אלכס מגויסת לקורס הכשרה של הסי-איי-איי. היא מוצאת את עצמה שוב במרכז קנוניה קטלנית שמאיימת על חיי אנשים רבים ברחבי העולם.

הכשרת החניכים החדשים בסי-אי-איי מתחילה. אלכס וריאן מנסים לתמרן בין האימונים, המפגשים וחייהם הפרטיים. בעתיד, ריאן וריינה מנסים לשבש את פעילות הטרוריסטים.

החניכים בחווה לומדים לבצע הערכות מצב ושטח. בעתיד, אלכס מנסה להסתנן במסווה לארגון הטרור ומגלה, לתדהמתה, שחלק מהחברים בו מוכרים לה.

החניכים מקבלים תרגיל שמלמד אותם כיצד לשלוט ברמות הלחץ והמתח שלהם. אלכס מנסה להתקרב לאוואן כדי להשיג יתרון. בעתיד, הטרוריסטים דורשים לבצע חילופי שבויים.

הארי חושד באלכס וריאן והוא נחוש לגלות מה הם זוממים. אוואן מגייס את ליאון למבצע חשאי. בעתיד, מירנדה שולחת את שלבי לחבר ותיק, ואלכס נמלטת מהטרוריסטים.

בחווה, החניכים לומדים כיצד להחליט האם להוציא לפועל תקיפה של מל"ט, מה שגורם לאלכס להיזכר בסיימון. בעתיד, אלכס לא בטוחה אם היא יכולה לבטוח בלידיה.

החניכים בחווה לומדים שיטות חקירה מוגברות. בעתיד, משביעים נשיא חדש ומירנדה נאלצת לקבל החלטה קשה.

בחווה, החניכים לומדים כיצד לשקר לקרוביך, ואיך מנתקים קשרים. בעתיד, אלכס ושותפיה לדרך, מנסים לחפש את הנשק הביולוגי ולהשמידו.

אלכס מקבלת הזדמנות להשתמש באמנות הפיתוי כדי להתקרב אל אוואן. בעתיד, אלכס מקבלת תשובה אפשרית לגבי זהותם של הטרוריסטים ומה הם מחפשים.

אוואן מלמד את החניכים כיצד לגייס סייען. הוא שולח אותם לקונסוליית ונצואלה כדי לשכנע עובד לבגוד במדינתו. בעתיד, אלכס חוברת למירנדה כדי להציל את בני הערובה.

אלכס מנסה לשכנע את אוואן שיש בקרבם בוגד. החניכים לומדים כיצד לחלץ סייען ממדינה זרה. בעתיד, הטרוריסטים משתמשים בשיטה חדשה לחילוץ מידע מבני הערובה.

על החניכים לפרוץ למתקן של סוכנות ביטחון אחרת ולמחוק משם מידע, מבלי להתגלות. בעתיד, אלכס ובני הערובה מתכננים להימלט באופן שיגרום לטרוריסטים להיחשף.

החניכים לומדים מה לעשות אם זהותם תיחשף. מוות מסתורי מוביל את האף-בי-איי לחווה. בעתיד, אלכס מנסה לחשוף את הבוגדים האמיתיים בסי-אי-איי.

בעקבות משבר בני הערובה בג'י-20, הנשיאה האס מרכיבה כוח משימה סודי ובלתי חוקי, הכולל את אלכס וחבריה מהאף-בי-איי והסי-איי-איי, כדי לחשוף קנוניה כלל עולמית.

ראש כוח המשימה החדש פונה אל אוואן, כדי שיעזור לו להכיר את אנשי הצוות. אוואן מוביל את הצוות בחקירה על החדשות המזויפות, אך החיפוש אחר המפרסם עלול להיות מסוכן.

כל חברי הצוות בוחנים מחדש את הקשרים האישיים שלהם. בינתיים, אלכס יוצרת חיבור מפתיע עם סייענית שנמצאת במוקד הקנוניה, והארי מתקשה להשתלב בכוח המשימה.

חברה של אלכס זקוקה לעזרתה, כשמפלילים אותה בפיגוע. הצוות מגלה שהצעד הבא של המשת"פים נועד לעורר פחד כדי להעביר הצעת חוק לרישום מוסלמים בכניסה וביציאה מארה"ב.

לאחר חשיפת זהות כל משתתפי הקנוניה, הצוות מנצל את מסיבת האירוסים של קליי כדי לפתות אחד מהם לבגוד בשותפיו. החלטה של אחד מחברי הצוות מסכנת את חייהם של חבריו.

גם לאחר שנעלמה מכוח המשימה - אלכס מבקשת שוב את עזרתו של אוואן להוכיח למשתתפים בקנוניה את נאמנותה להם, אך מגלה שהיא שימשה בורג בניסיון להדיח את הנשיאה.

לאחר גילוי חדש על התוכנית של השותפים לקנוניה, כוח המשימה נעזר בחברים מן העבר ומנסה לסכל פיגוע שיזמו אותם שותפים.

זה הסיכוי האחרון של הצוות לסכל את המזימה של השותפים לקנוניה בוועידת החוקה, שבה יצביעו על הכנסת תיקון לחוקה שמאיים על חירות האזרח. האם הם יצליחו?