Blindspot parte de una atractiva mujer, sin recuerdos de su pasado, que aparece desnuda en Times Square cubriendo su cuerpo solamente de tatuajes intrincados. Su descubrimiento pone en marcha un gran y complejo misterio que llama inmediatamente la atención del FBI, que comienzan a seguir la hoja de ruta en su cuerpo para revelar una conspiración más amplia de delito y, de esa manera, descubrir la verdad sobre su identidad.

El equipo resuelve un enigmático tatuaje que apunta al sargento Arthur Gibson, un piloto de la Fuerza Aérea con un doloroso pasado y una agenda letal. Jane sigue buscando pistas sobre su identidad y es torturada por destellos de un recuerdo que la obliga a cuestionar su pasado. Mientras tanto, Weller cree conocer la verdadera identidad de Jane.

Un equipo de ladrones casi logra el atraco perfecto, excepto un ladrón - con un tatuaje idéntico al de Jane, que es capturado en la escena del crimen. Mientras tanto, Jane recibe la visita - y una advertencia ambigua -Del misterioso hombre barbudo de su primera memoria, asi como Weller y Mayfair luchan con el papel de Jane en el equipo.

Patterson y su novio experto en rompecabezas, David, descifran una clave de tatuaje que envía el equipo a los centros para el Control de enfermedades (CDC). Mientras que en el CDC, el equipo descubre un mensaje oculto en el cuerpo de Jane que descubre un complot que podría tener consecuencias mundiales catastróficas. Mientras tanto, Jane y Weller se acercan.

Después de que una situación de rehenes aparentemente sencillo resulta tener consecuencias internacionales más profundas, la CIA y el FBI se encuentran compitiendo unos contra otros para aprehender el mismo penal con una historia oscura. Carter expresa su preocupación por la confiabilidad de Jane, causando fricción con Mayfair y pruebas la lealtad de Reade al equipo. La familia de Weller resulta abrumadora para Jane mientras ella lucha con su identidad.

Cuando un asesinato lleva al equipo a una aplicación peligrosa que permite a los delincuentes rastrear vehículos del gobierno, tienen que trabajar con el creador de la aplicación para hacerlos caer. Jane y Weller intentan mantener su relación profesional. Zapata lucha con un problema moral .

Uno de los tatuajes de Jane envía el equipo a un lugar remoto donde se encuentran cara a cara con un peligroso criminal en un caso que pone a prueba la tensa relación entre Jane y Weller y amenaza con exponer los secretos de Mayfair. Mientras tanto, Patterson rompe las reglas para resolver un tatuaje rompecabezas.

Después de que un oficial de policía es asesinado, Patterson descubre un tatuaje inquietante que parece haber predicho su muerte, y el equipo persigue una pista violenta para detener nuevos ataques. Mayfair revela secretos de su pasado a Weller, poniendo a prueba su relación.

Jane y Weller van de incógnito como un par de asesinos de clase mundial para evitar que cierta información caiga en manos equivocadas. La asignación íntima los atrae más cerca que nunca. Mientras tanto, David se embarca en una misión en solitario para recuperar a Patterson, y Carter se enfrenta con Mayfair sobre cómo manejar a un individuo peligroso.

En este emocionante episodio del final de la mitad de la temporada, el equipo tiene que perseguir una llamada que ha activado un espía durmiente. También tendrán que darse prisa para poder parar una serie de asesinatos.

Jane se recupera del impacto que le producen las masivas revelaciones de sus tatuajes y se enfrenta con la posibilidad de confiar en Oscar. Uno de sus tatuajes lleva al equipo a un descubrimiento sorprendente en el Mar Negro.

El equipo expone una trama siniestra. Jane recuerda su propio pasado militar misterioso y contempla una nueva relación con Oscar.

Después de que se revela que hay un topo dentro de la Oficina del FBI en Nueva York, el equipo deberá enfrentarse al examen profundo del inspector Fischer. Los secretos más profundos del equipo están a punto de ser expuestos y todo el mundo es un posible sospechoso pero algunos, especialmente Jane, tienen más cosas para ocultar.

Una llamada anónima lleva al equipo a investigar un caso urgente sobre una muerte, Zapata va encubierto. Después de casi ser descubierta durante la búsqueda del topo, Jane considera dejar el FBI.

Después de que una pintura igual a uno de los tatuajes de Jane es robada de una galería, el equipo descubre que Jane es el verdadero objetivo. 

Después de que un camión blindado es robado, el equipo descubre que los objetos hurtados son armas químicas y tienen que apurarse para frustrar un complot terrorista. Mientras tanto, Jane se enfrenta con un recuerdo confuso de Welle, y Patterson recibe una llamada telefónica de alguien de su pasado.

Después de que Patterson descubre un mensaje oculto en el crucigrama del New York Times, se embarca en una búsqueda de un tatuaje que la conduce hacia el peligro. Oscar finalmente le dice a Jane más acerca de quién era ella, y Weller busca la opinión de su padre acerca de quién pudo haber secuestrado a Taylor Shaw.

Con el fin de capturar a un peligroso criminal internacional, Jane y Weller se ven obligados a colaborar con Rich DotCom. Jane debe decidir si correr el riesgo de hacerle daño a Weller por cumplir con una orden moralmente cuestionable de Oscar.

Cuando se desata un tiroteo en una escuela durante la investigación de un tatuaje, el equipo se divide para acabar con el tirador. Por otro lado, Mayfair hace frente a algunos problemas de su pasado.

Cuando una misteriosa joven con una conexión con un tatuaje cae al cuidado de Borden, él lleva su caso al equipo del FBI - pero sus vínculos con una organización terrorista resultan peligrosos para ellos. Mientras tanto, una conflictiva Jane comienza a acercarse de nuevo a Weller, y una amistad florece entre Borden y Patterson.

Unos hackers criminales se infiltran en el edificio del FBI, atrapando al equipo en el interior. Mientras luchan para encontrar una salida, Mayfair, Zapata, Reade y Sarah hacen frente a sus conflictos personales.

Luego de que un bebé abandonado es encontrado con un tatuaje idéntico a uno de Jane, el equipo se apura para reconstruir la identidad del niño. Jane furiosa se enfrenta a Oscar por el resultado de sus misiones secretas.

Weller busca la verdad en una afirmación desgarradora y confusa. Jane contacta a un ex sospechoso en busca de ayuda con Oscar. Mientras tanto, el resto del equipo lucha para ayudar a un amigo.

Jane es recapturada por la CIA y accede a convertirse en un agente triple.

Weller y sus compañeros de equipo en el FBI, comienzan a investigar el verdadero mapa que son los tatuajes de Jane Doe, arrastrándoles a un submundo de alto riesgo a través de un laberinto de secretos y revelaciones.

Weller y su equipo deben correr contra el tiempo para detener una serie de atentados en New York, mientras Jane es obligada a emprender una misión de asesinato para demostrar su lealtad o sufrir las consecuencias.

Nas y Weller exploran su nueva dinámica como colíderes mientras su equipo caza en la gala de un museo a una asesina que termina albergando un oscuro secreto. En medio de esta misión, Jane descubre el lado más blanco de su antigua organización.

Weller y el equipo deben trabajar con Allie Knight para acabar con un líder de la mafia.

Mientras Weller y Nas persiguen a un informante fugitivo en Bulgaria, Jane va en una misión de Sandstorm con Roman. Reade y Zapata deben hacer frente a un problema urgente.

Rich Dotcom regresa al FBI para pedirles ayuda con un asunto importante.

Jane y Wellner desaparecen así que el equipo intenta descubrir su paradero interrogando a dos criminales que pueden tener información.

Después de que Jane descubre que Sandstorm se está preparando para un ataque inminente, ella arriesga todo para enviar un SOS secreto a su equipo del FBI.

Patterson está desaparecida y un Roman amnésico está en libertad. Jane y Weller deben competir con Shepherd - y el reloj - para encontrarlos antes de que sea demasiado tarde.

Después de que uno de los terroristas más buscados del mundo aparece en New York por razones desconocidas, el equipo debe trabajar con la CIA para detener un bombardeo mortal.

Cuando un tatuaje inusual conduce a Roman, el equipo debe decidir si lo enviará para ir encubierto con una pandilla de motociclistas peligrosos.

El equipo obtiene un dato importante en el caso Sandstorm cuando descubren la verdadera identidad de Shepherd, y una conexión entre ella y Weller.

El equipo debe infiltrarse en una sociedad secreta con el fin de solucionar el enigma de otro tatuaje.

Después de que un conjunto de tatuajes generan múltiples pistas, el equipo se divide en parejas - Weller y Roman; Jane y Zapata; Patterson y Reade - para perseguir a un mensajero peligroso.

With Nas's help, Weller and Jane finally come face-to-face with Nas's inside source within Sandstorm, and square off with an old foe.

Jane y Oliver se encuentran en una situación peligrosa que expone los secretos que ambos ocultaron. Con dudas de si pueden confiar el uno en el otro, la pareja debe permanecer viva mientras Weller y el equipo tratan de salvarlos.

Bajo la investigación de un viejo rival, el equipo lucha por defenderse. Mientras tanto, un tatuaje los lleva a una muerte misteriosa en un hogar adoptivo.

Jane y Weller trabajan encubierto para conseguir unos documentos clasificados. Mientras Shepherd viaja a Tailandia para conseguir un arma peligrosa.

Las transgresiones de Zapata la alcanzan y es enviada a la cárcel junto a una activa de Sandstorm llamada Devon, Weller y el equipo tendrán que hacer lo imposible para ayudarla.

El equipo finalmente obtiene un avance sobre la Fase Dos del plan de Sandstorm.

Mientras el FBI se enfrenta a una tragedia, Weller se encuentra en el centro de un evento sorprendente y Jane se enfrenta a un futuro incierto.

Después de 18 meses separados, el equipo del FBI vuelve a reunirse a causa de una nueva crisis.

Jane ha adquirido nuevos tatuajes y el equipo está intentando adaptarse a la nueva dinámica mientras se enfrentan a un poder extranjero que trata de tomar el control de un satélite.

Jane y Weller se encargarán de perseguir a un grupo de hackers, mientras Rich y Patterson trabajan juntos para ocultar un secreto de su pasado.

Mientras el equipo persigue a un peligroso terrorista que tiene aterrorizada a Manhattan, Jane descubre un desgarrador secreto de su juventud.

Mientras que Jane lucha por hacer frente a un secreto de su pasado, el equipo corre para evitar una crisis internacional.

El equipo va encubierto en un plató de cine para detener un complot terrorista con patrocinadores improbables. Roman chantajea a Weller con un horrible secreto sobre Jane.

Al surgir una amenaza dentro del FBI, el equipo se verá obligado a realizar una operación encubierta desde el apartamento de Jane y Weller. Un tatuaje les lleva a un médico que guarda un secreto mortal.

Mientras el equipo trabaja para derrotar a un enemigo, Jane y Weller se enfrentan a un tóxico secreto que amenaza con destrozar su relación.

Después de algunas luchas personales, el equipo debe encontrar la manera de trabajar juntos para localizar las ojivas nucleares que faltan.

El equipo trabaja para frustrar un complot terrorista mortal con la ayuda de la novia periodista de Reade.

Mientras Jane y Weller se asocian con un hombre misterioso del pasado de Jane para encontrar a una persona desaparecida, el equipo se apresura a detener un trato con las armas.

Weller y su ex compañero del FBI se reúnen para una peligrosa misión encubierta mientras Zapata interroga a un enemigo del pasado.

Una sorprendente visita de Nas lidera al equipo para investigar una peligrosa pieza de tecnología que fue robada de la NSA. Roman y Blake se acercan más cuando asisten a un juego de póquer de alto riesgo.

Cuando la investigación de Patterson sobre un tatuaje resulta en un incidente horrible, ella trata de descubrir qué salió mal, pero rápidamente se da cuenta de que no todo es lo que parece.

El equipo debe decidir si creer a un prisionero que les avisa de un complot. Zapata es capturada por el FBI y la CIA. Roman y Crawford se rompen la cabeza sobre como manejar una situación un tanto inestable.

Una fuente de la CIA amenaza con destrozar al equipo. El lugar de Rich en el FBI es cuestionado. Roman y Crawford pasan un día juntos bajo extrañas circunstancias.

El equipo del FBI y Avery asisten a una gala organizada por su objetivo Hank Crawford con la esperanza de arrestarlo. Roman se acerca más a los Crawford.

El equipo se enfrenta una amenaza mortal, mientras que la lealtad de Román se pone a prueba.

El equipo debe asociarse con un teórico de la conspiración extravagante para evitar que un arma mortal llegue a las manos de Crawford. Mientras tanto, Roman se esfuerza por mantener su vida personal con Blake mientras se enfrenta a una serie de misiones secretas.

Después de recibir noticias sorprendentes sobre el padre de Avery, Jane y Weller deben perseguir a un delincuente escurridizo. Mientras tanto, el padre de Patterson ayuda al equipo en el laboratorio.

Jane se ve obligada a reclutar a alguien de su pasado para ayudar a derribar una alianza peligrosa.

En el final de la temporada tres, Jane y Weller cazan a Roman de vuelta a donde todo comenzó. ¿Podrán detenerlo?

El equipo del FBI caza a un peligroso enemigo operativo pero emerge un nuevo enemigo mortal.

Remi pondrá en peligro la central de inteligencia.

Patterson y Rich DotCom toman las riendas cuando el equipo del FBI se enfrenta una amenaza explosiva.

Un tatuaje pone al equipo en peligro cuando se libera una enfermedad mortal dentro del FBI.

El FBI tendrá que investigar un complot terrorista mortal.

El equipo se ve envuelto en una intriga política peligrosa cuando un tatuaje apunta a alguien del equipo de Matthew Weitz.

Los planes de Remi ponen a Weller y a ella en peligro, mientras Patterson y Rich resuelven un misterioso rompecabezas.

Remi se enfrenta al cada vez peor envenenamiento por ZIP para promulgar su plan definitivo.

La desesperada maniobra del equipo para recuperar a Jane la planta cara a cara con Remi.

Reade se enfrenta con Zapata mientras el equipo sigue la dirección de una posible cura para Jane

La obsesión de un escritor con el equipo los coloca en el punto de mira de un mortífero asesino.

Patterson y Rich se embarcan en una búsqueda del tesoro en Perú para tratar de salvar a Jane.

La escapada romántica de Jane y Weller se interrumpe cuando el equipo debe detener el plan de Madeline Burke de hacer volar un edificio y estrellar lo que resulta ser algo más que un avión de pasajeros.

La aparición de un terrorista provoca que el equipo tenga que investigar un caso de su pasado.

Jane se enfrenta a su pasado mientras el equipo apremia por mantener un arma mortal lejos de las manos de un terrorista.

El FBI continúa pisándole los talones a Madeline Burke, mientras Jane busca la ayuda de un enemigo conocido.

El equipo tiene que trabajar a contrarreloj para salvar a Jane del macabro plan de un asesino.

Bill Nye retoma su papel como el padre de Patterson en un caso que enfrenta al equipo contra un enemigo mortal.

El equipo descubre una conspiración internacional cuando se roba un arma mortal, Jane apoya a Weller cuando alguien de su pasado extrae recuerdos dolorosos, y Patterson y Rich se enfrentan con su cómplice hacker recién liberado.

Un villano horroroso y vengativo amenaza al FBI. Weller considera sus prioridades. Zapata y Reade intentan navegar su situación de vida. Patterson explora un interés en ciernes.

Dominic comienza a poner en práctica el esquema catastrófico de Madeline mientras el equipo se apresura a detenerlo. Las tensiones aumentan a medida que los secretos del pasado comienzan a desvelarse.

El equipo parte en una misión internacional para evitar que un ataque se propague. Madeline intenta reconducir un conflicto interno que amenaza las relaciones entre el equipo.

Tras el ataque a la cabaña de Finlandia, el equipo superviviente decide separarse para garantizar su seguridad. Un mensaje de un supuesto aliado reúne de nuevo al equipo para rescatar a Rich.

Los fugitivos, refugiados en Praga, sienten la constante presión de la caza por parte de Madeline. Jane propone hablar con Weitz para ganarse su apoyo.

La operación de contacto con Weitz fue un fracaso. Sin embargo, ahora el equipo de ex agentes reciben un nuevo mensaje cifrado. Esta vez deberán viajar a Alemania para descubrir de qué se trata.

Patterson consigue acceder a un fichero bloqueado sobre las armas de las que Madeline quiere apropiarse. La pista llevará al equipo a recordar el primer día de Tasha en la oficina.

Jane es herida en un tiroteo y Weller secuestrado por la banda terrorista Dabbur Zann. El equipo luchará por mantener a sus dos compañeros con vida y proteger el búnker.

Ice Cream, regresa para cobrar su deuda, pero el equipo no tiene lo que le prometieron: los cuadros de Gardner. Ice Cream los necesita para saldar una deuda, así que el equipo intenta recuperarlos.

Madeline Burke planea utilizar su ZIP para borrar la vida de las personas y someterlas al poder exclusivo del gobierno. El equipo de Weller tendrá que impedirlo antes de que sea demasiado tarde.

El equipo Weller está a punto de desmantelar toda la trama de Madeline.

Madeline ha capturado al equipo de Weller. Los chicos se encuentran retenidos y bajo custodia en las oficinas del FBI. No tienen muchas alternativas para salvarse y necesitarán toda la ayuda posible.

Parece que el equipo de Weller está cada vez más cerca de recuperar sus antiguas vidas, pero les queda un último eslabón. Deben encontrar las bombas ZIP y detener a Ivy antes de que sea tarde.

Madeline ha muerto, las bombas ZIP han sido confiscadas e Ivy ha escapado del país. Todo parece haberse solucionado. Pero el equipo se da cuenta de que falta una bomba que posiblemente tenga Ivy.