Поженившись и переехав в Корлорадо, Джейн с Куртом пытаются жить тихой семейной жизнью, пока однажды на их дом не совершается вооруженное нападение. Оказывается, что убитый террорист оставил после себя наследие в виде крупного вознаграждения за смерть Джейн. Эта новость толкает женщину на отчаянный поступок ради защиты семьи. После 18 месяцев бесплодных поисков супруги Уэллер находит Джейн благодаря помощи таинственного незнакомца. Обнаружив на теле недавно нанесенную новую головоломку, Джейн вскоре узнает, чьих это рук дело...

Команда приступает к разгадке первой татуировки, которая приводит их на место будущего крушения секретного спутника, ответственного за противоракетную защиту. Став свидетелями кражи черного ящика из только что взорвавшегося аппарата, Уэллер с остальными пытаются узнать, кто и зачем это сделал. Роман же делает следующий шаг в своем тайном плане, втираясь в доверие к знакомому по программе для страдающих от ПТСР. Между тем Джейн и Курт узнают друг о друге много нового, Таша раскрывает детали личной жизни Эдгара, а Паттерсон ждет ужасающее открытие.

Расшифровав очередную татуировку, ФБР получает доказательство причастности крупного банкира к недавнему крушению поезда, повлекшему за собой гибель практически всех пассажиров. Тем не менее когда адвокат последнего заявляет, что улики были сфабрикованы некой хакерской группировкой, Джейн с Уэллером начинают поиски ее членов. В то же время Точке-ком с Паттерсон приходится объединиться, чтобы сохранить в тайне секрет их общего прошлого, способный повлиять на их нынешнее положение в обществе.

Паттерсон расшифровывает новую татуировку, устанавливая связь между ней и Маркусом Данном, известным под кличкой Пенсильванский подрывник. Он якобы подорвал себя в 1994 году, но вскоре команда находит улики, указывающие на то, что мужчина еще жив и планирует новый терракт, местоположение которого еще нужно угадать. Между тем Роман вживается в новую роль, Джейн узнает интригующие детали из своего стертого из памяти прошлого, а Запата, установив, что среди расследующих дело есть стукач, вскоре обнаруживает подозреваемого.

Паттерсон развеивает последние сомнения Джейн, демонстрируя ей неопровержимые доказательства произошедшего, и Доу решает во что бы то ни стало разыскать потерянную дочь. Тем временем разгадав скрытое в одной из татуировок послание, ФБР обнаруживает коробку без опознавательных знаков, содержимое которой выводит агентов на заговор. Он напрямую относится к одной из стран Центральной Азии и грозит смертью гражданину Соединенных Штатов. Между тем расследование выводит Запату и Паттерсон на нового, более опасного подозреваемого.

Запата с Паттерсон рассказывают Курту и Джейн об обнаруженных доказательствах насчет шпиона в их рядах и просят Доу еще раз просканировать ее татуировки. Между тем ФБР начинает расследование по делу русской кинокомпании, которая по факту оказывается прикрытием для преступного синдиката, занимающегося продажей оружия и наркотиков. В это же время Рид независимо от коллег находит улики против начальницы, Паттерсон обнаруживает зацепки к местонахождению дочери Джейн, а Роман продолжает реализовывать задуманное, убирая вставших на пути к его цели людей.

Пытаясь найти компромат на шпионку, Паттерсон не без помощи странной подсказки Романа расшифровывает то, над чем бился покойный Стюарт. Вскоре его указание на картину Ван Гога вкупе с дополнительной информацией выводит команду на клинику, где продажная врач, тайно работающая над опасным вирусом с целью наживы, оказывается тесным образом связана с Хёрст. Та, в свою очередь, — с супругом одного из пациентов, ставшим для главы ФБР незаменимым помощником по части незаконных дел. Но удастся ли Уэллеру и остальным добиться официального обвинения для столь хитрой и влиятельной персоны?

Поняв, что попала в западню, Хёрст решает убрать наиболее очевидного противника — Паттерсон, выставляя женщину виновной в убийстве Стюарта. Оставшиеся вне подозрений члены команды начинают операцию по спасению коллеги, параллельно продолжая поиски обличающих босса улик. В то же время последняя разоблачает одного за другим всех, кто задействован в тайном сговоре. Кто же победит в противостоянии — жаждущие отыскать правду союзники, или женщина, чья жизнь висит на волоске? Тем временем Роман наконец встречается с интересующим его человеком, а Уэллер принимает нелегкое решение, чтобы освободиться от оков шантажа.

Расшифровка очередного изображения на коже Джейн выводит ФБР на похитителей ядерных боеголовок и как-то связанного с этим Кроуфорда. Делая все, чтобы раскрыть личности злоумышленников, Рид, Запата и остальные объединяются с ЦРУ и вступают в опасную игру с желающей добиться власти русской террористкой. Тем временем прилетевший в Марракеш Роман сталкивается с управляющим финансами Кроуфорда по имени Виктор. Надеясь избавиться от нового работника, он пытается подставить его при первой же совместной операции. Уэллер же освобождается от оков шантажа, но только чтобы вновь потерять любимую и на этот раз, возможно, навсегда.

Проверяя найденные зацепки, Уэллер обнаруживает, что дочь Джейн не только жива, но и близко знакома с Романом. Доу решает немедленно отправиться на поиски девушки, а присоединившегося к ней Курта ждет неприятная встреча со старым напарником жены, Клемом. Тем временем Паттерсон узнает, что в созданном ею приложении нашлась лазейка, обеспечивающая неизвестным взломщикам доступ к данным всех пользователей. Эта и без того тревожная ситуация становится катастрофической, когда последствия утечки оборачиваются серьезной опасностью, грозящей Нью-Йорку разрушением.

Пока Джейн с Куртом пытаются узнать у Эйвери причину ее сотрудничества с Романом, Паттерсон получает от последнего подсказку, помогающую с расшифровкой татуировок. Сложившиеся детали пазла указывают команде на старого партнера Уэллера, который оказывается информатором АНБ, пытающимся выйти на главу антиправительственной группировки. Тем временем Запата, испытывая на плененной Хёрст новое вещество, узнает о ее связи с ополчением, Виктор раскрывает обман нового помощника босса, а Уэллер присоединяется к бывшему коллеге для помощи в его миссии.

Команда ФБР берется за поиск злоумышленника, ответственного за похищение опасного компьютерного вируса, упоминание о котором оказывается зашифрованным в одной из татуировок Джейн. Однако установление личности похитителя дает мало толку, когда Паттерсон обнаруживает, что тот продал вирус на аукционе. Найдя посредника, заплатившего крупный аванс, члены команды решают взять продавца «на живца», подослав к ней под видом покупателя Рича Точку-ком. Тем временем Блейк находит способ помочь отцу, привлекая для реализации своего плана Романа, Эдгар использует свои связи, чтобы улучшить положение любимой, а Доу наконец решается сделать первые шаги к примирению с дочерью.

Очередной день Паттерсон начинается с неловкой встречи с симпатизирующим женщине доктором наук, а продолжается расследованием гибели солдат, дата смерти которых была зашифрована в одном из рисунков на коже Джейн. Когда в самом разгаре анализа праха погибших Паттерсон оказывается в эпицентре взрыва, ее внезапно отбрасывает на несколько часов назад — в то же самое утро. Слегка изменившиеся события дают агенту возможность выяснить, кто именно стоял за происшествием в лаборатории. Но какую еще загадку должна разгадать криминалист, пока в реальности врачи бьются за ее жизнь?

Прибыв на место крушения самолета ЦРУ, Запата обнаруживает связь произошедшего с информацией, нанесенной на кожу Доу. Между тем Джейн с Марком навещает знакомый с того самого самолета, год назад похищенный Управлением и готовый заключить новую сделку ради возвращения к семье. Узнав от мужчины об остальных заключенных, сбежавших во время аварии, ФБР вскоре вычисляет ответственного за происшествие и раскрывает его планы. Тем временем Роман, сделав все, чтобы принять участие в спасении похищенной Блейк и ее спутника, узнает о хитром плане Кроуфорда по сближению с нужным ему семейством.

Когда Паттерсон раскрывает значение вытатуированной на Джейн стрекозы, Запата решает признаться коллегам о тайной работе вместе с выжившим Борденом. Чудом спасшийся после взрыва он начинает работать на ЦРУ, под прикрытием внедрившись в ячейку сербского террориста и массового убийцы. Однако когда тот убивает своего куратора, агенты решают задержать его для выяснения причин произошедшего. Сотрудничество с задержанным дает ФБР возможность схватить злоумышленника, в то время как Рича вызывают на проверку по делу Хёрст, итоги которой сулят мужчине не лучшее будущее.

ФБР получает наводку на крупную сделку Кроуфорда с грязным бизнесменом по фамилии Брюерс, которая должна состояться на благотворительном приеме Блейк в Хорватии. Чтобы пробраться на закрытое мероприятие, Доу, Запате и Уэллеру приходится воспользоваться помощью Эйвери, имеющей давние связи с нужным им семейством. Однако инициатива девушки едва не ставит операцию под угрозу. Тем не менее встреченный агентами Роман дает им информацию о месте и времени сделки. Но разговоры по душам с сестрой, а позже и с любимой меняют приоритеты мужчины, заставляя его пересмотреть свое отношение к недавним союзникам.

Получив от Романа приказ, киллеры приступают к выполнению задания, в то время, как агенты, так и не достигнув успехов в выслеживании Кроуфорда, решают сделать паузу и продолжить поиски на следующий день. Эдгара между тем ждет откровенный разговор с Миллисент, Уэллер с Джейн получают шанс насладится романтическим ужином, Паттерсон предстоит пережить первое свидание, а Запата вспоминает о покойном друге детства, встреча с сестрой которого заставляет женщину переосмыслить некоторые свои поступки.

Найденное системой совпадение с тату выводит агентов на книгу о теории заговоров, часть которой связана с суперсекретным оружием, предположительно созданным по заказу Кроуфорда для его будущего проекта. Паттерсон, Рид и остальные, при содействии автора книги, бросают все силы на поиски бесследно пропавшего разработчика оружия, ушедшего в подполье. В то же время, Роман начинает лично выслеживать инженера, параллельно пытаясь рассеять подозрения Блейк, не желающей мириться с тайной жизнью возлюбленного.

Несмотря на выведенную из строя программу, Паттерсону удается обнаружить еще одно совпадение. Однако на сей раз не на теле Доу, а на трупе недавно выловленного из моря Драбкина, который, как показывает экспертиза, вовсе не покончил с собой, а был убит. Неожиданная зацепка дает агентам наводку на наемника, деятельность которого указывает на заказчика убийства бизнесмена. Тем временем Эйвери вместе с Джейн отправляются к крестной девушки для подписания страховых бумаг, а помолвка Рида оказывается под вопросом из-за всплывшей правды о Таше.

Узнав о взломе одной из фабрик, Джейн вспоминает о старом плане брата, который когда-то был забракован их матерью и включал в себя создание самовзрывающейся бомбы. Пытаясь выяснить, откуда преступник собирается украсть вторую составляющую, Доу встречается с Шепард, которая поднимает перед женщиной вопрос о нерушимости семейных уз. Между тем Роман начинает воплощать свой план в жизнь, не подозревая, что его уловка вскоре будет разгадана такой же любительницей загадок, как и он сам.

На сей раз Паттерсон получает зашифрованное послание Романа, указывающее на памятное для него с сестрой место. Параллельно агенты решают использовать чувства Блейк, чтобы выйти на ее парня, в то время как Роман начинает воплощать в жизнь план отмщения за свое загубленное детство. Запата тем временем принимает непростое решение ради будущего, а Джейн обнаруживает у себя странные симптомы, которые заставляют команду с удвоенной силой взяться за расшифровку оставшихся неразгаданными изображений на ее теле. Вместе с тем Доу ждет неприятное известие, пришедшее вкупе с утерянными ранее воспоминаниями.