Ein zentraler Erzählstrang porträtiert Familie Hawkins, deren Familienoberhaupt Joe sich dazu entscheidet, einen Androiden anzuschaffen. Dadurch will er das Familienleben entlasten, denn seine Ehe mit Laura steckt voller Konflikte und seine Kinder entfernen sich von ihm. Der Synth Anita scheint zunächst eine echte Erleichterung zu sein. Sie hilft im Haushalt und kümmert sich auch um die Kinder. In Laura wächst aber nach und nach der Verdacht, dass Anita kein normaler Synth ist – und ihr Verdacht wird sich bewahrheiten!

Laura fühlt sich zusehends von dem Synth Anita bedroht und befürchtet, dass sie ihrer Familie gefährlich werden kann. Hobb fängt Fred, der sich in seiner Angst gegenüber der Menschheit bestätigt fühlt. Der Synth Niska kann flüchten und muss nicht mehr als Sexroboter zur Verfügung stehen. Allerdings sind Karen und Peter immer noch hinter ihr her und kommen näher. Leo bringt sich auf der Suche nach Informationen in Lebensgefahr.

Laura will Anita an den Hersteller zurückzugeben, sie hat mit dieser Forderung ihre gesamte Familie gegen sich. Tom hält die Befürchtungen von Laura für pure Einbildung. Allerdings muss er ihr zugestehen, dass Anita ihm mitunter auch sehr menschlich vorkommt …

Laura erhält in ihrer Ablehnung Unterstützung von Mattie. Sie findet den Synth auch merkwürdig. Durch einen Test finden sie heraus, dass Anita erst 14 Jahre alt ist. Mattie will über den Programmierer Leo mehr über Anita herausfinden. Pete ist gemeinsam mit Simon in einem Haus gefangen und beginnt dort langsam seinen Verstand zu verlieren.

Nach der Nachricht von dem „Killer-Synth“ macht sich unter der Bevölkerung Panik breit. Karen ist weiter auf der Spur von Niska – allerdings weniger aus beruflichen als aus privaten Gründen. Familie Hawkins weiß nun über Anitas Vergangenheit Bescheid, und muss entscheiden, was sie mit ihr machen sollen. Mattie hat nach langem Nachdenken eine Entscheidung getroffen – sie wird Leo folgen und ihm vertrauen.

Familie Hawkins steckt in einer verzweifelten Lage. Joe ist exiliert und die Kinder ertragen die Lügen ihrer Eltern nicht mehr. Laura muss ihnen nun wohl oder übel alles erzählen. Die Wahrheit hat Konsequenzen für Anita. Karen hat endlich den Aufenthaltsort von Niska gefunden.

Karen fühlt sich alleingelassen und fragt George über Niska aus. Pete will nun mit allen Mitteln herausfinden, wer Karen wirklich ist. Das Ergebnis der Recherchen entbehrt nicht einer gewissen Ironie. Die Synths finden Zuflucht bei den Hawkins. Die Jäger sind weiter hinter ihnen her – die Familie ist ihre einzige Unterstützung.

Die Synths befinden sich unter der Kontrolle von Hobb, er will die von ihnen ausgehende Bedrohung für immer auslöschen. Nur ein letztes Puzzleteilchen fehlt ihm, eines – das für ihn undenkbar erscheint. Die Familienmitglieder der Hawkins realisieren, welche Rolle die Synths in ihrem Leben spielen und entschließen sich, gegen den übermächtigen Gegner anzukämpfen.

Die Familie Hawkins versucht, ihr Leben wieder in die richtigen Bahnen zu lenken. Niska ist auf ihrer Flucht in Berlin gelandet. Dort sieht sie sich zu einer Entscheidung gedrängt, die sich als verhängnisvoll entpuppt. Leo, Max und Mia haben währenddessen ein Versteck in der Nähe einer Küstenstadt gefunden. Doch schon bald fühlen sie sich dort von einer mysteriösen Organisation bedroht.

Leo erfährt von Jansen, dass es einen Ort namens „Silo“ gibt, an dem die gejagten Synths gefangen gehalten werden. Mia arbeitet für Ed und versucht ihm zu einem Bankkredit zu verhelfen, da er in finanziellen Schwierigkeiten steckt. Schnell muss er feststellen, dass Mia kein herkömmlicher Roboter ist, denn sie ist in der Lage, Schmerz zu verspüren. Laura Hawkins will Niska dabei unterstützen, eine ordnungsgemäße Verhandlung zu bekommen – einen Prozess, der auch einem Menschen zustünde. Laura und Joe scheinen sich derweil wieder anzunähern. Athena, eine Wissenschaftlerin für künstliche Intelligenz, versucht herauszufinden, was die Anomalien der Synthetics ausgelöst haben.

Laura begleitet Niska zu einer Untersuchung, bei der herausgefunden werden soll, ob sie tatsächlich ein menschliches Bewusstsein hat oder nicht. Dabei zeigt Niska eine Reaktion, die Laura so nicht erwartet hätte. Karen tritt derweil ihren Dienst wieder an und ihre Kollegin Tabitha hat längst herausgefunden, dass sie ein Verhältnis mit Pete hat. Nachdem Ed Mia zunächst rausgeworfen hat, gesteht sie ihm ihre Liebe. Zunächst verstört, wird ihm klar, dass auch er Gefühle für den Synth hegt. Athena reist nach England, um von Professor Hobb mehr über das Bewusstsein der Synths zu erfahren.

Pete versucht, hinter das Geheimnis der „Seraphim“ zu kommen. Aber bei einem fingierten Verkaufstreffen gerät er in eine Falle. Ed, der schon länger in finanziellen Schwierigkeiten steckt, erfährt, dass die nicht bezahlten Pflegekosten für seine Mutter nicht länger aufgeschoben werden können. Währenddessen wird Sophie im Haus der Hawkins von einem Kinderpsychologen begutachtet. Dieser rät Laura, das Mädchen eine Zeit von den Synths fernzuhalten. Niska und Astrid treffen überraschend wieder aufeinander und erst jetzt erfährt Astrid, dass sie sich in einen Synth verliebte. Eines Tages taucht zudem ein fremder Synth bei Laura auf und setzt sie unter Druck, den Fall mit Niska aufzugeben.

Ed und sein Freund Danny haben Mia überwältigt und wollen sie verkaufen. Mia schafft es, sich so zu manipulieren, dass sie wieder zum Synth Anita wird – ohne Bewusstsein. Sophie dagegen verhält sich immer mehr wie ein Synth und ihre Eltern versuchen weiterhin, sie von davon abzubringen. Toby möchte den Synth Renie näher kennenlernen, ist aber ziemlich verstört als sie ihn Erwachsenen-Befugnisse freischalten lässt. Leo und Hester wollen ins Silo eindringen und sie merkt, dass sie immer mehr Gefühle für ihn hat. Mattie konnte eine eigene, schnellere Version des Codes entwickeln, durch den Synths ein Bewusstsein bekommen. Außerdem steht eine Entscheidung in Niskas Fall an.

Athena findet heraus, woran Milo tatsächlich arbeitet: an Kinder-Synths mit Bewusstsein, den sogenannten Seraphim. Mia taucht in Gestalt von Anita plötzlich bei den Hawkins auf. Pete nimmt den Seraph, den er gefunden hat, mit nach Hause und stellt ihn Karen vor. Karen erkennt darin eine Möglichkeit, vielleicht doch eine Art Familienleben mit Pete zu haben. Odi versucht Bedeutung in seinem neuen, bewussten Leben zu finden und entscheidet sich letztendlich, weiter den Menschen zu dienen. Max lernt den erwachten Synth Flash kennen. Gemeinsam wollen sie einen Ort für bewusste Synths gründen, die friedlich leben möchten.

Leo, Hester und Mia wollen weiterhin die eingesperrten Synths mit Bewusstsein befreien. Unterdessen hadert Karen immer noch mit ihrem Dasein als fühlender Synth und sucht Hilfe bei Athena, die ihr dabei helfen soll, sich mehr als Mensch zu fühlen. In Ihrer Verzweiflung bittet Mattie Max um Hilfe. Er willigt ein, mit ihr zu Qualia zu fahren und zu versuchen, Leo zur Vernunft zu bringen. Toby bittet seine Freundin Renie, die wie ein Synth lebt, mit Sophie zu reden. Hier wird ihr klar, dass sie doch kein Leben als Synth führen möchte und sie legt diese Identität wieder ab. Laura kann Niska ausfindig machen, doch sie weigert sich, ihr zu helfen und flüchtet erneut.

Nach den Geschehnissen im Silo will Hester sich an Leo rächen. Währenddessen fällt Karen eine folgeschwere Entscheidung und sie muss feststellen, dass sie und Sam keine Zukunft haben werden. Niska nimmt sich derweil vor, zurück nach Berlin zu kehren. Denn dort hatte alles mit Astrid begonnen, die ihr einfach nicht mehr aus dem Kopf geht. Auf der anderen Seite fällt es ihr aber schwer, ihre Familie erneut vor den Kopf zu stoßen. Schlussendlich konfrontiert Joe Laura mit einer schockierenden Entscheidung, die alles verändert.

Ein Jahr, nachdem die Veröffentlichung des Codes dazu geführt hat, dass alles Synths ein Bewusstsein erlangen, müssen diese nun um ihren Platz in einer Welt kämpfen, in der sie gefürchtet und gehasst werden. Auch Familie Hawkins muss sich in ihrem neuen Leben zurechtfinden, nachdem sich Joe und Laura getrennt haben. Doch am Ende birgt eine erneute Katastrophe Gefahren für das Leben der Menschen ebenso wie das der Synths.

Nachdem die Polizei bei den Synths eingefallen war, muss Max mit den Konsequenzen seiner Taten klarkommen und sich fragen, ob er seiner Führungsposition damit geschadet hat. Mattie steht Leo bei, doch seine Genesung nimmt eine überraschende Wendung. Agnes will eine Kampagne gegen die Menschen starten und bringt Max damit in eine Lage, welche die Beziehung zu seiner Familie zerstören könnte.

Laura ist fest entschlossen, die Wahrheit um die Operation Basswood zu enthüllen und sucht Hilfe bei Dr. Neil Sommer. Doch schließlich nehmen die Dinge einen anderen Lauf als erwartet. Mia hebt ihren Kampf für Integration auf ein anderes Level und zieht in eine Menschen-Stadt. Unterdessen erhält Niska eine mysteriöse Nachricht auf der Jagd nach dem Terroristen. Die Synths-Flüchtlinge, die von Mia gerettet wurden, kommen derweil am Railyard an.

Der langerwartete Besuch der Dryden Commission steht bevor und aus Angst, Agnes könnte den Hass der Menschen weiter schüren, sperrt Max sie weg. Zunächst misstrauisch, zeigen sich die Besucher schließlich doch begeistert von dem Zusammenleben im Railyard. Doch der Erfolg des Besuches ist in Gefahr als Agnes flieht und versucht, Lord Dryden zu attackieren. Max ist gezwungen, sie zu bestrafen, doch was wird er tun?

Sam (Billy Jenkins) versucht mit den Ereignissen in Waltringham zurechtzukommen. Joe (Tom Goodman-Hill) versucht ihm eine Stütze zu sein doch das fällt ihm schwer. Im Bahndepot werden gefährliche Pläne in Gang gebracht.

Stanley und Anatoles (Ukweli Roach) wahre Gesichter bringen Laura (Katherine Parkinson) und ihre Familie in Gefahr. Da Mia (Gemma Chan) in der Kommission spricht, muss Laura alles in ihrer Macht stehende tun um einen furchtbaren Angriff zu verhindern. Leo (Colin Morgan) und Mattie (Lucy Carless) kehren ins Elster Haus zurück und Leo versteht die schmerzhafte Wahrheit doch Matties Geheimnis...

Max (Ivanno Jeremiah) muss einen ehemaligen Freund konfrontieren. Laura (Katherine Parkinson) erholt sich von ihrer herzzerreißenden Entscheidung doch als Mattie (Lucy Carless) ihr Geheimnis offenbart, kommt wieder Leben in Laura. Niskas (Emily Berrington) Reise nimmt eine unerwartete Wendung während Leo (Colin Morgan) sich beeilt, an Max' Seite zu gelangen und sich dadurch in Gefahr begibt.

Laura (Katherine Parkinson) ist in einem Rennen gegen die Zeit um Bosswood zu stoppen. Ihr Ruf steht auf dem Spiel - doch wird sie ihre Familie aufgeben und ihre Freiheit opfern um die Synths zu retten? Unterdessen sieht es aus als wenn Niska (Emily Berrington) das Ende ihrer Reise erreicht hat. Mia (Gemma Chan), Leo (Colin Morgan) und Max (Ivanno Jeremiah) halten im Endkampf zusammen, doch sie...