Stardate 44001.4: Kapitein Picard is geassimileerd en veranderd in de Borg Locutus. Riker neemt het commando van de USS Enterprise op zich. En probeert uit alle macht de Aarde te verdedigen tegen een invasie van de Borg.

Stardate 44012.3: Kapitein Picard neemt verlof om op de Aarde te kunnen herstellen van zijn assimilatie door de Borg. De ouders van luitenant Worf brengen wat tijd door met hun zoon op de USS Enterprise.

De USS Enterprise brengt een erg ziek jongetje naar een Federatie basis. Data zet het leven van een kind op het spel als hij een bericht van zijn maker krijgt.

Tijdens een reddingsmissie vindt Picard een jonge menselijke jongen, opgevoed door de aliens die zijn ouders vermoord hebben.

Dr. Crusher twijfelt aan haar geestelijke gezondheid. Als ze ontdekt dat verschillende bemanningsleden van de USS Enterprise verdwijnen.

Een vrachtschip stort neer op Turkana IV en de bemanning wordt gevangen genomen door een afvallige groep. Als de USS Enterprise ze probeert te redden komen ze midden in een burger-oorlog te zitten.

Kapitein Picard wordt gekozen om scheidsrechter te spelen bij de keuze van de nieuwe kanselier van het Klingon rijk. Hij ontdekt wie de vorige kanselier "oneervol" heeft vermoord. Hierbij is ook ambassadeur K'Ehleyr betrokken die een verrassing heeft voor Worf.

Op een morgen wordt William Riker wakker en ontdekt dat het 16 jaar later is. Hij is Kapitein van de USS Enterprise en onderhandelt over een vredesverdrag met de Romulans. Zonder ook maar te weten hoe hij daar is gekomen of weer terug kan keren.

Wesley Crusher gaat samen met kapitein Picard op een missie. Nadat hun shuttle is neergestort op een maan moet Wesley Crusher een gewonde kapitein Picard zorgen.

Deanna verliest haar empathische gaven wanneer de USS Enterprise uit koers getrokken wordt door de zwaartekracht van een zwart gat.

Terwijl de USS Enterprise een Vulcan ambassadeur escorteert, gedraagt deze zich nogal verdacht. En Data probeert de ingewikkelde emotie te begrijpen van Miles O'Brien en Keiko Ishikawa. Deze staan op het punt om te trouwen.

Als chef O'Brien's voormalige commandant, kapitein Benjamin Maxwell, het verkeerde pad opgaat, moet de USS Enterprise een oorlog tussen de Federatie en Cardassian unie voorkomen.

De bemanning moet de planeet Ventax II verdedigen tegen een mythologisch duivel wanneer deze na 1000 jaar opeens verschijnt.

De bemanning van de USS Enterprise wordt wakker als ze blijkbaar door een wormgat gereisd zijn. Data lijkt op de hoogte te zijn van de gebeurtenissen tijdens de reis, maar wil dit niet delen met de rest van de bemanning.

Riker raakt gewond tijdens een undercover missie op de planeet Arkonian die op het punt staat om warp technologie te gaan gebruiken.

La Forge moet samenwerken met Dr. Leah Brahms om het kind van een ruimte wezen te redden. Dit ruimtewezen kind denk dat het schip zijn moeder is.

De bemanning van de USS Enterprise komt vast te zitten in een afgelegen deel van de ruimte. Ze worden langzaam aan krankzinnig. Als ontdekken dat ze niet meer kunnen dromen tijdens hun slaap.

La Forge en een voormalige collega zijn de enige officieren die overgebleven zijn na een verkenningsmissie van vijf jaar terug. De anderen zijn getransformeerd in andere wezens en verdwenen.

Na een ontmoeting met een mysterieuze, buitenaardse sonde, begint luitenant Barclay tekenen van hoge begaafdheid te vertonen.

Na een ongeluk aan boord van de USS Enterprise wordt een Klingon uitwisselingsofficier verdacht van het doorspelen van geheime informatie aan de Romulans.

Lwaxana Troi veroorzaakt problemen als ze ontdekt dat haar geliefde op het punt staat om op rituele wijze zelfmoord te plegen.

Dr. Crusher wordt verliefd op een Trill ambassadeur die aan boord komt van de USS Enterprise om een conflict op te lossen. Ze ontdekt Trill's symbiotische relatie.

Geordi La Forge wordt gevangen genomen door een Romulan schip en gehersenspoeld om een Klingon ambassadeur te doden.

Om de menselijkheid verder te leren kennen gaat Data een relatie aan met Jenna D'Sora. Een nevel zorgt voor rare gebeurtenissen aan boord van de USS Enterprise.

Luitenant Worf moet kiezen tussen de Klingon en de Federatie. Als de nieuwe Klingon kanselier Gowron hem op de hoogte brengt van de burgeroorlog die het Klingon imperium dreigt te vernietigen.