大嵐の後、ジャングルは大飢饉におそわれていた。狼たちの会議で、片目のジャックは人間の村へ行って家畜を襲おうと主張。ボス狼はそれに反対し、山向こうに食べ物がないか部下を調査に向かわせる。ジャックは命令に反して人間の村へ行くが、ワナにかかってしまう。助けに向かったのは、二本足の白い狼・ケンだった。

ヤマネコに襲われたケンは噛みついて倒そうとしたが、くすぐったがられただけ。仲間の狼たちにバカにされ、群れを飛び出してしまった。トラから助けたカモシカのじいさんから、白銀のライオンなら牙を与えてくれるだろうと教えられ、ケンとポッポはブラックキャニオンを目指す。しかし行く手には数々の難関が待っていた。

高熱で眠り続けている父の治療法を教えてもらうため、ボンゴは敵対するエンマ族の魔法使い・タマタンに会いに向かった。ケンとポッポはジャングルでボンゴと出会い、エンマ族の村まで同行することに。実はタマタン、魔法使いではなく科学者で、火山の地下にあるという魔法の泉のことをボンゴやケンたちに教える。

社長の率いるハンターたちに、動物たちが次々と生け捕りにされた。社長の息子イサオに、動物を逃がすように頼むケン。社長はイサオの説得に負け、動物を解放する。しかし破産寸前の会社を建て直すためには、新鉱石プラニウムを見つけ出さなければならない。父の窮地を救うため、イサオは一人で怪獣の生息する沼に向かう。

ものすごい音と地鳴りがジャングルに轟き、ケンたちは火山が噴火したのかと様子を見にやって来た。ワシによれば、大きな鳥が火をふいて落ちていったらしい。正体を確かめに行くと、そこには人間の女の子・カラバ国のイスラ姫が意識を失って倒れていた。革命をもくろむ大臣が、姫の乗る飛行機に爆弾を仕掛けたのだ。

空を飛ぶ練習をしていたケンたちは、人間の子どもピクと知り合い、一緒にワシの親分を訪ねる。ワシの親分はケガした息子を助けてくれたお礼に、ケンたちを子分の背に乗せ、空を飛ぶ気分を満喫させてくれる。ピクは空の上から自分の部落が襲われているのを見て地上に降りるが、敵のまだら族に捕らわれてしまう。

狼ばかりを狙うという、片足が木でできた人間が出没していた。森に探りに来たケンは、ムームー団という黒装束の集団から少女チコを救出する。一方、夜になっても帰らない娘を探していたガーガラ族の猟師ガラトは、ムームー団にだまされて捕らわれてしまう。人間を憎むジャックは、ガラトを助けるケンを見て不審を抱く。

カモシカに育てられた人間の子・バブは、一族の移住を提案。新天地を探して、ケンのいるジャングルへやって来た。ケンにやられてばかりのゴリラ、トラ、クマの三悪トリオは、バブにケンの悪口を吹き込んで仲間に引き入れる。そしてポッポを誘拐してケンを魔の岩におびき出し、ナイフを手放させることに成功する。

大地震がジャングルを襲い、火山が噴火して辺りは火の海と化した。ジャングルのみんなは命からがら避難するが、何百年も前に仙人タムタムによってトーテムポールに変えられた「悪魔のガンダル」が、逃げ遅れて火傷で苦しんでいるらしい。ケンたちはタムタムの弟子・ピープーの手を借り、ガンダルを救出するが…。

ムンヒル博士は「月の裏側には必ず生物がいるはず」と、月面探査へのあくなき挑戦を続けていた。39回目の実験で、ロボットを積んだロケットはようやく空を飛ぶが、月へは届かずにケンたちのジャングルに墜落する。チッチがスイッチを入れると、ロボットは博士への通信を開始。ムンヒル博士はジャングルにやって来る。

ケンとポッポは、ボスの思いついたゲームで「見たことも聞いたこともないもの」を探しに出かけた。彼らは、空から降る冷たくて溶けてしまう白いものを発見して大騒ぎ。学識経験者のゾウによると、ゴタゴタ国の科学者サルバによるヘンテコな実験の産物らしい。サルバは女王クレオバトラの圧政に逆らい、投獄されていた。

三人の人間がゾウ狩りにジャングルにやってきた。ケンはゾウの群れに知らせに走るが、狼嫌いのゾウのボスはケンをまったく信用せず、追い返してしまう。チッチとポッポは人間たちのテントに忍び込み、テーブルを荒したり銃で遊んだりと大はしゃぎ。二匹の放った銃声を聞き、ゾウたちは人間への先制攻撃を企てる。

ジャングルに銃声が響く。ゴリラが森で拾ったピストルを持って、いばりちらしているのだ。ゴリラからピストルを取り上げるため、ケンたちは様々な知恵をめぐらすが、どれも失敗に終わる。ピストルを持てばジャングルの王者になれるのだ。しかし、少しでも隙を見せればピストルを狙われるため、ゴリラは…。

チッチが誘拐された。サルの軍隊が狼たちの領土を占拠する目的で、作戦14号を決行したのだ。ケンはサルの前線基地に侵入し、無傷でチッチを奪回する。戦いの火蓋は切って落とされた。ここにサルと狼の史上最大の作戦が展開される！　サルの陣地は難攻不落。狼軍は形勢不利のうえ、さらなるピンチに陥る。

続発する“姿なき怪盗”事件に対し、狼たちは会議を招集。パトロールの強化と特別機動捜査隊の結成が決まった。現場には、たしかに何者かによる痕跡が残されている…。一人旅の白い狼が、警戒中のジャングルに現れたために最重要容疑者に。ケンはジャングルに詳しい怪盗が旅の狼であるはずはないと、仲間を説得する。

ジャングルに花咲き乱れる春が訪れた。浮かれ気分のブラックは、スカーレットというメス狼にひと目ぼれしてしまう。彼女はケンたちの住むジャングルに現れた、流浪の狼一族の娘。ケンたちの一族と流浪の一族は、ゴリラとヤマネコの策略によって対立し、チッチとポッポ、スカーレットまで行方不明になってしまう。

ボスに理不尽に怒られ、ママに説教され、ケンにまで告げ口されたチッチとポッポは「少し心配かけてやれ」と、家出を決行した。二匹は旅の途中で川を渡らせてくれた子ゾウがタチの悪い部族に捕まったと知り、救出に向かうが、代わりに捕まってしまう。二匹の足取りを早耳オウムのクックから聞いたケンは、部族の村へ急ぐ！

アーマンダ王国の世継ぎ・ケント殿下はぎゅうぎゅう詰めのスケジュールに嫌気がさし、客船から逃亡してジャングルにやって来た。革命家のドンドロは、ケント殿下の「王家の宝石」を奪おうと、あとをつけてくる。服を脱いだケント殿下は、ケンに瓜二つ。森のみんなはケンだと思ってケントに接するが、話がかみ合わない。

詐欺師が二人、ジャングルに現れた。怪しい薬を使うのを目撃したゴリラとヤマネコは、盗んだ薬をケンに飲ませることに成功する。ケンが薬でおかしくなっている間に、ゴリラたちはボスの息子ウォーリーを誘拐し、ボスたちを服従させる。一方の詐欺師たちも、象牙を手にいれようと、ボンゴの部落に魔の手を伸ばす。

よくない噂がジャングルに蔓延していた。人間たちが、ドガールのジャングルで原爆実験をするというのだ。ケンの反対を押し切り、狼たちは休火山であるダイナマイト火山の麓に移住することに。他の動物たちも民族大移動を始める。しかし、噂はキラー、大クマ、ゴリラの三悪トリオが巧妙に流したものだった！

豊かな尾長ザルの森に、手長ザルのピッキーが侵入した。ケンは仲裁に入るが、尾長ザルのボスに追い払われてしまう。そのボスが、ケンの持っていた吹矢で倒れた。そうして“吹矢事件”の裁判は始まった。ピッキーはケンが吹矢を放ったと証言。貧しい手長ザルたちは、豊かな森を手に入れようと画策していたのだ。

ジャックとは因縁の仲にある狼・ハイライトが、ジャングルに戻ってきた。大クマはハイライトに、狼一族殲滅の計画を持ちかける。人間のテントを襲い、それを狼たちのせいにしようというのだ。ハイライトの「今夜、オオカミヶ原で会おう」という申し出を受けるジャック。皆の立ち会いの前で、二匹は対峙した…。

サーカスの人気者・ゴリラのモーガンを乗せた飛行機が、ジャングルに墜落した。モーガンは狼一族に助けられるが、人間にひどい目にあわされた経験があるため、ケンを疑いの目で見てしまう。ヤマネコの甘言に乗り、ケンを排斥しようと手をめぐらす彼は、最後の手段として殺し屋の女狐・ネルソンに依頼を持ちかける。

ゾウのオヤジが密猟者に撃たれた。かすり傷だったが、オヤジはゾウの墓場まで付き添ってほしいとケンたちに頼む。ゾウには屍をさらしてはならないという掟があるのだ。同行するケンたちは、道すがら何とかオヤジの気を変えさせようとする。しかし密猟者たちやキラーやヤマネコなどが、一行を執拗につけ狙っていた。

ケンたちのジャングルを月世界と勘違いしたまま、ムンヒル博士が帰還していった。ところが月に自分たちの楽園を建設しようとする悪人たちが、博士の報告を聞いてロケットでジャングルにやってきた。動物を捕まえては無理やり働かせる悪人たち。頼みのケンまで、ワナにかかってロケットに閉じこめられてしまい…。

狼とヒョウがジャングルの王座をめぐって対立し、森の動物たちを二分する大騒動に発展した。狼一族の代表・片目のジャックとヒョウ一族の代表ガラとが雌雄を決しようとした時、まだら族が攻めこんできた。ケンのせいで目の魔力を失ったルーは、復讐心に燃えていた。ケンは窮地の動物たちを救出し、団結を呼びかける。

アラビアの悪者たちが、飛行機でジャングルにやってきた。かれらは赤い谷の密猟者と手を組む一方、ムームーに化けてゾウたちを罠まで誘導しようとする。情報を得たケンは、知らせようとゾウたちのもとに急行する。しかし、ゾウたちは保護者になるという悪者たちの嘘を信じて、ケンの言うことに耳を傾けようとしない…。

ケンたちが出会った子ライオンのポロは、ライオン王国の王子だった。父王がいなくなった後、代理の王となったガンダに命を狙われて故郷から逃げ出してきたのだ。ガンダの知恵袋のキツネが立てた作戦によって、狼族はライオンたちと対立。ポロ王子と王妃がガンダに捕まり、ケンたちは王妃の部下とともに救出に向かう。

チッチとポッポは四匹の見知らぬ狼を発見する。彼らこそ伝説の“幻の狼”だと考えたポッポは、正体をつかもうと後をつけていった。すると狼一族は、ポッポが幻の狼に誘拐されたと誤解して追撃を開始。だが四匹は、故郷を追われて逃げ出してきたに過ぎなかった。それを知ったケンたちは、攻撃を止めさせようとする。

遊びに出かけた見知らぬ土地で、ポッポが熱病に取りつかれてしまった。ケンとチッチは、キツネのコンチから霊験あらたかなワーニィの神の噂を聞き、ポッポをかつぎこむ。しかし、そこには神官の白猿チンパンのお祈りを待つ長い行列ができていた。そのうえ行列係の白猿パンジーは、お供物と称してワイロを要求していて…。

ひと月以上日照りが続いていた。川も沼も乾ききり、住み慣れた土地から引っ越す動物も出始めている。動物たちが注目する中、水を求めて土を掘り始めたケンは、モグラたちの協力でわずかな湧き水を探し当てる。だが、その水を好きなだけ欲しがるゴリラは、いっそ奪ってしまおうと、大クマやトラのキラーたちをたきつける。

空の王者として君臨する志を授かろうと、ハゲワシのボスはコンドルのアマゾン・コンドール氏を招く。コンドールはハゲワシたちのヒクツな根性を叩きなおすべく、生きた獲物を追う特訓を開始した。強い者だけが生き残れると主張するコンドールに、ケンはみんなが一緒に生きていく方法があるはずだと異を唱えるが…。

狼のボスが病に倒れた。ケンは悪魔の森に一本だけ咲いているという、万病に効く光る花を求めて旅立つ。一部始終を聞いていたヤマネコは、花を横取りしようと後を追う。一方、置いてけぼりにされたチッチとポッポは策略をめぐらせ、ケンと合流。底なしの湖に住む白い大蛇が、悪魔の森への道を知っているらしいが…。

ジャングルは激しい嵐に襲われ、食糧難に陥っていた。チッチとポッポは、濁流に流されてきたライオンの子ども・リオンを助けて家まで送り届けようとする。ところが、無邪気なリオンは、空腹で殺気立った森の動物たち相手にいたずらし放題。襲ってきたゴリラとクマから逃げ出すが、チッチとポッポからはぐれてしまう。

教育ママに説得され、子どもの教育を見直すことにしたボス。子狼たちの模範になるようにと、チッチ・ポッポ・ケンそして息子のウォーリーに、ボーイスカウトを組織させる。その夜、ボスの家から大量のバナナが盗まれる事件が発生。ケンたちは捜査に乗り出し、犯人のゴリラを発見する。けれど、団長のウォーリーは…。

森の動物たちが、謎の光る目に次々と襲われた。さらった動物たちを返せと、ワシの親分はケンに詰め寄る。遠吠え、足跡…狼族のしわざと決めつける森の動物たちは、ブラックを人質に取る。誤解を解くために動物たちと話し合いを試みるケンだが、とりつく島もない。そんな中、トラのキラーだけはなぜか狼たちをかばう。

三悪はケンを倒そうと、ヤマネコのコーチでトレーニングを続けるが、うまくいかない。そこでヤマネコは、知恵者の銀ギツネに悪だくみのアドバイスを受ける。知恵をつけた三悪は、泉の水を飲んで怒りっぽくなった動物たちをそそのかし、狼一族を追放しようとする。狼たちはジャックを先頭に戦おうとするが…。

嵐の夜、ケンたちは道に迷った鹿の親子を保護した。チッチとポッポは、友達ができて大喜び。狼たちはケンの説得で、牡鹿の足のキズが癒えるまで親子鹿を守ると決めた。しかし、よそ者を食料としか思わない三悪が、親子鹿に目をつけた。それぞれ獲物を独り占めしようとする彼らは、狼一族のガードにはばまれるが…。

ボスの音頭を取り、チッチ、ポッポ、ウォーリーをピクニックに連れて行くことになった。ケンとママも同行し、狼たちはイカダに乗って川を下り、釣りや泳ぎを楽しむ。だが、ボスが目をはなした間に、ウォーリーが行方不明になってしまう。やんちゃな子ライオン・コニーのオモチャにと、父のキングがさらっていったのだ！

ナゾの物体が、一本杉から落ちてきた。物知りのボスによると、ヒマラヤの怪鳥・スカイキングの卵らしい。卵からかえったヒナにポッポは夢中になり、ヒナもポッポになついて楽しく過ごす。だが、ヤマネコの告げ口で誤解したスカイキングが狼一族を襲い、ヒナを奪い返す。さびしくてたまらないポッポは…。

毎日美味しいものを食べて、遊んで暮らしたい…ボスに説教されても、チッチとポッポはそんな夢をあきらめられずにいた。人間の飼い犬と出会った二人は、かっこいい首輪をつけて毎日美味しい食事をもらえる犬になろうと決心する。一族の反対を押し切って人間のもとで暮らすチッチとポッポだが、狼狩りの案内をさせられ…。

ケンたちは乱暴な黒熊族の縄張りに迷い込み、捕らわれてしまった。黒熊族が信仰する熊神様のお告げでは、人間を生贄にして地獄谷から突き落とせば、鉄砲で撃たれた坊やのケガが回復するという。窮地に陥ったケンは坊やの傷を治し、巫女の婆ぁ以外の黒熊の信頼を得る。先に解放されたチッチたちは、そうとは知らず…。

ケンは見慣れない狼に襲われていたトンガ族長の娘・チノを救い、友だちになる。その狼・シルバーは人間を親の仇と憎み、ケンが狼族の一員だと知っても納得できない。チノと約束の指きりをしているケンを目撃したシルバーは、ケンがトンガ族のスパイだと告発。そしてブラックとともに、トンガ族の住処を襲おうとする。

平和な森に矢が放たれ、ブラックが傷を負った。ジャックは、狼と人間が互いの領域を侵さないという掟を、自分が先に破ったと名乗り出る。そのあげくボスに歯向かい、ウォーリーを連れて一族を抜けてしまう。なにかわけがあると感じたケンは、ジャックの後を追う。一方、人間と狼を戦わせようとするヤマネコたちは…。

ハンターのダンケは世界記録を塗りかえようと、森の動物を次々に銃で撃っては捕らえていた。狼の会議に参入したゴリラは、目には目をで人間を殺せと主張。その役目をケンが負う。ダンケはケンにも、生け捕りにしたという動物の居場所は教えようとしない。役目を果たさずに帰ってきたケンに、狼たちは不信の目を向ける。

ロバート家のお嬢さま・キャシーと犬のシロは、ジャングルで迷子になった。どちらもチャーミングで、ケンたちともすぐに仲良くなる。文明ノイローゼで静養に来ていたキャシーは、狼の仲間になると言い出す。ボスはしぶしぶながら、仲間になるためのテストを行なう。だが、ロバート家にはジャンという厄介者もいて…。

ケンの人間の友だちボンゴは、亡くなった父のあとを継いで族長になるため、掟に従って三つの勇気を示す旅に出た。就任祝いのつもりで駆けつけたケンは、応援しようと一緒に旅をすることに。だが、族長の座を奪おうと、ザザンと部下がボンゴをつけねらう。ギャラガ族に捕らえられた少女を救った二人に、大ヒヒがせまる！

メガネザルのボスの息子・プッペは、イタズラの度が過ぎるため、狼一族に預けられることになった。立派な指導者として見込まれたボスは張り切ってプッペを教育しようとするが、予想をはるかに上回るわんぱくぶりにクタクタになってしまう。ヤマネコがそのブッペに目をつけ、狼とメガネザルを争わせるために誘拐を企てる。

ブラックが隠していたバナナを食べたのは、ライオン少女・リラだった。リラは親がわりだったリーダーの仇を討つため、黒いライオン・ザンバを探す旅の途中。ケンはジャックたちの反対を押し切り、リラを助けようと行動を共にする。だが、ヤマネコとゴリラがリラに目をつけ、ケンたちの乗ったイカダを壊してしまう。

いたずら好きのカケスが奪ってきた人形を、ケンとチッチとポッポは、持ち主の少女に届けてあげることにした。怒ったボスは、ケンたちを追放すると宣言。生きて渡った者はいないワニ河にケンたちが着いた時、人形の持ち主の少女・ルミが向こう岸から漕ぎだした！　ワニの大群から少女を救おうと、ケンは河に飛び込む。

ジャングルに墜落した飛行機で、ただ一匹生き残ったジミーは、ライオンとヒョウの間に生まれた子どもだった。動物園で皆に愛されてきたジミーだったが、ライオンとヒョウのどちらからも仲間として認められず、ショックを受ける。その頃、ジャングルには無敵のオオワシ・ギガンテが戻り、わがもの顔で荒らしまわっていた。

ママが過労で倒れてしまった。ケンたち三兄弟はハゲタカじいさんに乗せてもらい、特効薬のゴールドメロンを探す旅に出る。途中で友だちになったトラの子・パンチは、タイガー族のボスの子で、ゴールドメロンを分けてくれると言う。だがパンチの父親は、身分違いのものにはやれないと拒否。反発する現代っ子たちは…。

ゴリラたちの攻撃を受け、狼のあいだに負傷者が増えていた。そんな時、ゴリラから『新しい狼のボス・ジャック』宛てに手紙が届く。そのうえ、ゴリラやクマを倒した黒い狼のもとへ、ブラックが仲間を連れて出て行ってしまった。息子のウォーリーにも愛想を尽かされ意気消沈するボスに、ヤマネコは名誉ある引退を勧める。

チッチ、ポッポ、ウォーリーの遊び仲間、子ゾウのダルは体が大きく重いので、みんなの遊具を壊してしまった。怒った子狼たちはダルをのけ者にする。そのことを注意したケンに、子狼たちは絶交を宣言。やせたいと願うダルは、スマートなヤマネコの言うがままに勲章を首にかけ、子狼たちに見せびらかしに行くのだが…。

ライオン国の皇太子・ローリーは臆病者。武者修行の旅の途中で、ケンと知り合う。ライオン皇帝からローリーの再教育を頼まれた狼のボスは、一族をあげて鍛えようとするが、うまくいかない。ケンはローリーに勇気をもたせようと、コウモリの森へ案内する。チッチは暗示をかけることを思いつき、一枚の葉っぱを見せる。

ケンが知り合った宿無しの狼の子バリーは、言葉も態度も、お世辞にも褒められたものではない。バリーはヤマネコや三悪さえ翻弄するが、自分の行動が皆に迷惑をかけていることに気付かない。強がりを言うバリーだが、実は生き別れのママを探し求めていたのだ。その頃、まだら族が、狼一族を全滅させようと罠を張っていた。

チッチとポッポは、川向こうのサル族の元ボス・クーパーじいさんに出会った。現在のボスである息子の口うるささに、家出をしてきたという。共感したチッチとポッポは、内緒でクーパーじいさんをかくまう。だが、大喰らいで勝手気ままなじいさんに、ふりまわされるはめに。さらに、じいさんが三悪たちに目をつけられ…。

魔法の国を求め、ケンたちのジャングルにタクシーでやって来たノバック教授。事故から助けてくれたケンを大魔法使いと思い込み、弟子入りを志願する。断ったケンだが、教授を放っておけずにバナナを差し入れる。それを呪文で手に入れたと勘違いした教授は、自分も魔法が使えるようになったと大喜びする。

狼のボスの息子・ウォーリーは、後継者教育に張り切るパパのスパルタぶりとお説教にげんなり。他の子を褒めて自分をなじる父親に、ウォーリーの心はすさみ、チッチたちにもイジワルをしてしまう。親子ゲンカの末に家出したウォーリーは、全てはケンがウォーリーを侮辱したせいだとヤマネコに吹き込まれ…。

ミミザルたちが先祖代々守ってきたウルトラメロンが、何者かによって盗まれてしまった。ミミザルのボスの息子ポリーと共に、ケンとチッチとポッポは捜査を開始。一方のヤマネコと三悪は、ミミザルの領地で発見した毒メロンを利用して狼一族に催眠術をかける。三悪のいいなりとなったボスやジャックたちは…。

ケンたちが海岸で見つけた壺には、魔王が閉じこめられていた。魔王は助けてくれたお礼に、二つの願いをかなえてやると約束する。「面白い国へ行きたい」と願うケン。その国は、占い師の予言した新王・ケンのおでましを今か今かと待ちかまえていた。ところが新王の座をあてにしていた、遠縁の閣下がいて…。

シャーウッドの森から来たビスマルクは、高齢だが血気盛んな狼だった。勇者としての威厳を誇るビスマルクに、ジャックはメロメロ。さらに、大蛇にのまれたイダテンのヤスを救出。ついに信任投票で新しいボスとなり、みんなを強い狼にするべく猛特訓を始めた。一方のケンは、群れから離れたボスを励まそうとする。

ペンギンのペンケルが、間違えてジャングルに送られてきた。冷却装置つきの鳥かごに入ってはいるが、電池の寿命はあと半日ほど。冷たい環境でなければ生きられないペンケルのため、ケンは氷を求めて悪魔の山・マウントジャイアンツをめざす。だが山には怪しい「巨人の目」があり、登山者の目を焼くらしい。

ヤマネコに追われる迷子の子豚を助けたケンは、トントンにある家まで送り届けることにした。この美味しそうな行進を三悪たちが見逃すわけもなく、道中をつけ狙う。姿は同じでも性格はてんでバラバラな五匹は、なかなか歩調がそろわない。マイペースの子豚・ペックをさらうことに成功したゴリラだったが…。

行き倒れになった見知らぬ狼を、ケンは医者サルのもとへ連れていき、最期を看取った。一週間後、トミーという狼がジャングルに現れた。トミーは、かつてないきびしい寒波に襲われた北国から、助けを求めに先行した親友シェーンの行方を捜していたのだ。ヤマネコたちは、ケンがシェーンを見殺しにしたと、トミーをだます。

ジャングル人気ベスト３から転落した狼族の名誉回復のため、ボスが考えたのは一日一善運動、通称マルバツだった。賞品目当てに、あの手この手で点を稼ぎまくるブラック。なかなか○をもらえず、あせったチッチとポッポは、不本意ながらヤマネコのアイディアに乗ってしまう。ケンは○×をやめようとボスを説得するが…。

春雷が鳴り響くジャングルに、薬草を求めて博士の一行がやってきた。ケンは博士に、狼たちは危害を加えなければ人間を襲わないと伝えるが、博士は信用しない。クマとゴリラに荒らされたテントを見て、博士は狼の仕業と思い込み、行方不明になった息子のポールを探しに狼の領地へ向かう。その時、雪解け水が起こす洪水が…。

服を着たまま人間社会から逃げてきた、チンパンジーのサムとハリー。人間のマネが得意な二匹は、ずる賢いところも人間にそっくり。ジャングルで楽に暮らすため、ここは恐ろしい実験場になるから早く逃げろと、動物たちにデマを流す。さらに、情報を確認するため人間のところへ向かうケンたちに睡眠薬を飲ませる。

ケンたちはジャングルで倒れた少女のため、血清を求めてα国探検隊の基地へ向かった。普通に歩いたら三日はかかる距離を一日で往復しなければ、少女の命は助からない。地獄の洞穴を通り抜け、無事血清を手にしたケンたち。しかし帰る途中で、α国と敵対するβ国の探検隊に身柄を拘束され、血清は割られてしまう！

チッチとポッポをヤマネコから救った狼のブレイクは、ボスの幼友達で命の恩人らしい。ボスには覚えがなかったが、三悪をものともしない強いブレイクに、チッチとポッポは厚い信頼を寄せる。しかしブレイクの信用は、皆に断食させている間に自分だけ飽食していたことがバレたことで、一気に失墜してしまう。

動物園に暮らすゴリラのボス・アンクルは、甥のゴリラがＴＶスターになったと知る。だがＴＶ番組『狼少年ケン』で、甥のゴリラはケンに負けっぱなし。ゴリラ族の名誉を回復するため、アンクルは甥のもとに駆けつけて二匹がかりで戦うが、それでも敵わない。ボスの情けない姿をテレビで見た、動物園のゴリラたちは…。

可愛い子鹿を見て、弟が欲しくてたまらなくなったチッチとポッポは、夢の中でコウノトリのおばさんに頼む。翌日あらわれた狼の坊や・チッポーを、チッチとポッポは弟だとみんなに紹介するが、信用してもらえない。さらにチッポーは、倉庫のバナナを盗んだと疑いをかけられる。集落の近くに怪しい狼までうろつき始め…。

男爵家の娘シルビアは、ケンの忠告も無視して、森の動物に乱暴狼藉やりたい放題。母親を亡くしたショックで、すっかり荒んでしまっていたのだ。シルビアはちょっかいを出したウォーリーを穴に落とすが、ヤマネコの策略に利用されてしまう。それぞれ肉親を殺されたと思いこまされた狼族と人間は、戦争勃発の危機に陥る！

いつもは獰猛なワニ河のワニたちが、河べりでぐったりしている。ケンたちは一肌脱ごうと、原因の調査を始める。森の茂みで山盛りの魚を食べていたゴリラ・クマ・ヤマネコが怪しいが、証拠がない。ボスの水質検査でも異常が見つからない。ワニの口を掃除するワニチドリに聞いてみると、朝には異常がなかったというが…。

ママから白雪姫の話を聞いたケンは、チッチとポッポにからかわれながらも、お姫さまが登場するおとぎ話の世界に憧れる。その夜、枕元におとぎの国の妖精が現れ、『狼少年版・白雪姫』が始まる。しかし三悪が魔法使いの手下となり、魔法の杖でケンを捕まえてしまう。本来の『白雪姫』の話とは微妙にずれてゆき…。

ジャングル裁判が始まった。被告は狼のボス。大火事のドサクサにまぎれてサルを殴り、穴に埋めておいた食料を盗んだというのだ。証拠の数々はボスに圧倒的不利。さらにヒョウ検事はブタやヤギを証人に呼び、童話における狼の残虐性をアピールする。狼は森から追い出せとの声が巻き起こる中、弁護につくケンは一体どうする？

狼のボスの元に速達が届いた。40年来音沙汰のなかった兄のベスが帰ってくるというのだ。かつて英雄として狼族の危機を救ったものの、慢心したベスは孤立し、群れから去っていったのだった。歓迎会の準備を始めるケン。森へ向かうベスを見かけたヤマネコは、クマとゴリラに報告し、ベスを捕まえようとする。

牛のように大きくて強いライオン・グレートが、息子のポロを連れてジャングルに戻ってきた。グレートは母を亡くしたポロに、百獣の王としての厳しい教育を施す。ケンはグレートに腹を立てるが、ボスはライオンには独特の育て方があるのだと取り合わない。とうとうポロは、崖から落ちて大怪我をしてしまう。

ケンはやせた子ブタ・ジュジュを助ける。ジュジュは親兄弟にうとまれたと感じて、家出してきたらしい。ボスは狼のイメージアップのため、ジュジュを特別待遇。ごちそう食べ放題の“お客”の立場が気に入ったジュジュは、怠け放題で太ってゆく。ジュジュのために食糧事情の悪くなった狼たちからは、不満の声が上がり…。

妄想に浸っていたところをボスに邪魔をされたブラックは、ボスよりえらくなりたいと望み、ヤマネコに教わった沼の洞窟で魔王と名乗る声の主から魔力を授かる。ブラックの魔術はボスを宙に浮かせ、三悪をも踊らせる。怪しんだケンはジャックとともに調査を始める。ブラックは魔術を使う古ギツネに操られていたのだ！

ジャングルで交通事故が続出。無鉄砲に走り回る野牛のロックが原因だった。ロックはあちこちで暴れまわってきた、フダ付きのならず者。ボスはロックを砂地獄におびき出すが、かえり討ちにあって生き埋めにされ、重体となってしまう。三悪は裏で甘い汁を吸おうと、ロックをおだててジャングルのボスにしたてあげる。

大地の割れ目にボスが落ちてしまった。ケンはボスを探しに、ブラックと地下へ降りてゆく。広大な地底を探険し、ようやくボスを発見するが、そこには巨大な地底城がそびえていた。地底国の女王・マリエラは、太陽の光にあこがれていた。そのマリエラたちと対立する地底人に、チッチとポッポを捕らわれてしまう。

体操、宿題、お使い…ボスやママの小言を聞かずに幸せになる方法はないものだろうか？　チッチとポッポはフクロウから、ユニコーンを捕まえれば幸せになれると聞き、ケンを誘って探索の旅に出る。それを知ったヤマネコとゴリラとクマの三匹は、ケンたちよりも早くユニコーンを生け捕ろうと、あの手この手を試みる。

母親のお産のあいだ預けられている、いとこのリリーをめぐって、チッチとポッポはケンカばかり。いいところを見せようと張り切っているのだ。そんな二匹に、リリーはあろうことか、ペットにするためクマとゴリラを生け捕ってくるようおねだりする。ワガママ放題をケンに注意されたリリーは、怒って森の奥へ向かい…。

クマたちがジャングル学校を設立した。わんぱくたちを集め、悪い狼を倒してジャングルから追い出すよう、洗脳するのが目的だ。だが、子どもたちのあまりのヤンチャぶりに学校は早々に廃校。残された子供たちとチッチ、ポッポは仲良くなり、共同戦線でイタズラを開始する。さらには、ゴリラやクマをやっつけようとして…。