είναι σίγουρος ότι πρόκειται για την Καοσάντρα.

Όταν ο Ίον βγαίνει νοκ άουτ από τον Φουντ Φάιτ, ο Τζετ-Βακ και ο Σπάιρο αναγκάζονται να πάρουν τη μορφή του για μια συνάντηση μ' έναν σημαντικό επιθεωρητή.

Ο Στράικορ αφήνει ένα περιβραχιόνιο για τη Στελθ Ελφ για να την κάνει κακιά, αυτό όμως πέφτει σε λάθος χέρια.

Ο Τζετ-Βακ πιστεύει ότι κάποιος εξαΰλωσε τον Μάστερ Ίον. Γι' αυτόν, οι τρεις κύριοι ύποπτοι είναι ο Ιράπτορ, ο Σπάιρο κι η Στελθ Ελφ, μα όλοι έχουν διαφορετική ιστορία.

Ο Ιράπτορ και ο Σπάιρο θέλουν να μιλήσουν στον Κρας Μπάντικουτ, οπότε ταξιδεύουν πίσω στον χρόνο για να τον βρουν. Όταν επιστρέψουν, το παρόν δεν είναι όπως το άφησαν.

Οι Σκάιλαντερς θέλουν να κερδίσουν τον Κάος και τους Φονικούς Επιδρομείς σε έναν μεγάλο αγώνα που ονομάζεται Σκάιλαντς 500. Η συνεργασία τους όμως αποδεικνύεται δύσκολη.

Προκειμένου να γιατρέψουν τον Σπάιρο από το σκότος του, οι Σκάιλαντερς πρέπει να πάνε σε μια επικίνδυνη αποστολή για να βρουν δηλητήριο Φλογερής Οχιάς.

Οι Σκάιλαντερς πρέπει να φτάσουν στο Άρκους πριν από τον Στράικορ και τα τρολ του, αλλά μπορούν να τα καταφέρουν μόνο μ' ένα ριψοκίνδυνο σχέδιο.

Καθώς οι Σκάιλαντερς τρέχουν για να αποτρέψουν τον Κάος από το να καταστρέψει τον Πυρήνα του Φωτός, ο Στράικορ προσπαθεί να κάνει την Καοσάντρα να συνταχθεί με το Κακό.