หลังจากเงียบมานานนับศตวรรษ เอนเทอร์ไพรซ์ได้รับข้อความจากระบบชีแลคที่แจ้งว่าพบอาณานิคมมนุษย์

เอนเทอร์ไพรซ์ตอบสัญญาณขอความช่วยเหลือจากรานา โฟร์ ซึ่งเป็นอาณานิคมของสหพันธรัฐที่ถูกยานอวกาศต่างดาวไม่ทราบเผ่าพันธุ์โจมตี

วัฒนธรรมวัลแคนดั้งเดิมยกย่องกัปตันพิการ์ดดุจเทพเจ้า และพร้อมทำการสังเวยเพื่อเป็นเกียรติแก่เขา

หลังจากภารกิจทำให้มีลูกทีมเสียชีวิตพร้อมกับทิ้งลูกชายไว้เบื้องหลัง ทีมเอ็นเตอร์ไพรส์ก็ยังคงมีเรื่องประหลาดใจแสนน่ากลัวรอคอยอยู่

เอนเทอร์ไพรซ์ตรวจพบรหัสสัญญาณวิทยุโบราณจากดาวเคราะห์ โอรีเลียส ไนน์ ที่ล่มสลาย ซึ่งเหลือซากจากสงครามกว่า 1,000 ปีก่อน

ลาฟอร์จถูกปล่อยเกาะบนดาวเคราะห์ที่มีพายุโรคระบาดตามลำพัง ในขณะที่คนอื่นๆ ในทีมต้องเผชิญหน้ากับนักรบโรมูลัน

ขณะที่เอนเทอร์ไพรซ์เป็นเจ้าภาพจัดการเจรจาต่อรองเพื่อควบคุมรูหนอนอวกาศที่เสถียร ทรอยได้สร้างความสัมพันธ์ส่วนตัวกับผู้เจรจาฝ่ายตรงข้าม

เอนเทอร์ไพรซ์ไล่ล่า "ผู้ฉกฉวย" ที่ยังคงปล้นฐานของสหพันธรัฐอย่างต่อเนื่อง โดยไม่รู้ว่าภัยกำลังจะถึงตัว

เมื่อเจ้าหน้าที่ระดับสูงของโรมูลันแปรพักตร์มาเข้ากับสหพันธรัฐ และเตือนให้ทราบถึงการบุกรุกที่จะเกิดขึ้น กัปตันพิการ์ดไม่มั่นใจว่าควรเชื่อเขาหือไม่

การไปตรวจสอบดาวเคราะห์ที่ขอเข้าเป็นสมาชิกสหพันธรัฐ ทำให้ลูกเรือพบกับกลุ่มประชากรที่เคยเป็นทหาร

ขณะไปเยือนดาวเคราะห์แห่งหนึ่งที่กำลังทำสงครามกลางเมือง ดร. ครัชเชอร์ถูกฝ่ายต่อต้านรัฐบาลของดาวเคราะห์นั้นจับเป็นตัวประกัน

แม้กัปตันพิการ์ดจะไม่พอใจแค่ไหน แต่คิวก็มาปรากฏตัวบนยานเอนเทอร์ไพรซ์อีกครั้ง และยังอ้างว่าถูกปลดจากคิว คอนตินัม และถูกถอดอำนาจ

ภรรยาม่ายของ ดร. เนล แอปการ์ นักวิทยาศาสตร์ที่คนยกย่องกล่าวหาไรเกอร์ล่อลวงให้เธอฆ่าสามี

เมื่อเอนเทอร์ไพรซ์-ซี ที่สาบสูญไปนานเข้าสู่มิติเวลาและพื้นที่ของเอนเทอร์ไพรซ์-ดี ประวัติศาสตร์ใหม่ที่แตกต่างทำให้ลูกเรือทะเลาะกับพวกคลิงกอน

เดต้าสร้างแอนดรอยด์ชื่อลัลขึ้นมาด้วยจุดประสงค์ที่ต้องการสานต่องานของผู้สร้างและทำให้เผ่าพันธ์ุของเขาเป็นอมตะ

ผู้บังคับยานชาวคลิงกอนขึ้นยานเอนเทอร์ไพรซ์ในฐานะเจ้าหน้าที่โครงการแลกเปลี่ยนที่ริเริ่มโดยสตาร์ฟลีทท่ามกลางความไม่พอใจของลูกเรือ

กัปตันพิการ์ดถูกลักพาตัวและถูกขังพร้อมมนุษย์ต่างดาวต่างเผ่าพันธุ์ 3 คน ขณะที่ตัวปลอมขึ้นมาบังคับการเอนเทอร์ไพรซ์แทน

หลังจากเป็นผู้ไกล่เกลี่ยในการทำสนธิสัญญา กัปตันพิการ์ดจึงลาพักผ่อน อย่างไรก็ตาม เขาก็ยังถูกขัดจังหวะการพักผ่อนอยู่เรื่อยๆ

คนไข้เก่าของทรอยมาที่เอนเทอร์ไพรซ์เพื่อช่วยติดต่อกับยานต่างดาวที่ดูผิดปกติ ก่อนที่ชาวโรมูลันจะถึงตัวพวกนั้น

สมาชิกขี้อายของยานเอนเทอร์ไพรซ์ติดห้องสามมิติอย่างงอมแงม เพราะความสัมพันธ์เสมือนง่ายกว่าชีวิตจริงมาก

หลังจากลูกเรือนำวัสดุอันตรายมายังเอนเทอร์ไพรซ์ นักสะกลับวางแผนลักพาตัวเดต้าอย่างแยบยล

ท่านทูตซาเรคซึ่งเป็นบุคคลสำคัญของสหพันธรัฐมาเยือนเอนเทอร์ไพรซ์เพื่อสรุปการเจรจาสันติภาพกับเผ่าพันธุ์เลกาแรน

เมื่อแม่ของทรอยปฏิเสธข้อเสนอโดยชาวเฟเรนไกที่ชื่อไดมอน เขาจึงต้องจัดการลักพาตัวทั้งแม่และลูกสาวเอง

เอนเทอร์ไพรซ์พบดาวเคราะห์ร้างและผู้รอดชีวิตเพียงคนเดียวของยานอวกาศที่ตก เขาสูญเสียความทรงจำทั้งหมดแต่มีพลังพิเศษที่สามารถรักษาคนอื่น

หลังตอบสัญญาณขอความช่วยเหลือจากอาณาคมที่ห่างไกลที่สุดแห่งหนึ่งของสหพันธรัฐ เอนเทอร์ไพรซ์มาถึงที่และต้องเผชิญกับศัตรูที่ทรงพลัง