U.S.S. Shenzhou patrolira rubom federacijske galaksije i nailazi na nepoznat objekat.Kapetanica šalje svoju prvu zamjenicu da istraži o čemu se radi.Vijest koju je donjela Michael Burnham nakon povratka na brod nije nimalo veseo.

Suočeni sa klingonskom prijetnjom i pokušajem da(Michael Burnham) smjeni kapetanicu i napadne klingonski brod, U.S.S. Shenzhou i njegova posada ulaze u neizvjesnu budućnost koja će ubrzo postati još gora dolaskom klingonskih brodova.

Na putu prema zatvoru događa se nesreća a Michael Burnham je spašena u zadnjem trenutku od strane misterioznog federacijskog broda Discovery.

Kapetan Lorca i njegova posada dobijaju zadatak da odbrane rudarsku koloniju koja proizvodi dilitijum a napali su je klingonci.U međuvremenu Michael Burnham se trudi da shvati neobično biće koje je povezano sa brodskim pogonom.

Kapetan Lorka neočekivano postaje zarobljenik Klingonaca.Posada pokušava da pronađe način kako da izbavi Lorku.Burnham donosi loše vijesti o dugoživcu koji im je potreban kao navigator pogona na spore.

Vulkanski mirovni emisar Sarek na putu prema skrivenoj destinaciji je u opasnosti nakon pokušaja atentata na njega.Burnham, Tili i novi član posade Tajler imaju zadatak da ga pronađu i spase od sigurne smrti.Kapetan Lorka se bori sa svojim ličnim demonima dok klingonci spremaju još jedan napad na Federaciju planeta.

Diskoveri je zaglavljen u vremenskoj petlji koju je stvorio kriminalac Mudd i želi se osvetiti Kapetanu Lorki tako što će brod predati klingoncima.Jedini koji je svjestan događaja koji se neprestano ponavljaju je Stamets i upozorava Burnham koja mora otkriti kako da spriječe da Mudd ostvari svoj cilj.

Nakon niza klingonskih napada na brodove federacije posada diskoverija se uputila na planet Pahvo koji krije rješenje protiv klingonske tehnologije sakrivanja letjelica.Admiral Cornwell dobija neočekivanog saveznika u zarobljeništvu kod klingonaca.

Posada Diskoverija zanemaruje naređenja i ostaje da brani planet Pahva od klingonaca.Istovremeno Stamets dobija naređenje da izvrši 133 mikro skoka oko klingonskog broda mrtvih kad Burnham i Tajler postave odašiljače na klingonski brod koji će im pomoći da razotkriju tehnologiju prikrivanja brodova.

Diskaveri je zapeo u nepoznatom svemiru i morat će da iskoriste svu domišljatost i znanje da se izvuku iz nevolje u koju su upali.

Burnham nastavlja svoju ulogu kapetanice, a uskoro dobija priliku da se susretne sa vođama otpora.Tili pokušava da spasi Stameta.Tajler priznaje strašnu istinu i teranci ga osuđuju na smrtnu kaznu koju Burnham iskorištava da pošalje poruku Diskoveriju.

Burnham je na putu prema imperijalnom brodu na kojem će se susresti sa caricom terana.Stamets polako dolazi sebi a ono što je saznao zarobljen u micelijalnoj mreži može ih sve ubiti.Saru traži pomoć od L" Rell.Lorca je odigrao svoju ulogu a Burnham shvata o čemu se radi.

Lorka diže uspješnu pobunu protiv carice kojoj pomaže Burnham.Saru i Stamets traže način kako da sačuvaju micelijansku mrežu od daljnjeg propadanja.U.S.S. Discovery se uspješno vratio u svoj svemir ali opet ih čekaju mnoga iznenađenja.

Burnham and the U.S.S. Discovery crew are faced with the harsh reality of the war during their absence. In order to move forward, Starfleet must use unconventional tactics and sources to take their next action against the Klingons.

Sa teranskom caricom kao kapetanom broda posada Diskoverija kreće prema Klingonskom matičnom planetu u namjeri da ga unište i tako preokrenu rat u svoju korist.