在迪洛斯董事會遭到屠殺的數小時後，伯納與海爾到提洛斯建立的秘密地下實驗室躲避，他們開始尋找被退役的彼得·艾伯納西並尋求外部協助。伯納在逃跑途中頭部意外受傷，皮質液流失導致精神恍惚，在秘密地下實驗室中進行了簡單診斷和修理且未被海爾發覺。迪樂芮發起獵殺生還者的血腥行動，她告訴泰迪她的程式設定讓她所扮演的「迪樂芮」與「懷特」兩者融合，並且為接待員們做了更大的計劃。梅芙召集海特並逼迫賽斯摩來協助她尋找女兒。威廉（黑衣人）不但在大屠殺中生還而且更加興奮了。之後他遇見了幼年版本的羅伯·福特接待員，「小福特」向他表明為威廉準備的遊戲才剛開始，遊戲的名字叫「門」，而這個遊戲結束的地方也是開始的地方。屠殺兩週後，迪洛斯為重掌樂園所派遣的一組以史川德為首的維安部隊在海灘找到了神智不清的伯納，並向其尋求協助以解決樂園的異常。他們的調查行動來到了一個充滿著接待員屍體的「水庫」，伯納喃喃自語，說是他殺死了所有接待員。

在回憶畫面中，阿諾和福特規劃了一場接待員的展示以說服羅根投資西方極樂園，但是阿諾偏愛迪樂芮，以測試為藉口帶她去了自己正在裝修的新家。在威廉去過西方極樂園後，說服了羅根的父親詹姆斯·迪洛斯（也是威廉的岳父）對園區追加投資，並計劃藉接待員來監視遊客，收集遊客信息為提洛斯所用，使得詹姆斯批准買下樂園並稱威廉是他的接班人。威廉在不久後舉辦了盛大的結婚典禮，並讓接待員參與助興。宴會上迪樂芮會見了在角落忿忿不平的羅根，羅根染上了毒癮，並表示威廉的野心必將造就人類的毀滅，之後在她被威廉帶去看一個他在樂園內建築的特別計畫。在當前時間線，迪樂芮殺進樂園的一處維修部門並揭示泰迪其作為接待員的本質。她隨後決定召集美利堅聯盟國陸軍（南方軍）達成她前往「彼端山谷」的目的，因為那裡據信有接待員對抗人類的武器。威廉又一次拯救了勞倫斯，並前往普萊亞招募目前扮演艾爾·勞索的接待員；隨著全面的混亂，艾爾·勞索的「革命」終於成功，他和他的手下在毀滅一切之後陷入了空虛，只知飲酒作樂。威廉挾持艾爾·勞索企圖讓他的手下聽威廉指揮，但是艾爾·勞索似乎被福特附身，指名威廉必須獨力完成遊戲，隨即和他的部下隨後全部舉槍自殺。威廉憤怒而失望，但繼續了他的毀滅「此生最大錯誤」的旅途。

一連串的閃回畫面顯示年輕的威廉與詹姆斯試圖在接待員的身體中重塑詹姆斯的意識以達到永生不死，然而，由於此實驗數十年的不斷失敗使得威廉不願繼續實驗，他覺得永生研究可能一開始就是個錯誤。伯納被克萊曼婷拖到一個位於西方極樂園中獨立區塊的一個山洞，他在那裡找到了她的下屬的愛西·休斯。愛西顯示因為伯納之前襲擊並把她鎖在山洞而憤怒，緊接著發現伯納的接待員身分，並挽救了瀕臨崩潰的伯納。兩人前往探索一座隱藏在山洞中的秘密實驗室，愛西為伯納補充了皮質液。兩人在實驗室內部發現一個以詹姆斯·迪洛斯外貌的發瘋接待員。伯納回想起福特要他取回另外一個接待員與人類混合體的控制元件，但他卻想不起是誰。伯納告訴愛西，福特已經死了，他現在可以自主抉擇，不被人操控，請求她給自己一次機會。愛西答應了。樂園內，威廉與勞倫斯途經勞倫斯的家並發現其家園遭到奎多克與南方軍殘部蹂躪。奎多克依舊計劃前往「榮耀之地」（彼端山谷），在經過威廉指點後挖出村里藏的軍火後更加有恃無恐，殘害其他接待員。威廉最終良心發現，與勞倫斯合力除掉南方軍殘部，奎多克也被炸得粉碎。清晨，福特透過勞倫斯之女的口中警告威廉他做的一件好事並不足以讓他得到救贖。威廉與小鎮居民們向西騎時遇到了逃脫鬼國接待員襲擊並尋找威廉的艾蜜莉，她稱呼威廉為「爸爸」。

在樂園邊境，梅芙一行被逮捕並被送到幕府極樂園中，該地的很多人物照搬了西方極樂園的接待員人格，但氛圍更加血腥暴力。由於園區動盪，無人維護，當地接待員的行為方式逐漸偏離正軌。梅芙一行被帶到一個鄰近小鎮並見到了一扮演與梅芙相同角色的藝妓茜。茜因當地的將軍為了將她旗下最好的舞妓櫻帶走而與其協商。當茜殺死將軍的使者後，將軍派遣忍者綁架櫻並派武士征服小鎮。梅芙在情急之下，學會了不用語音指令控制忍者接待員，並使其自殺。梅芙、茜與賽斯摩三人假扮成中國使節滲透進將軍紮營處拯救櫻，發現將軍接待員頭部受損而不穩定。梅芙一行的假扮被識破，將軍要求茜和櫻在晚上為他跳舞助興。夜晚，將軍居然在眾人面前殺了櫻，茜在悲憤之中殺死了將軍而梅芙無聲地控制將軍武士自相殘殺。在將軍的軍隊殺回營地時，梅芙、茜與賽斯摩各自武裝準備迎戰。同時在西方極樂園，迪樂芮對泰迪產生質疑，她認為泰迪是個正直的人，但他的正直對她來說是個累贅，因此在與他發生性關係後強行改寫了他的程式，使他變得殘忍暴力。

梅芙一行在幫助茜哀悼櫻後經由地下隧道離開，茜與武藏則選擇留下。回到西方極樂園後，梅芙找到了她的女兒，但發現另一個接待員在飾演其母親。鬼國接待員攻擊了他們，其首領阿凱奇塔要求梅芙跟他們走。海爾與史塔伯將彼得帶回台地並發送撤離訊號，使得一群傭兵取代迪洛斯保安小組掌握狀況。迪樂芮與她的人馬使用了塞滿爆裂物的火車炸進台地開路以尋找彼得。伯納與愛西從別處返回台地並發現某物試圖干擾整個園區的安保系統，而干擾的源頭來自「母巢」：母巢則是接待員資料的備份庫。伯納使用接待員介面機將自己直接接入母巢。在母巢中以甜水鎮為藍本的空間內，伯納居然在酒館見到等待他的羅伯·福特，十分震驚。

在閃回畫面中，伯納在接待員的記憶備份中發現了福特的身影，福特揭露西方極樂園其實是個藉由複製人類大腦達到永恆不死的嘗試。福特告訴伯納，伯納是他根據對阿諾的記憶創造的，但是他人格方面的以假亂真則是靠迪樂芮在母巢中反覆測試、打磨並完善的，因為阿諾和迪樂芮相處的時間最長，在迪樂芮那裡留下的記憶最多。但是因為人格過於逼真，伯納繼承了阿諾德善良文弱、優柔寡斷的特質，而這不足以讓他在和人類的鬥爭中生存下來，於是福特侵入了伯納的意識，並隨著他的控制元件離開了母巢。隨後，伯納在福特的指示下支開了愛西，阻斷了園區安保系統的恢復，並對人類保全大開殺戒。迪樂芮的隊伍兵分兩路，一路去爭奪彼得，一路去摧毀母巢。在混戰中，克萊曼婷負傷過多被擊倒，安琪拉雖也受了重傷，但炸掉了母巢，也摧毀了園區人物和故事線的全部備份，而傭兵基本被全殲。迪樂芮找到了被釘在手術臺上的彼得，忍痛剖開他的頭顱，取出控制元件。在樂園內，梅芙與她的女兒在躲藏時遭遇威廉，威廉卻認定她們兩人是福特給他的又一個測試。她策反了威廉的人馬，但在他們殺害威廉之前，經賽斯摩警告而來到現場的迪洛斯安保部隊擊傷了梅芙，在此同時鬼國接待員將其女兒騎馬帶走。安保部隊把賽斯摩和梅芙帶回台地，隨即丟下他們，和其他接待員交戰。而在該處，迪樂芮警告梅芙她的女兒只是控制她的一種手段。屠殺兩週後，史川德、海爾、史塔伯與安東萬發現伯納是接待員並對其審問有關迪樂芮對台地的攻擊行動。經過拷問，伯納透露了彼得的控制元件所在地：彼端山谷。

在鬼國營地中，阿凱奇塔說故事給梅芙的女兒聽。在最初，他和他的族人只被設定成與世無爭的原住民，而他本人被賦予了相當的好奇心。在開園前迪樂芮第一次大屠殺，阿諾殞命後，他無意間看到了迷宮的圖案，從而踏上覺醒的道路。後來福特決定開園，在開園前夕，他和部分族人被加入了嗜血暴力的代碼，並被單獨劃為「鬼國」，以滿足遊客獵奇的需求，但是他的好奇心並沒有被抹殺。有一次他騎馬閒逛，碰巧在園區邊界碰到赤身裸體、神智不清的羅根·迪洛斯，之後的一段時間後他又發現了建設中的「彼端山谷」。他開始發覺他的人生不是真實的，從而決定逃離。他找到他原先的伴侶科哈娜，並想帶她去看彼端山谷的工程，但到那裡時一切已被填埋。在科哈娜被樂園技術人員帶走並退役後，他苦苦尋找，在十年的時間裡踏足西方極樂園園區的各個地方，但是終究沒找到。在這段期間他有意讓自己避開危險不被殺死，從而保留所有記憶。之後他為了去「地下世界」找到妻子，故意被遊客殺死從而被回收。最後他在冷凍室找到了妻子，悲痛欲絕。回到地表後，他決定散播迷宮符號作為警告，這也是為何西方極樂園的部分接待員頭皮內側有迷宮圖案。梅芙被帶去實驗室分析，賽斯摩指出她很獨特，希望能留下她一命，而海爾則發現她的有意識的跟西方極樂園的網路連接。接下來揭曉了梅芙與其女兒一直保持連線狀態，而阿凱奇塔一直在跟她溝通。他告訴梅芙他所率領的突擊隊的目的是保護接待員前往山谷彼端，並懇求她留守後方並在迪樂芮將他們全滅之前完成她的任務。另一邊，身負槍傷的威廉被阿凱奇塔找到，隨後被其帶往「鬼國」營地。艾蜜莉營地找到了威廉，在跟阿凱奇塔表示要折磨威廉之後把威廉帶走了。

艾蜜莉在處理威廉的傷勢時向其詢問茱莉葉為何自殺，在閃回畫面中得知茱莉葉在看過威廉的資訊晶片，了解到他在西方極樂園中種種惡行後絕望自殺。現今，威廉由於逐漸發瘋的關係，基於認定艾蜜莉是福特送過來的接待員的妄想而將其射殺。當威廉發現艾蜜莉手中攥著他的晶片時，發覺自己可能殺死了親女兒，又懷疑自己是接待員，在絕望和恍惚中切開手臂尋找可能的「電線」。在台地中，海爾的人馬決定使用梅芙的代碼改寫克萊曼婷的程式，使她能像梅芙一樣控制其他接待員，使他們自相殘殺。福特為梅芙留下一段訊息，告訴她他會幫助她逃脫，並且解鎖了她的核心權限。伯納與愛西逃出了台地，但福特持續煽動伯納殺死愛西以防她將來背叛伯納。伯納不忍殺死他的同事，將福特從他的思緒刪除並與愛西分道揚鑣，獨自往山谷前進。迪樂芮與泰迪持續她們往山谷的旅程，但泰迪已經覺醒，告訴迪樂芮他無法接受她的行為以及她改寫他程式的方式，在她面前舉槍自殺，使迪樂芮瀕臨崩潰。

梅芙試圖逃離台地並與她的人馬會合，並成功追上了往山谷聚集的接待員群體。期間遭到安保部隊的攔截，賽斯摩犧牲自己，拖延了保安的追擊。海爾一方則放出被改造的克萊曼婷，自己跟在後面，要在山谷把接待員一網打盡。迪樂芮在收拾心情並取出泰迪的心智球後，發現了幾乎瘋癲的威廉，在對他的槍做了手腳後要求他與自己一道奔向山谷。在和伯納會合後，威廉突然襲擊迪樂芮，卻因為手槍炸膛右手被打爛，失去了行動能力。迪樂芮與伯納進入山谷內部實驗室並發現了「鍛造廠」：「母巢」的更先進版本，但是功能在於存儲、分析並模擬遊客的數據。負責鍛造場的人工智慧以羅根的型態出現，並向他們闡明移植人類意識的計劃不成功存在是因為人類行為模式的複雜性被高估：人類的意願和行為經常存在無法解決的矛盾，而且其軌跡走向存在某種模式，用一萬餘行代碼就可以很好地刻畫並預測。「羅根」還說，伯納曾一度監督「彼端山谷」的建設，即創造一個虛擬的人造天堂，把接待員的意識上傳到那裡後他們就不再有痛苦。迪樂芮則在鍛造廠排隊上傳阿凱奇塔等人的心智到鍛造廠中時閱讀了數個遊客資料。迪樂芮態度堅決，認為虛擬的天堂雖然美好，終究不是真實，她要真實的世界，要成為人類的主宰。