Lenny Belardo é o mais novo papa da história e também o primeiro norte-americano. Suas ideias radicais podem mudar a Igreja Católica Romana, mas debaixo de muitas de suas escolhas está uma tristeza muito antiga e uma relação atormentada com a fé.

O Cardeal Secretário de Estado, Voiello está preocupado sobre certas iniciativas do Papa que ameaçam comprometer as relações políticas do Vaticano e o relacionamento com os fiéis.

Lenny mostra que não é fácil de manipular como esperavam que fosse durante o Conclave; Ester, a esposa de um guarda suíço, é a primeira pessoa a entender a mensagem do novo pontífice.

Voiello acredita que a única maneira de parar Lenny é envolver o Papa em um escândalo e chantageia Ester; Lenny continua a disseminar suas ideias provocativas.

Pio XIII permite-se sair do Vaticano na companhia de seu amigo de infância Dussolier; ele se prepara para convocar os cardeais e tentar revolucionar seu conceito de fé.

Nove meses se passaram desde que Lenny se tornou Papa e, pela primeira vez, ele dá uma audiência ao Primeiro Ministro Italiano, que está em choque pelas exigências do pontífice. Lenny ainda decide em começar uma cruzada contra os padres homossexuais.

Dussolier se sente responsável pela morte trágica de um jovem a quem foi negada a oportunidade de se tornar padre porque acreditavam que ele era um homossexual. Lenny começa a pensar que seu papado está destinado a terminar logo.

Pio XIII toma uma decisão surpresa de fazer uma jornada pastoral a África. Ele encontra com a Irmã Antônia, um símbolo muito amado e respeitado do mundo missionário que, entretanto, produz uma reação de forte desconfiança de Lenny.

Em Nova York, Gutierrez não encontra provas para culpar Cardeal Kurtwell pelo abuso sexual que é suspeito. Mas o encontro com uma nova testemunha poderia mudar tudo.

Chega a hora de Lenny encarar seu passado, quando faz uma viagem pastoral a Veneza, a cidade onde ele sempre suspeitou que seus pais estivessem. Ele aparece em público pela primeira vez. Está claro que sua saúde não anda muito bem.