Nel giorno del vertice del G20, Alex vede dei furgoni bianchi sospetti aggirarsi intorno all’edificio. In un flashback troviamo Alex alla Farm, la struttura di formazione della CIA, sotto copertura per conto dell’FBI per scoprire un’eventuale cellula segreta all’interno della CIA.

Ryan e Raina, tentano di intralciare i piani dei terroristi mescolandosi con gli ostaggi. Alla Farm Alex, Ryan e Raina e gli altri agenti imparano a eludere la sorveglianza.

Alex si nasconde per infiltrarsi nel gruppo terroristico e scopre che non tutti i terroristi sono stranieri. Mentre Miranda è sempre in contatto con il gruppo terroristico. Alla Farm le reclute vengono portate in una foresta per essere valutate, ma la prova non va bene.

I terroristi fanno una richiesta che potrebbe far superare la situazione di stallo in cui si trovano le trattative. Alla Farm le reclute si allenano per tenere sotto controllo il livello di stress e Alex tenta di ottenere informazioni da Owen.

I terroristi si offrono di liberare i circa 1700 ostaggi in cambio di un hacker, Shelby vuole convincere l’FBI a rifiutare lo scambio, ma Miranda ordina di accettarlo. Alla Farm, Harry è sempre più sospettoso di Alex e Ryan ed è determinato a saperne di più sul loro piano.

Lydia fa sapere ad Alex che il gruppo dei terroristi è alla ricerca di un hard driver, l’hacker è necessario per decifrare i dati contenuti in esso. Alla Farm le reclute devono decidere se usare un drone contro un presunto terrorista in base ai dati che gli sono stati forniti. La relazione tra Shelby e Leon fa passi avanti.

Mentre Alex si riunisce con i suoi vecchi compagni, la vice Presidente Claire Hass diventa il nuovo Presidente degli Stati Uniti. Alla Farm le reclute apprendono da Owen le tecniche di interrogatorio avanzate, Shelby va sotto copertura.

Alex e il resto del gruppo provano a distruggere l’arma biologica dei terroristi mentre i militari vogliono irrompere nella zona dove gli ostaggi trattengono i prigionieri. Alla Farm, Lydia e Owen insegnano al gruppo come mentire e tagliare tutti i legami in caso di necessità.

Alex alla sede dell'FBI, viene interrogata da Hannah Wyland per il suo ruolo nella crisi degli ostaggi, più tardi Miranda le rivela di far parte del gruppo di terroristi. Alla Farm le reclute imparano l’arte della seduzione per avvicinare eventuali risorse.

Alex si unisce con Miranda per salvare gli ostaggi, mentre Claire Haas ha un piano per porre fine alla crisi. Alla Farm, Owen insegna alle reclute una lezione sulla necessità del tradimento cercando di convincere il Console venezuelano a rivoltarsi contro il suo paese.

I terroristi cercano di ottenere informazioni dagli ostaggi. Alla Farm, Alex tenta di convincere Owen che nel gruppo c’è un traditore. Alla Farm le reclute devono portare una risorsa fuori dalla Germania.

Gli ostaggi cercano di fuggire attraverso un tunnel per far sì che i terroristi si rivelino. Alla Farm le reclute devono entrare nella NSA per cancellare le loro informazioni personali.

Alex torna nella zona di crisi per far si che il vero traditore all'interno della CIA si esponga. Alla Farm le reclute imparano a prendere le dovute precauzioni nel caso in cui si accorgano che la loro copertura è saltata.

Come conseguenza della crisi degli ostaggi del G20 il Presidente Claire Haas forma una task force clandestina e illegale che riunisce Alex ei suoi amici, sia dall'FBI che dalla CIA, per smascherare una cospirazione globale organizzata da un gruppo definito i Collaboratori.

Mentre Clay, il figlio della Presidente messo a capo della task force, familiarizza con la squadra degli agenti della CIA e dell'FBI, Owen conduce un'indagine sulla diffusione delle notizie finte, ma dare la caccia agli editori di questo tipo di notizie potrebbe avere conseguenze mortali.

Clay è costretto a usare la sua fidanzata e il suo imminente matrimonio per avvicinare Rebecca, uno dei collegamenti usato dal gruppo dei Collaboratori. Alex crea un legame inaspettato mentre Harry si sforza di trovare il suo posto nella task force.

Raina viene incastrata come autrice di un attacco terroristico a un centro commerciale, il fine è far votare alla Camera una legge a favore di un registro della popolazione Mussulmana. Mente la squadra prova a impedire che la legge passi diventa chiaro che il fine dei cospiratori e rimpiazzare la Presidente Haas con Henry Roarke.

Una volta conosciuti i nomi di tutti i Collaboratori, il team utilizza la festa di compleanno di Clay per attirarli in un unico posto sperando di metterli l’uno contro l’altro. Nel frattempo, la decisione di un membro del team mette a rischio la vita di tutti e l’esistenza della stessa task force.

Rischiando il tutto per tutto, Alex lavora con Owen per infiltrarsi nelle file dei Collaboratori. Quando deve provare la sua lealtà, Alex si rende conto che è diventata una pedina nel loro piano per abbattere sia la presidente che la task force.

La squadra scopre uno dei punti fondamentali del piano dei Collaboratori e, grazie all’aiuto di vecchi amici, deve impedire che venga lanciato un attacco terroristico che coinvolge un app installata sugli smartphone di alcuni ignari mussulmani.

La squadra è l’ultima speranza per fermare il piano dei Collaboratori nel corso della Convenzione Costituzionale convocata da Roarke, che vuole introdurre un nuovo emendamento alla Costituzione che minaccia ogni libertà americana.