Jocelyn se reúne con su familia. Clary y el nuevo jefe del Instituto discrepan en cómo rescatar a Jace de Valentine, quien revela un oscuro secreto.

Valentine tiene una nueva idea para ganarse a Jace, Simon le pide ayuda a magnus y Clary busca el equilibrio entre su vida pasada y la actual.

Con la vida de Alec pendiente de un hilo, Jace trata de salvar a su parabatai mientras enemigos de ambos mundos confabulan contra los guerreros.

Cuando un devastador ataque contra el Instituto deja a los shadowhunters heridos y confusos, Clary recurre a medidas desesperadas para deshacer una tragedia.

Izzy y Clay acuden a una secta guerrera de shadowhunters que podría saber más sobre una misteriosa espada.

Aparece la hermana de Luke y trae discordias entre él y Clary sobre los próximos pasos. Por otra parte, Simon recibe consejos amorosos de alguien inesperado.

Alec planea la ceremonia de runas para su hermano Max, pero la tensión aumenta entre los shadowhunters y conduce a una velada de dolorosas revelaciones.

Clary enfrenta un gran obstáculo y la activación del pacto de sangre de Iris. Mientras tanto, Isabelle y Raphael se acercan cada vez más.

Mientras Valentine ejecuta su plan, los Shadowhunter se movilizan rápidamente para proteger al mundo subterráneo, y la vida de Clary está en peligro.

Los shadowhunters quedan devastados tras el ataque de Valentine al instituto, pero se ven obligados a luchar contra un demonio que amenaza Nueva York.

Mientras Valentine y Magnus intentan escapar de la cárcel, Jace lucha con una nueva identidad, y los shadowhunters enfrentan un posible alzamiento.

La súbita muerte de varios shadowhunters obliga a los líderes del instituto a tomar medidas polémicas para defenderse de una violenta revolución del mundo subterráneo.

Clary, Jace y Simon parten hacia la Corte Seelie para obtener respuestas de la reina de las hadas, mientras Alec prepara un acuerdo de paz con los subterráneos.

Simon despierta sin memoria y bajo sospecha de asesinato, mientras Alec transfiere a Valentine a Idris, y alguien del pasado de Sebastian surge de la nada.

Tras los últimos acontecimientos, a Simon le cuesta observar el Día de Expiación, mientras Clary y Jace viajan a Idris para encontrar a Valentine.

Los shadowhunters se apresuran para encontrar el último de los Instrumentos Mortales, y Clary descubre que su hermano Jonathan está trabajando para Valentine.

Después de un devastador ataque en el Instituto, todo el mundo está en alerta mientras los cazadores de sombras se acercan a la caza deJonathan. Mientras tanto, Simon y Maia ayudan a un nuevo submundo mientras la Reina Seelie exige una respuesta de Magnus y Luke.

Con Valentine y Sebastian sueltos, los del Submundo se unen para hacer una elección sorprendente.

Jace y Clary se apresuran a hacer una posición final, pero cuando un traidor es revelado, Jace y Clary pueden tener una pelea más grande en sus manos de lo esperado. Mientras tanto, Alec y Izzy deben luchar contra una gran masa de demonios que han aparecido inesperadamente, mientras Luke y Simon se dirigen a la Corte Seelie para tratar con un negocio inconcluso con la Reina Seelie.