Le capitaine Burnham et l'U.S.S. Discovery est envoyé pour récupérer un mystérieux vaisseau romulien vieux de 800 ans ; jusqu'à ce que l'artefact caché à l'intérieur soit volé, menant à une poursuite épique. Pendant ce temps, Saru se voit offrir le poste de sa vie et les efforts de Tilly pour l'aider à se plonger dans un enchevêtrement de secrets.

Lors de la dernière mission de Saru en tant que numéro un du capitaine Burnham, l'équipe s'aventure sur une planète apparemment abandonnée pour rechercher ce qui pourrait être le plus grand trésor de la galaxie.

Sur Trill, le capitaine Burnham, Book et Culber doivent passer un test dangereux pour prouver qu'ils sont dignes du prochain indice. Adira renoue avec Gray et le premier jour de Saru en tant qu'ambassadeur est compliqué par ses fiançailles avec T'Rina.

En route vers le prochain indice, l'U.S.S. Discovery est saboté par une arme mystérieuse. La capitaine Burnham, Rayner et Stamets sont les seuls membres de l'équipage à pouvoir sauver le vaisseau à temps.

Le capitaine Burnham et Book voyagent dans l'espace extradimensionnel à la recherche du prochain indice sur l'emplacement du pouvoir des Progéniteurs. Pendant ce temps, Rayner effectue sa première mission aux commandes de l'U.S.S. Discovery, et Culber s'ouvre à Tilly.

Alors qu'elle est infiltrée dans une société d'avant distorsion, le capitaine Burnham est obligé d'envisager d'enfreindre la Directive Première lorsqu'une tradition locale menace la vie de Tilly. Pendant ce temps, Culber essaie de se reconnecter avec Stamets, et Adira intervient lorsque Rayner lui assigne une position sur le pont.

Alors que Moll et L'ak sont enfin détenus, la Fédération se retrouve au cœur d'une tempête diplomatique et éthique lorsque les Breens arrivent et exigent qu'ils leur soient livrés.

Après que Moll et les Breen aient capturé une mystérieuse structure contenant le pouvoir des Progéniteurs, le capitaine Burnham doit mener une mission secrète pour la récupérer avant que les Breen ne découvrent comment l'utiliser.

Piégée à l'intérieur d'un mystérieux portail extraterrestre qui défie les règles familières du temps, de l'espace et de la gravité, la capitaine Burnham doit combattre Moll – et l'environnement lui-même – afin de localiser la technologie des Progéniteurs et de la sécuriser pour la Fédération. Pendant ce temps, Book se met en danger pour aider Burnham à survivre et Rayner dirige l'U.S.S. Discovery dans une bataille épique où le vainqueur remporte tout contre les forces Breen.