18 maanden na het scheiden van wegen onder mysterieuze omstandigheden, wordt het FBI-team weer bij elkaar gebracht door een nieuwe crisis.

Terwijl het team zich aanpast aan hun nieuwe dynamiek - en de nieuwe tatoeages - vechten ze tegen een gevaarlijke buitenlandse macht die een satelliet probeert te kapen.

Terwijl Jane en Weller een collectief van gevaarlijke computerhackers opsporen, moeten Patterson en Rich Dot Com samenwerken om een ​​explosief geheim van hun verleden te verbergen.

Terwijl het team op een ​​dodelijke bommenwerper jaagt die Manhattan terroriseert, onthult Jane een verpletterend geheim van haar jeugd.

Terwijl Jane worstelt om te gaan met een geheim van haar verleden, racet het team om een ​​internationale crisis te voorkomen.

Het team gaat undercover op een filmset om een ​​terroristisch complot met onwaarschijnlijke geldschieters te stoppen. Roman chanteert Weller met een vreselijk geheim over Jane.

Geconfronteerd met een dreiging binnen de FBI, wordt het team gedwongen om een ​​geheime operatie uit het appartement van Jane en Weller uit te voeren. Een tatoeage leidt naar een arts met een dodelijk geheim.

Terwijl het team samenwerkt om een ​​vijand neer te halen, staan ​​Jane en Weller voor een giftig geheim dat hen uit elkaar dreigt te scheuren.

Na een persoonlijke strijd moet het team een ​​manier vinden om samen te werken om ontbrekende kernkoppen te vinden.

Het team racet om een ​​dodelijk terroristisch complot te dwarsbomen met behulp van de journaliste van Reade.

Terwijl Jane en Weller samenwerken met een mysterieuze man uit het verleden van Jane om een ​​vermist persoon te vinden, racet het team om een ​​wapendeal te stoppen.

Weller en zijn voormalige FBI-partner komen samen voor een gevaarlijke undercovermissie terwijl Zapata een vijand uit het verleden ondervraagt.

Een verrassend bezoek van Nas leidt het team om een ​​gevaarlijk stuk technologie te onderzoeken dat is gestolen van de NSA. Roman en Blake groeien dichter naar elkaar toe als ze deelnemen aan een high-stakes pokerspel.

Wanneer Patterson's onderzoek naar een tatoeage resulteert in een vreselijk incident, probeert ze erachter te komen wat er mis ging, maar beseft al snel dat alles niet is zoals het lijkt.

Het team moet beslissen of zij een gevangene vertrouwen die hen waarschuwt voor een gevaarlijke samenzwering. Zapata zit gevangen tussen de FBI en de CIA. Roman en Crawford stoten zich af over hoe om te gaan met een veranderlijke situatie.

Een CIA-bron dreigt het team uit elkaar te halen. De positie van Rich in de FBI wordt in twijfel getrokken. Roman en Crawford brengen een dag samen door onder vreemde omstandigheden.

Het FBI-team en Avery wonen een gala bij dat wordt georganiseerd door hun doelwit Hank Crawford in de hoop hem te arresteren. Roman groeit dichter naar de Crawfords toe.

Jane en haar team moeten vechten voor hun leven wanneer Roman huurmoordenaars op hun afstuurt. Ondertussen gaat Patterson op een date, Jane en Weller gaan eten, en Zapata woont een begrafenis bij.

Het team moet samenwerken met een excentrieke complottheoreticus om te voorkomen dat Crawford een dodelijk wapen verkrijgt. Roman worstelt met zijn privéleven om Blake te behouden tijdens het voltooien van een reeks geheime missies.

Nadat er schokkend nieuws over Avery's vader bekend is geworden, moeten Jane en Weller een ongrijpbare crimineel opsporen. Pattersons vader help het team in het lab.

Jane wordt gedwongen om iemand vanuit haar verleden te betrekken bij het neerhalen van een gevaarlijke vijand.