Na rušném Times Square se najde taška, ze které následně vyleze tajemná žena. Tato Neznámá, nebo také Jane Doe, je celá potetovaná a nepamatuje si absolutně nic o sobě, ani o čemkoliv jiném. Jako by jí někdo vymyl mozek. Není v žádné databázi, její otisky ani DNA nikam nevedou. Na zádech má velkým písmem vytetováno jméno Kurt Weller.

Kurt Weller je agentem FBI a je povolán k vyšetřování případu. Problém je v tom, že Jane nezná jeho a ani on nezná ji, tudíž důvod, proč má na zádech jeho jméno, zůstává stále tajemstvím. Postupem času si Jane začíná vybavovat jisté střípky ze své minulosti. Každé tetování na jejím těle má svůj význam, svůj účel a svůj smysl. Možná vedou k její identitě, možná k něčemu jinému. Nezbývá, než to zjistit.

"Woe Has Joined", název této epizody, je anagramem pro "Who is Jane Doe" (v překladu Kdo je Jane Doe).

Další tetování je spojeno s majorem Arthurem Gibsonem, pilotem, jenž má v úmyslu odhalit tajný dronový program na americké půdě. Jane se mezitím potýká s řadou dalších vzpomínek, kvůli kterým si začne myslet, že před ztrátou paměti byla špatný člověk. Weller přichází s teorií, která by mohla vést k určení identity Jane Doe.

"A Stray Howl", název této epizody, je anagramem pro "Taylor Shaw".

Jane čelí neznámému muži, který se jí vloupal do bytu, jenže než jí stačí sdělit něco kloudného, je zastřelen ostřelovačem v protější budově. Ale zatímco jedna stopě k identitě Jane mizí, objeví se druhá. V nemocnici se ocitá muž, který se podílel na loupežném přepadení a má stejné tetování Navy SEALu, jaké má Jane.

"Eight Slim Grins", název této epizody, je anagramem pro "The Missing Girl" (v překladu Pohřešovaná).

Pattersonová odhalí význam dalšího tetování, které tým zavede do Centra pro kontrolu nemocí. Během dekontaminačního procesu je však odhaleno další, tentokrát ultrafialové tetování, jenž se nachází na Janeině tváři. Jde o sérii čísel, a ta otevřou případ týkající se nebezpečných a smrtelných virů, jejichž kmeny ze CDC záhadně zmizely.

"Bone May Rot", název této epizody, je anagramem pro "Or Maybe Not" (v překladu Nebo možná ne).

Zdánlivě prostá situace s rukojmími se změní v konflikt FBI se CIA. Carter dále zpochybňuje důvěryhodnost Jane, což způsobí svár mezi ním a Mayfairovou. Weller mezitím představuje Jane své rodině, zatímco Jane dále bojuje se svou identitou.

"Split the Law", název této epizody, je anagramem pro "The Past Will" (v překladu Minulost).

Jedna vražda dovede tým k nebezpečnému programu, který zločincům umožňuje sledovat vládní vozidla, a k zastavení aplikace je třeba kontaktovat jejího tvůrce. Jane a Weller se snaží udržet svůj vztah na čistě pracovní úrovni, Zapatová se potýká s dilematem.

"Cede Your Soul", název této epizody, je anagramem pro "Cloud Our Eyes" (v překladu Zatemní nám oči).

Další tetování zavede tým na nebezpečné místo, kde musí čelit nebezpečnému zločinci. Případ způsobí nejen změnu ve vztahu Jane a Wellera, ale také hrozí odhalení tajemství Mayfairové. Pattersonová mezitím poruší pravidla, aby rozluštila další tetování.

"Sent on Tour", název této epizody, je anagramem pro "Trust No One" (v překladu Nevěř nikomu).

Po vraždě policisty Pattersonová rozluští další tetování, které zjevně předpovědělo jeho zabití. Tým se tak vydává po stopách znepokojujícího tetování, aby zabránil dalším útokům. Mayfairová prozradí Wellerovi tajemství ze své minulosti, kvůli čemuž si jejich vztah projde těžkou zkouškou.

"Persecute Envoys", název této epizody, je anagramem pro "Suspect Everyone" (v překladu Podezřívej všechny).

Další rozluštěné tetování vede k webu, na kterém si zločinci pomocí komplexně zašifrovaného jazyka domlouvají své obchody. To je dovede k k jednomu páru, za který se po jejich smrti Weller s Jane vydávají v rámci akce v utajení. Mayfairová a Carter se mezitím dohadují o tom, jak naložit s Guerrerem.

"Authentic Flirt", název této epizody, je anagramem pro "Lift the Curtain" (v překladu Roztáhni oponu).

Pattersonová se vypořádává s vraždou Davida a i přes doporučení vzít si volno a se vším se smířit raději požádá o možnost účasti na vyšetřování. Carter začne být divokou kartou. Vyhrožuje jak Zapatové ohledně jejího odmítnutí poslouchat jeho další příkazy, tak i Mayfairové ohledně Jane. Vše spěje k šokujícímu rozuzlení, které změní celou hru.

"Evil Handmade Instrument", název této epizody, je anagramem pro "And Unveil the Mastermind" (v překladu A odhal génia).

Jane se snaží vypořádat se šokující zprávou, kterou jí sdělil Oscar, ale nebude to vůbec snadné. Navíc po ní Oscar chce, aby mu věřila, jenže Jane si není jistá, jestli to vůbec dokáže. Pattersonová mezitím rozluští další tetování, které tým zavede na ostrov v Černém moři. Skupina teroristů se tam snaží sestrojit zařízení, které by umožnilo vypnutí všech armádních satelitů.

"Cease Forcing Enemy", název této epizody, je anagramem pro "In Case Of Emergency" (v překladu V případě nouze).

Oscar chce, aby Jane vyměnila pero Mayfairové za totožnou repliku, jenže Jane si není jistá, jestli je pero skutečně neškodné. FBI mezitím dostává další případ spojený s jedním z tetování, tentokrát se týká tajného armádního experimentu. Zvláštní je fakt, že několika vojákům byla podána tatáž droga, která Jane vymazala paměť.

"Scientists Hollow Fortune", název této epizody, je anagramem pro "Follow These Instructions" (v překladu Držte se následujících instrukcí).

Anonymní tip odhalí, že v řadách FBI je zrádce, a tým tak musí čelit vyšetřování šéfinspektora Fischera, který hodlá pokračovat ve svém boji o místo Mayfairové. Tajemství všech členů týmu jsou tak rázem v ohrožení a je jen otázkou času, než Fischer zjistí něco, co by neměl.

"Erase Weary Youth", název této epizody, je anagramem pro "Stay Where You Are" (v překladu Zůstaňte na místě).

FBI obdrží anonymní tip, který je spojen s jedním případem trestu smrti, jenž by měl být vykonán velmi brzo. Tým zjistí, že vše vede ke gangu obchodujícímu s lidským masem, a Zapatová se vydává do utajení jako potenciální oběť. Jane mezitím dál odmítá spolupracovat s Oscarem a ten nemá na vybranou a musí jí začít vyhrožovat.

"Rules in Defiance", název této epizody, je anagramem pro "Find a Secure Line" (v překladu Najděte zabezpečenou linku).

Jane dostává za úkol umístit sledovací zařízení do auta svého týmu a přestože tuší, že Oscar má nekalé úmysly, zařízení se jí podaří umístit. Reade se probouzí a neznámý muž mu s pistolí u hlavy vyhrožuje smrtí, pokud nepřestane vyšetřovat Carterovo zmizení. Pattersonová rozluští další tetování, které vede do místní galerie. Tam ovšem čeká bomba.

"Older Cutthroat Canyon", název této epizody, je anagramem pro "To Contact Your Handler" (v překladu Abyste kontaktovali svou spojku).

Dojde k ozbrojenému přepadení auta převážejícího nebezpečný plyn, což tým zavede ke zkorumpovanému generálovi, který plyn prodával nepřátelům státu. Kurtův vztah s Allie pokračuje dobrým směrem, což přiměje jeho sestru, aby se od Kurta odstěhovala. Pattersonová mezitím čelí vzpomínkám na Davida, když obdrží telefonát z restaurace, kam ji chtěl David vzít na jejich jednoleté výročí.

"Any Wounded Thief", název této epizody, je anagramem pro "Find What You Need" (v překladu Najděte, co potřebujete).

Pattersonová se vydává po stopách, které jí zanechal David, přestože ví, že by ji to mohlo dostat do nebezpečí. Dostává se k již rozluštěnému tetování, ale zjistí, že má i druhý význam, proto se ho rozhodne následovat.

"Mans Telepathic Loyal Lookouts", název této epizody, je anagramem pro "In Almost the Last Place You Look" (v překladu Na tom nejvíce nečekaném místě).

Zapatové se podaří rozluštit další tetování, které vede na Hudsonovu univerzitu, kde má tým podle všeho vyšetřit podvod ohledně stipendií. Jakmile však dorazí na kampus, zaslechnou výstřely a celá škola je uzavřena. Tým musí střelce najít, odhalit jejich plán a zatknout je. Každý člen týmu však čelí i svým osobním potížím.

"In the Comet of Us", název této epizody, je anagramem pro "Focus on the Time" (v překladu Soustřeďte se na čas).

Borden konzultuje případ u jedné autistické dívky, která umí kreslit neuvěřitelně detailní nákresy. Mezi nimi je i náčrt tetování, které má Jane na sobě. Po menším průzkumu tým odhalí, že dívka je dcerou vůdce nebezpečné teroristické organizace a že je ve smrtelném nebezpečí.

"Swift Hardhearted Stone", název této epizody, je anagramem pro "Then Wait For The Address" (v překladu Potom počkejte na adresu).

Pobočka FBI je napadena neznámými hackery a musí být uzavřena. Reade a Sarah uvíznou ve výtahu a musí čelit svým potížím, Mayfairová se pustí do jemného výslechu Zapatové a zbytek týmu v čele s Pattersonovou jakožto technickou poradkyní se snaží jak zachránit ostatní, tak i odhalit identitu hackerů.

"Of Whose Uneasy Route", název této epizody, je anagramem pro "To Your New Safehouse" (v překladu K vašemu novému úkrytu).

Jane ovládne vztek, když si uvědomí, že Oscarův plán vedl k zatčení Mayfairové. Tým se mezitím pouští do vyšetřování, které zahrnuje nedávno narozené a opuštěné dítě. Nejen že má tetování podobné tomu, co má Jane, ale má s ní společného mnohem více. Mayfairová se rozhodne uniknout z domácího vězení a zjistit, kdo ji falešně obvinil.

"If Love a Rebel, Death Will Render", název této epizody, je anagramem pro "The Final Order Will Be Revealed" (v překladu Poslední rozkaz bude odhalen).

Jane se marně snaží zjistit, kam zmizel Oscar, proto požádá o pomoc Anu, na jejímž případě tým kdysi pracoval. Weller sdělí Sarah poslední slova jejich otce, a aby celou záležitost s Taylor Shawovou konečně uzavřeli, rozhodnou se zjistit celou pravdu. Reade, Zapatová a Pattersonová mezitím spojí síly, aby zjistili, kam se poděla Mayfairová.

"Why Await Life's End", název této epizody, je anagramem pro "When It's Filed Away" (v překladu Až bude zadán).