赤塚正義幫助了被不良糾纏的男性，在拿到作為謝禮的神秘石頭的瞬間，手掌刻下了不可思議的刺青。次日的上學路上，正義與銀髮少女偶遇，兩人手掌相觸的瞬間產生了電流，少女見狀神態嚴肅。放學途中，正義被早上的銀髮少女襲擊，少女問及“咒紋”一事，但正義並不知情。正義使用祖父傳授的柔術反擊，卻被壓倒性的力量壓制，遭遇性命攸關的危機。

神秘少女伊姬和其搭檔湯姆隸屬美軍，此二人的任務是回收研究者偷出的咒紋，而正義也屬於回收物件。正義的咒紋是“理法吞噬”，若是控制不當使用者本人也會被吞噬。伊姬轉學到正義的班級，勸說正義成為他們的同伴，最終正義同意加入“藍色月亮”小隊。而另一邊，敵人開始了新的計畫。

“藍色月亮”小隊遭遇王國咒紋部隊婆羅門的襲擊，名為伊魯楚彌修的附體系咒紋者，附身在正義的青梅竹馬一之瀨桃子身上。正義暴怒之下對伊魯楚彌修使用“理法吞噬”，卻被桃子阻攔，理法吞噬打偏，吞噬了正義家的房子。桃子的額頭上竟然也有咒紋，她也被捲入了這場戰鬥中。

伊魯楚彌修突襲白薔薇組織的根據地，白薔薇成員被秒殺到僅剩一人。而另一邊，伊姬發現桃子的假咒紋竟然可以發揮咒紋的力量，與此同時她和湯姆收到了白薔薇的求助信號，兩人先後趕往根據地，察覺有事發生的正義緊隨其後。途中伊姬中了拉卡的埋伏而動彈不得，正義的出現扭轉了局面……

伊姬帶兵堵截拉卡和伊魯楚彌修，伊姬對付拉卡，隨後趕到的正義與伊魯楚彌修對戰。面對伊魯楚彌修的咒紋能力，正義陷入苦戰，一旁觀戰的桃子出手相助。眼看桃子命懸一線，正義使用理法吞噬擊敗伊魯楚彌修，此時王國的公主阿耶波多出現，還強吻了正義。而另一邊，伊姬和莉莎聯手滅掉了拉卡。

名叫布拉德的男人將正義帶到阿裡雅巴妲物理研究所，這裡是王國在日本建立的咒紋研究基地，專門進行反咒紋研究。布拉德原本是婆羅門的一員，脫離後的他和王國處於敵對狀態，這次他找來正義是打算徹底毀了這個地方。兩人闖入研究所，遭遇瘋狂科學家卡拉姆和他的天才部隊。

正義跟隨美國的咒紋部隊出動，對公主的基地展開襲擊，主要戰鬥人員有桑達斯準將、王少尉、詹森大尉、雷奧納多巴茲少佐以及莉莎、湯姆和伊姬。沒想到雷奧納剛一出戰，就被擁有“絕對境界”的婆羅門副隊長卡爾·謝卡爾秒殺。公主賜予伊魯楚彌修新的力量，伊魯楚彌修化身野獸，正義等人陷入絕境。

伊姬與卡爾對決陷入苦戰，布拉德救下伊姬，並要她去營救被公主抓走的正義。由於公主的克制能力，正義無法使用理法吞噬，只能任人宰割。巴茲命令眾人撤退，莉莎與他並肩作戰，最終巴茲被化為貓怪的伊魯殺死。另一邊，伊姬眼睜睜看著愛人布拉德被殺，而擔心正義的桃子不顧撤退命令，也被伊魯殺死。

正義體內留存著布拉德的靈魂碎片，通過機器正義看到了布拉德的記憶，他曾臥底於婆羅門的過去。布拉德通過公主的測試，正式加入婆羅門，並被賜予“無鍵之咒紋”。深夜，布拉德計畫潛入聖殿，遇到了打著同樣心思的婆羅門成員瓦爾瑪。瓦爾瑪是國王派來的間諜，他將布拉德拉入這邊的陣營。

正義進入地下深處的遺跡，與宿敵卡爾再次相會。在之前與布拉德的戰鬥中，卡爾的絕對境界的控制回路被破壞，但她因此反而能使用反咒紋了，成了最強的無能力者。正義與卡爾展開激戰，正義詢問卡爾效忠公主的原因，卡爾稱當四把鑰匙將四座遺跡完全開啟，作為素體的公主與姐妹們將精神完全統一，成為所謂的“神”。

公主進化為“神”，並且堅定人類必須滅亡，正義被公主攻擊摔下懸崖，他的想法根本傳達不到，這讓正義充滿無力感。正義的傷口無法癒合，但他仍堅持為同伴報仇，趕到的伊姬和玉城決定對抗公主，由湯姆帶正義避難。遺跡與公主的同化即將完成，世界面臨被吞噬的危機，懷茲曼的計畫開始。