En smuk, nøgen kvinde uden hukommelse bliver fundet på Times Square, med kroppen dækket af mystiske tatoveringer, en af dem er navnet på en FBI-agent.

Mens Jane fortsætter sin søgen efter spor til sin identitet, løser teamet gåden fra en kryptisk tatovering, som fører dem til en jagerpilot med en smertefuld fortid og en dødbringende dagsorden.

Janes SEAL-tatoveringer kobler hende til en kriminel, som kan have ledetråde til hendes fortid. Samtidig får Jane besøg af den mystiske, hårdføre mand fra hendes første minde.

Patterson og hendes kæreste, David, afkoder en tatovering og finder skjulte beskeder, som fører til et katastrofalt globalt plot hos CDC, det nationale center for sygdomskontrol og forebyggelse.

Efter en tilsyneladende enkel gidselsituation løber af sporet, er CIA og FBI i kapløb med hinanden for at fange den samme forbryder med en dyster fortid.

Da en likvidering fører holdet til en farlig app, som giver kriminelle mulighed for at spore regeringens køretøjer, samarbejder teamet med en uventet allieret for at stoppe det farlige software.

En af Janes tatoveringer sender holdet til en afsides beliggende plads, hvor de mister kontakten med FBI-kontoret, og står ansigt til ansigt med en farlig forbryder.

Da Patterson afkoder en skræmmende tatovering, som forudsiger mordet på en politibetjent, jagter teamet et voldeligt spor af ledetråde for at stoppe en serie af politimord.

Jane og Weller går under dække som et snigmorderpar i verdensklasse for at forhindre dødbringende information i at havne i de forkerte hænder. Den intime opgave fører dem tættere sammen end nogensinde før.

Holdet går efter en ring af sovende spioner, som lige er blevet aktiveret, og de skal skynde sig for at stoppe en lang række likvideringer.

Mens Jane er ude af balance efter en række massive afsløringer om hendes tatoveringer og grubler over, om hun kan stole på Oscar, bringer en farlig sag teamet til udlandet.

Efter en sindsforvirret krigsveteran skyder omkring sig på en militærbase, afslører holdet et uhyggeligt plot, mens Jane og Weller må skynde sig for at stoppe en kompromisløs videnskabsmand.

Et tip afslører, at der er en muldvarp i FBI's New York-kontor, og teamet jagter den hemmelige agent, mens de selv underlægges ekstreme kontroller udført af inspektør Fischer.

Mens Jane overvejer at forlade FBI, fører et anonymt tip teamet til at undersøge en presserende sag fra dødsgangen - som ender med at Zapata går undercover.

Et maleri med samme motiv som en af Janes tatoveringer bliver stjålet fra et galleri. Da teamet undersøger sagen, opdager de, at Jane er det egentlige mål. For at beskytte sit team stikker Jane af.

En pansret lastbil bliver udsat for røveri, og teamet opdager, at lasten var kemiske våben, hvilket tvinger dem til at skynde sig for at forhindre et dødbringende terroristangreb.

Patterson opdager en skjult besked i en kryds og tværs, og begiver sig ud på en tatoveringsjagt, som bringer hende i fare. Langt om længe fortæller Oscar Jane mere om, hvem hun var.

Et skoleskyderi bryder ud under efterforskningen af en tatovering, og teamet deler sig for at stoppe skytten. Samtidig skal Mayfair håndtere nogle problemer fra sin fortid.

Da en mystisk pige med forbindelse til en tatovering kommer i Bordens varetægt, tager han hende med til FBI-teamet. Men hendes forbindelse til en terrororganisation bringer dem alle i fare.

Kriminelle hackere infiltrerer bygningen og FBI går i lockdown. Teamet, som nu er låst inden bygningen, konfronterer hinanden med deres personlige konflikter.

En efterladt baby bliver fundet med en tatovering, som er identisk med en af Janes, og teamet arbejder hektisk for at finde frem til babyens identitet og redde flere spædbørn.

Weller søger efter sandheden i en hjerteskærende og overraskende påstand, mens Jane opsøger en tidligere mistænkt for at få hjælp med Oscar.