Rodzina Nektonów otrzymuje wiadomość o zaginięciu dziadków. Wspólnie wyruszają na ich poszukiwanie. Podczas wyprawy trafiają na niebezpieczne bobbity.

Córka pirata Madeline wyrusza na poszukiwania wraku największego portugalskiego statku pełnego skarbów. W uszkodzonym pojeździe odnajduje ją Ant. W starciu podwodnych potworów, uwięzionym ludziom pomoże rybka Jeffrey oraz rodzina.

Podczas poszukiwań dziadków Nektonowie trafiają na... znikające wyspy. Okazuje się, że są to jaja olbrzymich żółwi.

Nektonowie otrzymują współrzędne miejsca, gdzie spoczywa figurka będąca własnością dziadka. Ruszają by ją odnaleźć. Jednak wyprawa okazuje się być... pułapką.

Madeline dostaje się podstępem na statek Nektonów, skąd kradnie drogocenne berło. Rodzina chce je odzyskać, niestety artefakt znika w głębinie. Istnienie Lemurii zaczyna być interesujące również dla piratów.

Przyjaciółka rodziny Nektonów chce zbadać starą jaskinię. Poszukuje szklanej kapsuły sprzed wieków, w której książę Raja badał głębiny. Niestety skarbu chroni potwór, którego rodzina już raz spotkała na Grenlandii.

Nektonowie zostają wezwani na pomoc w uratowaniu kontenerów dryfujących na oceanie. W czasie akcji w pobliżu pojawia się celebryta Devil Daniels, który zamierza przejąć ładunek i sprzedać go w najbliższym porcie. Reklamujący się jako ekowojownik i przedsiębiorca w rzeczywistości nie dba o przyrodę, tylko o siebie.

Zaginął robot Anta, który miał sobie poradzić z plastikowym wirem śmieci na oceanie. W poszukiwaniu Rika rodzina Nektonów trafia na ogonicę, stworzenie, żywiące się planktonem, zbudowane z żelu i lepkiej błony, która przyciąga do siebie nie tylko plankton, ale i zanieczyszczenia. Aby ją uratować, trzeba wydostać ją z domku.

Ant and Fontaine discover the secret of the Bajau Laut people, a tribe of sea nomads living in the South China Sea. The pair are determined to help them - but how do you find a fish that walks?

Ant i Fontaine ratują niedźwiedzia polarnego ze środka oceanu. Kiedy wprowadzają niedźwiedzicę na pokład, zdają sobie sprawę, że jest bliska porodu.

Fontaine jest zdumiona, gdy Finn dzwoni do niej i mówi, że wykrył sygnał z zaginionej łodzi podwodnej jej dziadków. Czy to pułapka?

Okręt podwodny zostaje uwięziony w zaskakującym miejscu. Nektonowie rozpoczynają skomplikowaną i niebezpieczną misję ratunkową, aby uratować znajdujących się w środku ludzi.