Когато Джак очевидно се превръща в отцепник, Надзорът се свързва с Мак, който живее в Нигерия, за да го помоли да се върне обратно и да спаси своя приятел.

Джак получава съобщение за помощ от свой стар приятел от специалните части, който погрешно е обвинен в тероризъм в чужда държава. Макгайвър и Джак събират стария екип на Джак и организират неофициална спасителна мисия.

Макгайвър, Райли, Боузър и Леана влизат под прикритие в университетски кампус, за да разкрият опасен агент под дълбоко прикритие, който вербува студенти, за да извършват смъртоносни терористични атаки из целия свят.

Макгайвър и Райли търсят начин да прекарат пълен с течен кислород танкер през район, окупиран от бунтовници, и да го доставят в детска болница, преди да е станало късно. Междувременно Макгайвър трябва да реши дали да допусне баща си в живота си.

Макгайвър и Джак заминават спешно за Мексико, за да измъкнат шефа си след неуспешен опит за залавяне на лидер на наркокартел, докато Боузър и Райли използват Хелоуин, за да съберат информация за човек, обвинен в измама.

Мърдок отвлича приятелката на Макгайвър, за да го принуди да му помогне да спаси отвлечения си син. Но междувременно се появява опасен човек от миналото на Мърдок, с чиято помощ Мак успява да надзърне в миналото му.

Макгайвър и екипът са изпратени от Мати в Гана, за да вземат твърд диск от бунище за електронни отпадъци, но когато Мати отказва да разкрие какво има на диска, екипът се впуска в догадки какво ли би могло да е толкова важно за нея.

Макгайвър и екипът поемат на опасна операция, след като ирландски военен шпионин се свързва с тях, твърдейки, че знае местонахождението на "Призрака" - специалист по изработване на гибелни бомби, когото Мак преследва от години.

Когато стъкленица с опасен вирус е открадната от Центъра за контрол на заболяванията в Атланта, Макгайвър и екипът трябва спешно да я открият, преди крадецът да е причинил глобална пандемия.

Мати разкрива пред екипа шокираща тайна - тя има съпруг, който от осем години е под прикритие в престъпна организация, но има опасност да бъде разкрит и Макгайвър трябва спешно да го открие и измъкне, преди да е станало твърде късно.

Мак и Джак заминават на уикенд в Лас Вегас, но малката им ваканцийка е прекратена, когато двамата биват отвлечени и затворени в бетонно помещение. Междувременно Мати възлага на Райли, Боузър и Лиана да откраднат диамант с кодирана информация.

Екипът се съюзява с жена, която денем е всеотдайна майка, а нощем е изпечен крадец, за да заловят един от контактите ѝ - престъпник, нает да открадне бомба с радиоактивен компонент.

Макгайвър мери ум гениален изнудвач, който е поставил бомба на кораб, за да получи няколко милиона долара. Докато Макгайвър и Чарли са близо до откриването на кораба, ужасен инцидент заплашва живота на Макгайвър, ако не успее да надхитри изнудвача.

Макгайвър трябва да открие двоен агент, отговорен за смъртта на трима други агенти и макар че Мак не желае да се заема с тази задача, той склонява, когато се запознава с красивата Виктория, която ще работи с него.

Екипът трябва да прибере тялото на пилот, чийто самолет се е разбил при изпробването на експериментална система за лазерен мапинг, разработена от Макгайвър. Междувременно Райли се опитва да открие хакера, който е предизвикал съвместния ѝ арест с Елууд.

Раненият Макгайвър се намира в доминирания от Съветския съюз Афганистан, където се сприятелява с афганистанско момче, което го приютява в дома си, докато се възстанови, без да е сигурно, че той ще има този шанс.

Макгайвър и тийнейджърка компютърен гений, сдобила се със секретна информация за отбранителна технология, се опитват да предотвратят възможна катастрофа, когато става ясно, че вражески агенти знаят за момичето и искат информацията за свои цели.

Макгайвър е изправен пред странно и страшно предизвикателство, когато търсещи мъст жители на пустееща земя го взимат като заложник заедно с цял влак пътници. Сега Мак трябва да приложи необичайните си умения, за да разреши тази привидно безизходна ситуация.

Макгайвър е в затвора, за да помогне за бягството на затворник, но скоро собственият му живот се оказва застрашен и бягството се превръща в истинско предизвикателство за уменията му.

Макгайвър прониква в руска психиатрична клиника и с поредица от дръзки ходове, застрашаващи живота му, той трябва да открие и измъкне политически затворник, преди и двамата да бъдат убити.

Макгайвър се надпреварва с времето, за да залови професионален убиец, приел поръчка да убие архиепископ, независимо от обстоятелствата. За да спаси архиепископа, Макгайвър рискува собствения си живот, преди убиецът да нанесе нов удар.